#NEXUS

BEGIN DATA;
	DIMENSIONS  NTAX =26 NCHAR=621;
	FORMAT DATATYPE = DNa GAP = - MISSING = ?;
	MATRIX
	Orthogeomys_heterodus   		?????????????????????????????AAAAAACCAAAAACCAAAACC-TAAACAAAACCCTGGCATTTGAGTTCTAAGGGTT-TCTAAGAGAACTCAGACACAAGGGAAAAAAATGG-CTGTTTGAAAATGGGCTGCTACCCCTAGTAGGTAGGTACTACCTACTGCCTCAAGGTTTCTAA-TGGTTAATTGAAATACAAATAAAAATTAACCGTAAAATGCTAGGGGAAAGGTCATTAAAAAGGTTT-GGGAAAAA--CATCAGGAATTAGTTCCTGGAAATAGAATTTGGAAGTAAAAATTGCCCTAAATGTTTATTTCAAAGTAGAGAAAGGACTACCAAAATGATTGTTTAATTGCTATTCCAGTTTGTCTGTAGCAATTACAGGCAGGCCCACAGAGAGACAGATGATTCTTATAAGTTTGTCAGATATAACTTTGTCCCTTAATAAGCTCCATGCTTAAGAACTATTTCTACTGACCTCCTTGTTGCTTCCTTGGAGTAAAGTGGCTTTTTG----GACTCATTGGTCTGAGAACTGCTGTTCAAAGCCAGCCTGGGAAGAAAAAGATTCCTGTGAGACTCTCATCTCTATATGGACAGCAGAATA--CTGA

	Thomomys_bottae_awahnee_a 		CCCCAGGACTGGAAAAAAAAA-TTAAAGTT-------AAAAACCAAAACC-AAAACAAAACCCTGTCATTTGATTTCTAAGGGTT-TCTAAGAGAACTCAGACTCAAGGGAAAAAA-TGG-CTGATTTAAAATGGGCCGC-----CTTG-AGGCAC-TAGTACCTAGTGCTTCAAGGTTTCTAA-TGGTTAATTGAAATACAAATGAAAATTAAATGTAAAATGCTAGGGGAAAGGTTATTAAAAAGGTTTTGGGGAAAA-CCATCAGGAATTGGTTCCTGGAAATAGAATTTGGAAGTAAAAATTGCCCTAAATGTTTATTTCAAAGTAGAGAAAGGACTACCAAAATGATTGCTTAATTGCTATTCCAGTTTGTCTGTAGCAATTACAGGCAGGCCCACAGAGGGACAGATGATTCTTATAAGTTTGTCAGATGTTACTTTGTCCCTTAATAAGCTCCATGCTTAGGAACTATTTCTACTGACCTCCTTGTTGCTTCATTGGAGTAAAGTGGCTTTTTGTAAAGACTCATTGGTCTGAGAACTGTT?????????????????????????????????????????????????????????????????????????

	Thomomys_bottae_awahnee_b  		CCCCAGGACTGGAAAAAAAAA-TTAAAGTT-------AAAAACCAAAACC-AAAACAAAACCCTGTCATTTGATTTCTAAGGGTT-TCTAAGAGAACTCAGACTCAAGGGAAAAAA-TGG-CTGATTTAAAATGGGCCGC-----CTTG-AGGCAC-TAGTACCTAGTGCTTCAAGGTTTCTAA-TGGTTAATTGAAATACAAATGAAAATTAAATGTAAAATGCTAGGGGAAAGGTTATTAAAAAGGTTTTGGGGAAAA-CCATCAGGAATTGGTTCCTGGAAATAGAATTTGGAAGTAAAAATTGCCCTAAATGTTTATTTCAAAGTAGAGAAAGGACTACCAAAATGATTGCTTAATTGCTATTCCAGTTTGTCTGTAGCAATTACAGGCAGGCCCACAGAGGGACAGATGATTCTTATAAGTTTGTCAGATGTTACTTTGTCCCTTAATAAGCTCCATGCTTAGGAACTATTTCTACTGACCTCCTTGTTGCTTCATTGGAGTAAAGTGGCTTTTTGTAAAGACTCATTGGTCTGAGAACTGTTGTTCAAAGCCAGCCTGGGAAGAAAAAGATTCCTGTGAGACTCTCATCTCTATACAGACAGCARAATA--CTGA

