../FusionInspector --fusions test_fusions.list,test_fusions.list2,test_fusions.list3 --genome_lib ${CTAT_GENOME_LIB} --left_fq reads.left.simPE.fq.gz --right reads.right.simPE.fq.gz --out_dir Fusion_Inspector-HISAT_dirty --out_prefix finspector --align_utils HISAT --dirty --prep_for_IGV --no_cleanup