	Thomomys_bottae_xerophilus  		CCCCAGGACTGGAAAAAAAAAATTAAAGTT-------AAAAACCAAAACC-AAAACAAAACCCTGTCATTTGATTTCTAAGGGTT-TCTAAGAGAACTCAGACTCAAGGGAAAAAAATGG-CTGTTTTAAAATGGGCCGC-----CTTG-AGGCAC-TAGTACCTAGTGCTTCAAGGTTTCTTA-TGGTTAACTGAAATACAAATGAAAATTAAACGTAAAATGCTAGGGGAAAGGTTATTAAAAAGGTTTTGGGGGAAA-CCATCAGGAATTGGTTCCTGGAAATAGAATTTGGAAGTAAAAATTGCCCTAAATGTTTATTTCAAAGTAGAGAAAGGACTACCAAAATGATTGCTTAATTGCTATTCCAGTTTGTCTGTAGCAATTACAGGCAGGCCCACAGAGGGACAGATGATTCTTATAAGTTTGTCAGATGTTACTTTGTCCCTTAATAAGCTCCATGCTTAGGAACTATTTCTACTGACCTCCTTGTTGCTTCATTGGAGTAAAGTGGCTTTTTGTAAAGACTCATTGGTCTGAGAACTGCTGTTCAAAGCCAGCCTGGGAAGAAAAAGATTCCTGTGAGACTCTCATCTCTATATGGACAGCARAATA--CTGA

	Thomomys_bottae_cactophilus  		CCCCAGGCCKGGAAAAAAAAA-TTAAAGTT-------AAAAACCAAAACC-AAAACAAAACCCTGTCATTTGATTTCTAAGGGTT-TCTAAGAGAACTCAGACTCAAGGGAAAAAAATGG-CTGTTTTAAAATGGGCCGC-----CTTG-AGGCAC-TAGTACCTAGTGCTTCAAGGTTTCTTA-TGGTTAACTGAAATACAAATGAAAATTAAACGTAAAATGCTAGGGGAAAGGTTATTAAAAAGGTTTTGGGGGAAA-CCATCAGGAATTGGTTCCTGGAAATAGAATTTGGAAGTAAAAATTGCCCTAAATGTTTATTTCAAAGTAGAGAAAGGACTACCAAAATGATTGCTTAATTGCTATTCCAGTTTGTCTGTAGCAATTACAGGCAGGCCCACAGAGGGACAGATGATTCTTATAAGTTTGTCAGATGTTACTTTGTCCCTTAATAAGCTCCATGCTTAGGAACTATTTCTACTGACCTCCTTGTTGCTTCATTGGAGTAAAGTGGCTTTTTGTAAAGACTCATTGGTCTGAGAACTGCTGTTCAAAGCCAGCCTGGGAAGAAAAAGATTCCTGTGAGACTCTCATCTCTATATGGACAGCAGAATA--CTGA

	Thomomys_bottae_albatus  		CCCTAGGACTGGAAAAAAAA--TTAAAGTTAAAAACCAAAAACCAAAACA-AAAACAAAACCCTGTCATTTGATTTCTAAGGGTT-TCTAAGAGAACTCAGACTCAAGGGAAAAAA-TGG-CTGTTTTAAAATGGGCTGC-----CTTG-AGGCAC-TAGTACCTAGTGCTTCAAGGTTTCTTA-TGGTTAACTGAAATACAAATGAAAATTAAACGTAAAATGCTAGGGGAAAGGTTATTAAAAAGGTTTTGGGGAAAA-CCATCAGGAATTGGTTCCTGGAAATAGAATTTGGAAGTAAAAATTGCCCTAAATGTTTATTTCAAAGTAGAGAAAGGACTACCAAAATGATTGCTTAATTGCTATTCCAGTTTGTCTGTAGCAATTACAGGCAGGCCCACAGAGGGACAGATGATTCTTATAAGTTTGTCAGATGTTACTTTGTCCCTTAATAAGCTCCATGCTTAGGAACTATTTCTACTGACCTCCTTGTTGCTTCATTGGAGTAAAGTGGCTTTTTGTAAAGACTCATTGGCCTGAGAACTGCTGTTCAAAGCCAGCCTGGGAAGAAAAAGATTCCTGTGAGACTCTCATCTCTATATGGACAGCAGAATA--CTGA

	Thomomys_bottae_ruidosae  		CCCTAGGACTGGAAAAAAAA--TTAAAGTTAAAAACCAAAAACCAAAACA-AAAACAAAACCCTGTCATTTGATTTCTAAGGGTT-TCTAAGAGAACTCAGACTCAAGGGAAAAAA-TGG-CTGTTTTAAAATGGGCTGC-----CTTG-AGG-AC-TAGTACCTAGTACTTCAAGGTTTCTTA-TGGTTAACTGAAATACAAATGAAAATTAAACGTAAAATGCTAGGGGAAAGGTTATTAAAAAGGTTTTGGGGAAAA-CCATCAGGAATTGGTTCCTGGAAATAGAATTTGGAAGTAAAAATTGCCCTAAATGTTTATTTCAAAGTAGAGAAAGGACTACCAAAATGATTGCTTAATTGCTATTCCAGTTTGTCTGTAGCAATTACAGGCAGGCCCACAGAGGGACAGATGATTCTTATAAGTTTGTCAGATGTTACTTTGTCCCTTAATAAGCTCCATGCTTAGGAACTATTTCTACTGACCTCCTTGTTGCTTCATTGGAGTAAAGTGGCTTTTTGTAAAGACTCATTGGTCTGAGAACTGCTGTTCAAAGCCAGCCTGGGAAGAAAAAGATTCCTGTGAGACTCTCATCTCTATATGGACAGCAGAATA--CTGA

	Thomomys_bottae_bottae  		?????????TGGAAAAAAAAA-TTAAAGTT-------AAAAACCAAAACC-AAAACAAAACCCTGTCATTTGATTTCTAAGGGTT-TCTAARAGAACTCARACTCAAGGGAAAAAA-TGG-CTGATTTAAAATGGGCCGC-----CTTG-AGGCAC-TAGTACCTAGTGCTTCAAGGTTTCTTM-TGGTTAACTGAAATACAAATGAAAATTAAAYGTAAAATGCTAGGGGAAAGGTTATTAAAAAGGTTTTGGGGGAAA-CCATCAGGAATTGGTTCCTGGAAATAGAATTTGGAAGTAAAAATTGCCCTAAATGTTTATTTCAAAGTAGAGAAAGGACTACCAAAATGATTGCTTAATTGCTATTCCAGTTTGTCTGTAGCAATTACAGGCAGGCCCACAGAGAGACAGATGATTCTTATAAGTTTGTCAGATGTTACTTTGTCCCTTAATAAGCTCCATGCTTAGGAACTATTTCTACTGACCTCCTTGTTGCTTCATTGGAGTAAAGTGGCTTTTTGTAAAGACTCATTGGTCTGARAACTGCTGTTCAAAGCCAGCCTGGGAAGAAAAARATTCCTGTGAGACTCTCATCTCTATATAGACAGCASAATA--CTGA

	Thomomys_bottae_alpinus  		CCCCAGGACTGGAAAAAAAAA-TTAAAGTT-------AAAAACCAAAACC-AAAACAAAACCCTGTCATTTGATTTCTAAGGGTT-TCTAAGAGAACTCAGACTCAAGGGAAAAAA-TGG-CTGATTTAAAATGGGCCGC-----CTTG-AGGCAC-TAGTACCTAGTGCTTCAAGGTTTCTTA-TGGTTAACTGAAATACAAATGAAAATTAAATGTAAAATGCTAGGGGAAAGGTTATTAAAAAGGTTTTGGGGGAAA-CCATCAGGAATTGGTTCCTGGAAATAGAATTTGGAAGTAAAAATTGCCCTAAATGTTTATTTCAAAGTAGAGAAAGGACTACCAAAATGATTGCTTAATTGCTATTCCAGTTTGTCTGTAGCAATTACAGGCAGGCCCACAGAGAGACAGATGATTCTTATAAGTTTGTCAGATGTTACTTTGTCCCTTAATAAGCTCCATGCTTAGGAACTATTTCTACTGACCTCCTTGTTGCTTCATTGGAGTAAAGTGGCTTTTTGTAAAGACTCATTGGTCTGAGAACTGCTGTTCAAAGCCAGCCTGGGAAGAAAAAGATTCCTGTGAGACTCTCATCTCTATATAGACAGCAGAATA--CTGA

	Thomomys_bottae_riparius  		CCGTAGGACTGGAAAAAAAA--TTAAAGTTAAAAACCAAAAACCAAAACCCAAAACAAAACCCTGTCATTTGATTTCTAAGGGTT-TCTAAGAGAACTCAGACTCAAGGGAAAAAA-TGG-CTGTTTTAAAATGGGCTGC-----CTTG-AGGCAC-TAGTACCTAGTGCTTCAAGGTTTCTTA-TGGTTAACTGAAATACAAATGAAAATTAAACGTAAAATGCTAGGGGAAAGGTTATTAAAAAGGTTTTGGGGAAAA-CCATCAGGAATTGGTTCCTGGAAATAGAATTTGGAAGTAAAAATTGCCCTAAATGTTTATTTCAAAGTAGAGAAAGGACTACCAAAATGATTGCTTAATTGCTATTCCAGTTTGTCTGTAGCAATTACAGGCAGGCCCACAGAGGGACAGATGATTCTTATAAGTTTGTCAGATGTTACTTTGTCCCTTAATAAGCTCCATGCTTAGGAACTATTTCTACTGACCTCCTTGTTGCTTCATTGGAGTAAAGTGGCTTTTTGTAAAGACTCATTGGTCTGAGAACTGCTGTTCAAAGCCAGCCTGGGAAGAAAAAGATTCCTGTGAGACTCTCATCTCTATATGGACAGCAGAATA--CTGA

	Thomomys_bottae_mewa  			CCCTAGGRCTGGAAAAAAAA--TTAAAGTTAAAAACCAAAAACCAAAACC-AAAACAAAACCCTGTCATTTGATTTCTAAGGGTT-TCTAAGAGAACTCAGACTCAAGGGAAAAAA-TGG-CTGTTTTAAAATGGGCCGC-----CTTG-AGACAC-TAGTACATAGTGCTTCAARGTTTCTAA-TGGTTAATTGAAATACAAATGAAAATTAAACRTAAAATGCTAGGGGAAAGGTTATTAAAAAGGTTTTGGGGGAAAACCATCAGGAATTGGTTCCTGGAAATAGAATTTGGAAGTAAAAATTGCCCTAAATGTTTATTTCAAAGTAGAGAAAGGACTACCAAAATGATTGCTTAATTGCTATTCCAGTTTGTCTGTAGCAATTACAGGCAGGCCCACAGAGAGACAGATGATTCTTATAAGTTTGTCAGATGTTACTTTGTCCCTTAATAAGCTCCATGCTTAGGAACTATTTCTACTGACCTCCTTGTTGCTTCATTGGAGTAAAGTGGCTTTTTGTAAAGACTCATTGGTCTGAGAACTGCTGTTCAAAGCCAGCCTGGGAAGAAAAAGATTCCTGTGAGACTCTCATCTCTATATGGACAGCAGAATA--CTGA

	Thomomys_bottae_saxatilis  		CCCCAGGACTAGAAAAAAAAA-TTAAAGTT-------AAAAACCCAAACC-AAAACAAAACCCTGTCATTTGATTTCTAAGGGTT-TCTAAGAGAACTCAGACTCAAGGGAAAAAA-TGG-CTGATTTAAAATGGGCCAC-----CTTG-AGGCAC-TAGTACCTAGTGCTTCAAGGTTTCTTA-TGGTTAACTGAAATACAAATGAAAATTAAACGTAAAATGCTAGGGTAAAGGTTATTAAAAAGGTTTTGGGGGAAA-CCATCAGGAATTGGTTCCTGGAAATAGAATTTGGAAGTAAAAATTGCCCTAAATGTTTATTTCAAAGTAGAGAAAGGACTACCAAAATGATTGCTTAATTGCTATTCCAGTTTGTCTGTAGCAATTACAGGCAGGCCCACAGAGAGACAGATGATTCTTATAAGTTTGTCAGATGTTACTTTGTCCCTTAATAAGCTCCATGCTTAGGAACTATTTCTACTGACCTCCTTGTTGTTTCATTGGAGTAAAGTGGCTTTTTGTAAAGACTCATTGGTCTGAGAACTGCTGTTCAAAGCCAGCCTGGGAAGAAAAAGATTCCTGTGAGACTCTCATCTCTATATGGACAGCAGAATA--CTGA

	Thomomys_bottae_laticeps  		CCCCAGGACTGGAAAAAAAA--TTAAAGTT-------AAAAACCAAAACC-AAAACAAAACCCTGTCATTTGATTTCTAAGGGTT-TCTAAGAGAACTCAGACTCAAGGGAAAAAA-TGG-CTGATTTAAAATGGGCCGC-----CTTG-AGGCAC-TAGTACCTAGTGCTTCAAGGTTTCTTA-TGGTTAACTGAAATACAAATGAAAATTAAACGTAAAATGCTAGGGGAAAGGTTATTAAAAAGGTTTTGGGGGAAA-CCATCAGGAATTGGTTCCTGGAAATAGAATTTGGAAGTAAAAATTGCCCTAAATGTTTATTTCAAAGTAGAGAAAGGACTACCAAAATGATTGCTTAATTGCTATTCCAGTTTGTCTGTAGCAATTACAGGCAGGCCCACAGAGAGACAGATGATTCTTATAAGTTTGTCAGATGTTACTTTGTCCCTTAATAAGCTCCATGCTTAGGAACTATTTCTACTGACCTCCTTGTTGCTTCATTGGAGTAAAGTGGCTTTTTGTAAAGACTCATTGGTCTGAGAACTGCTGTTCAAAGCCAGCCTGGGAAGAAAAAGATTCCTGTGAGACTCTCATCTCTATATGGACAGCAGAATA--CTGA

	Thomomys_talpoides_ocius   		CCCCAGGACTGGAAAAAAAAA-TTAAAGTTAAAAACCAAAAACCAGAACC-AAAACAAAACCCTGTCATTTGATTTCTAARGGTT-TTTAAGAGAACTCAGACTCAAGGGAAAATA-TGG-CTGTTTGAAAAAGGGGCGC-----CTTG-AGGCAA-TAATA----GTGCCTCAAGGTTTCTAA-TGGTTAATTGAAATTCAAATGAAAATTAAACATAAAATGCTAGGGGAAAGGTCATTAAAAAGGTTTTGGRAAAAA-CCATCAGGAATTGGTTCCTGGAATTAGAATTTGGAAGTAAAAATTGCCCTAAATGTTTATTTCAAAGTAGAGAGAGGACTACCAAAATGATTGCTTAATTGCTATTCCAGTTTGTCTGTAGCAATTACAGGCAGGCCCACAGAGAGACAGATGATTCTTATAAGTTTGTCAGATGTTACTTTGTCCCTTAATAAGCTCCATGCTTAGGAACTATTTCTACTGACCTCCTTGTTGCTTCATTGGAGTAAAGTGGCTTTTTGTAAAGACTCATTGGTCTGAGAACTGCTGTTCCAAGCCAGCCTGGGAAGAAAAAGATTCCTGTGAGACTCTCATCTCTATATGGACAGCAGAATA--CTGG

	Thomomys_idahoensis_pygmaeus_a   	CCCCAGGACTGGAAAAAAAA--TTAAAGTTAAAAWCCAAAAACCAAAACC-AAAACAAGACCCTGTCATTTGATTTCTAAGGGTT-TTTAAGAGAACTCAGACTCAAGGGAAAATA-TGG-CTGTTTGAAAAAGGGGTGC-----TTTG-AGGCAA-TAATA----GTGCCTCAAGGTTTCTAA-TGGTTAATTGAAATTCAAATGAAAATTAAACATAAAATGCTAGGGGAAAGGTCATTAAAAAGGTTTTGGGAAAAA-CCATCAGGAATTGGTTCCTGGAATTAGAATTTGGAAGTAAAAATTTCCCTATATGTTTATTTCAAAGTAGAGAGAGGACTACCAAAATGATTGCTTAATTGCTATTCCAGTTTGTCTGTAGCAATTACAGGCAGGCCCACAGAGAGACAGATGATTCTTATAAGTTTGTCAGATGTTACTTTGTCCCTTAATAAGCTCCATGCTTAGGAACTATTTCTACTGACCTCCTTGTTGCTTCATTGGAGTAAAGTGGCTTTTTATAAAGACTCATTGGTCTGAGAACTGCTGTTCGAAGCCAGCCTGGGAAGAAAAAGATTCCTGTGAGACTCTCATCTCTATATGGACAGCAGAATA--CTGG

	Thomomys_idahoensis_pygmaeus_b   	CCCCAGGACTGGAAAAAAAA--TTAAAGTTAAAAACCAAAAACCAAAACC-AAAACAAAACCCTGTCATTTGATTTCTAAGGGTT-TTTAAGAGAACTCAGACTCAAGGGAAAATA-TGG-CTGTTTGAAAAAGGGGTGC-----TTTG-AGGCAA-TAATA----GTGCCTCAAGGTTTCTAA-TGGTTAATTGAAATTCAAATGAAAATTAAACATAAAATGCTAGGGGAAAGGTCATTAAAAAGGTTTTGGGAAAAA-CCATCAGGAATTGGTTCCTGGAATTAGAATTTGGAAGTAAAAATTTCCCTAAATGTTTATTTCAAAGTAGAGAGAGGACTACCAAAATGATTGCTTAATTGCTATTCCAGTTTGTCTGTAGCAATTACAGGCAGGCCCACAGAGAGACAGATGATTCTTATAAGTTTGTCAGATGTTACTTTGTCCCTTAATAAGCTCCATGCTTAGGAACTATTTCTACTGACCTCCTTGTTGCTTCATTGGAGTAAAGTGGCTTTTTATAAAGACTCATTGGTCTGAAAACTGCTGTTCGAAGCCAGCCTGGGAAGAAAAAGATTCCTGTGAGACTCTCATCTCTATATGGACAGCAGAATA--CTGG

	Thomomys_mazama_mazama   		??????????GGAAAAAAAA--TTAAAGTTAAAAACCAAAAACCAAAACC-AAAACAAAACCCTGTCATTTGATTTCTAAGTGTTGTTTAAGAGAACTCAGACTCAAGGGAAAATA-TGGGCTGTTTGAAAAAGGGGCGC-----CTTG-AGGCAA-TAATA----G-GCCTCAAGCTTTCTAA-TGGTTAATTGAAATTCAAATGAAAATTAAACATAAAATGCTAGGGGAAAGGTCATTAAAAAGGTTTTGGGAAAAA-CCATCAGGAATTGGTTCCTGGAATTAGAATTTGGAAGTAAAAATTGCCCTAAATGTTTATTTCAAAGTAGAGAGAGGACTACCAAAATGATTGCTTAATTGCTATTCCAGTTTGTCTGTAGCAATTACAGGCAGGCCCACAGAGAGACAGATGATTCTTATAAGTTKGTCAGATGTTACTTTGTCCCTTAATAAGCTCCATGCTTAGGAACTATTTCTACTGACCTCCTTGTTGCTTCATTGGAGTAAAGTGGCTTTTTGTAAAGACTCATTGGTCTGAGAACGGCTGTTCGAAGCCAGCCTGGGAAGAAAAAGATTCC?????????????????????????????????????????

	Thomomys_mazama_nasicus   		CCCCAGGACTGGAAAAAAA---TTAAAGTTAAAAACCAAAAACCAAAACC-AAAACAAAACCCTGTCATTTGATTTCTAAGGGTT-TTTAAGAGAACTCAGACTCAAGGGAAAATA-TGG-CTGTTTGAAAAAGGGGCGC-----CTTG-AGGCAA-TAATA----GTGCCTCAAGGTTTCTAA-TGGTTAATTGAAATTCAAATGAAAATTAAACATAAAATGCTAGGGGAAAGGTCATTAAAAAGGTTTTGGGAAAAA-CCATCAGGAATTGGTTCCTGGAATTAGAATTTGGAAGTAAAAATTGCCCTAAATGTTTATTTCAAAGTAGAGAGAGGACTACCAAAATGATTGCTTAATTGCTATTCCAGTTTGTCTGTAGCAATTACAGGCAGGCCCACAGAGAGACAGATGATTCTTATAAGTTTGTCAGATGTTACTTTGTCCCTTAATAAGCTCCATGCTTAGGAACTATTTCTACTGACCTCCTTGTTGCTTCATTGGAGTAAAGTGGCTTTTTGTAAAGACTCATTGGTCTGAGAACTGCTGTTCGAAGCCAGCCTGGGAAGAAAAAGATTCCTGTGAGACTCTCATCTCTAT?????????????????????

	Thomomys_monticola_a   			CCCGAGGACTGGAAAAAAAA--TTAAAGTTAAAAACCAAAAACCAAAACC-AAAACCAAACCCTGTCATTTGATTTCTAAGGGTT-TTTAAGAGAACTCAGA---------AAATA-TGG-CTGTTTGAAAAAGGGGCGC-----CTTG-AGGCAA-TAATA----GTGCCTCAAGGTTTCTAA-TGGTTAATTGAAATTCAAATGAAAATTAAACATAAAATGCTAGGGGAAAGGTCATTAAAAAGGTTTTRGGAAAAA-CCATCAGGAATTGGTTCCTGGAATTAGAATTTGGAAGTAAAAATTGCCCTAAATGTTTATTTCAAAGTAGAGAGAGGACTACCAAAATGATTGCTTAATTGCTATTCCAGTTTGTCTGTAGCAATTACAGGCAGGCCCACAGAGAGACAGATGATTCTTATAAGTTTGTCAGATGTTACTTTGTCCCTTAATAAGCTCCATGCTTAGGAACTATTTCTACTGACCTCCTTGTTGCTTCATTGGAGTAAAGTGGCTTTTTGTAAAGACTCATTGGTCTGAGAACTGCTGTTCGAAGCCAGCCTGGGAAGAAAAAGATTCCTGTGAGACTCTCATCTCTATATGGACAGCAGAATA--CTGG

	Thomomys_monticola_b   			CCCGAGGACTGGAAAAAAAA--TTAAAGTTAAAAACCAAAAACCAAAACC-AAAACAAAACCCTGTCATTTGATTTCTAAGGGTT-TTTAAGAGAACTCAGACTCAAGGGAAAATA-TGG-CTGTTTGAAAAAGGGGCGC-----CTTG-AGGCAA-TAATA----GTGCCTCAAGGTTTCTAA-TGGTTAATTGAAATTCAAATGAAAATTAAACATAAAATGCTAGGGGAAAGGTCATTAAAAAGGTTTTGGGAAAAA-CCATCAGGAATTGGTTCCTGGAATTAGAATTTGGAAGTAAAAATTGCCCTAAATGTTTATTTCAAAGTAGAGAGAGGACTACCAAAATGATTGCTTAATTGCTATTCCAGTTTGTCTGTAGCAATTACAGGCAGGCCCACAGAGAGACAGATGATTCTTATAAGTTTGTCAGATGTTACTTTGTCCCTTAATAAGCTCCATGCTTAGGAACTATTTCTACTGACCTCCTTGTTGCTTCATTGGAGTAAAGTGGCTTTTTGTAAAGACTCATTGGTCTGAGAACTGCTGTTCGAAGCCAGCCTGGGAAGAAAAAGATTCCTGTGAGACTCTC-----TATATGGACAGCAGAATA--CTGG

	Thomomys_talpoides_yakimensis   	CCCCAGGACTGGAAAAAAA---TTAAAGTTAAAAACCAAAAACCAA------------AACCCTGTCATTTGATTTCTAAGGGTT-TTTAAGAGAACTCAGACTCAAGGGAAAATA-TGG-CTGTTTGAAAAAGGGGTGC-----CTTG-AGGCAA-TAATA----GTGCCTCAAGGTTTCTAA-TGGTTAATTGAAATTCAAATGAAAATTAAACATAAAATGCTAGGGGAAAGGTCATTAAAAAGGTTTTGGGAAAAA-CCATCAGGAATTGGTTCCTGGAATTAGAATTTGGAAGTAAAAATTGCCCTAAATGTTTATTTCGAAGTAGAGAGAGGACTACCAAAATGATTGCTTAATTGCTATTGCAGTTTGTCTGTAGCAATTACAGGCAGGCCCACAGAGAGACAGATGATTCTTATAAGTTTGTCAGATGTTACTTTGTCCCTTAATAAGCTCCATGCTTAGGAACTATTTCTACGGACCTCCTTGTTGCTTCATTGGAGTAAAGTGGCTTTTTGTAAAGACTCATTGGTCTGAGAACTGCTGTTCGAAGCCAGCCTGGGAAGAAAAAGATTCCTGTGAG-CTCTC--G??????????????????????????

	Thomomys_talpoides_bridgeri   		?????????????????????????????????????AAAAACCAAAACC-AAAACAAAACCCTGTCATTTGATTTCTAAGGGTT-TTTAAGAGAACTCAGACTCAAGGGAAAATA-TGG-CTGTTTGAAAAAGGGGCGC-----CTTG-AGGCAA-TAATA----GTGCCTCAAGGTTTCTAA-TGGTTAATTGAAATTCAAATGAAAATTAAACATAAAATGCTAGGGGAAAGGTCATTTAAAAGGTTTTGGGAAAAA-CCATCAGGAATTGGTTCCTGGAATTAGAATTTGGAAGTAAAAATTGCCCTAAATGTTTATTTCAAAGTAGAGAGAGGACTACCAAAATGATTGCTTAATTGCTATTCCAGTTTGTCTGTAGCAATTACAGGCAGGCCCACAGAGAGACAGATGATTCTTATAAGTTTGTCAGATGTTACTTTGTCCCTTAATAAGCTCCATGCTTAGGAACTATTTCTACTGACCTCCTTGTTGCTTCATTGGAGTAAAGTGGCTTTTTGTAAAGACTCATTGGTCTGAGAACTGCTGTTCGAAGCCAGCCTGGGAAGAAAAAGATTCCTGTGAGACTCTCATCTCTATATGGACAGCAGAATA--CTGG

	Thomomys_townsendii_townsendii   	CCCCAGGACTGGAAAAAAAAA-TTAAAGTT-------AAAAACCAAAACC-AAAACAAAACCCTGTCATTTGATTTCTAAGGGTT-TCTAAGAGAACTCAGACTCAAGGGAAAAAA-TGG-CTGATTTAAAATGGGCCGC-----CTTG-AGGCAC-TAGTACCTAGTGCTTCAAGGTTTCTTA-TGGTTAACTGAAATACAAATGAAAATTAAACGTAAAATGCTAGGGGAAAGGTTATTAAAAAGGTTTTGGGGGAAA-CTATCAGGAATTGGTTCCTGGAAATAGAATTTGGAAGTAAAAATTGCCCTAAATGTTTATTTCAAAGTAGAGAAAGGACTACCAAAATGATTGCTTAATTGCTATTCCAGTTTGTCTGTAGCAATTACAGGCAG----------------ATGATTCTTATAAGTTTGTCAGATGTTACTTTGTCCCTTAATAAGCTCCATGCTTAGGAACTATTTCTACTGACCTCCTTGTTGCTTCATTGGAGTAAAGTGGCTTTTTGTAAAGACTCATTGGTCTGAGAACTGCTGTTCAAAGCCAGCCTGGGAAGAAAAAGATTCCTGTGAGACTCTCATCTCTATATAGACAGCAGAATA--CTGA

	Thomomys_townsendii_relictus   		CCCCAGGACTGGAAAAAAAAA-TTAAAGTT-------AAAAACCAAAACC-AAAACAAAACCCTGTCATTTGATTTCTAAGGGTT-TCTAAGAGAACTCAGACTCAAGGGAAAAAA-TGG-CTGATTTAAAATGGGCCGC-----CTTG-AGGCAC-TAGTACCTAGTGCTTCAAGGTTTCTTA-TGGTTAACTGAAATACAAATGAAAATTAAACGTAAAATGCTAGGGGAAAGGTTATTAAAAAGGTTTTGGGGGAAA-CTATCAGGAATTGGTTCCTGGAAATAGAATTTGGAAGTAAAAATTGCCCTAAATGTTTATTTCAAAGTAGAGAAAGGACTACCAAAATGATTGCTTAATTGCTATTCCAGTTTGTCTGTAGCAATTACAGGCAGGCCCACAGAGAGACAGATGATTCTTATAAGTTTGTCAGATGTTACTTTGTCCCTTAATAAGCTCCATGCTTAGGAACTATTTCTACTGACCTCCTTGTTGCTTCATTGGAGTAAAGTGGCTTTTTGTAAAGACTCATTGGTCTGAGAACTGCTGTTCAAAGCCAGCCTGGGAAGAAAAAGATTCCTGTGAGACTCTCATCTCTATATAGACAGCAGAATA--CTGA

	Thomomys_umbrinus_chihuahuae   		CCCTAGGACTGGAAAAAAAA--TTAAAGTTAAAAACCAAAAACCAAAACC-AAAACCAAACCCTGTCATTTGATTTCTAAGGGTT-TCTAAGAGAACTCAGACTCAAGGGAAAAAA-TGG-CTGATTTAAAATGGGCCGC-----CTTG-AGGCAC-TAGTACCTAGTGCTTCAAGGTTTCTAA-TGGTTAATTGAAATACAMATGAAAATTAAACGTAAAATGCTAGGGGAAAGGTTATTAAAAAGGTTTTGGGGAAAA-CCATCAGGAATTGGTTCCTGGAAATAGAATTTGGAAGTAAAAATTGTCCTAAATGTTTATTTCAAAGTAGAGAAAGGACTACCAAAATGATTGCTTAATTGCTATTCCAGTTTGTCTGTAGCAATTACAGGCAGGCCCACAGAGGGACAGATGATTCTTATAAGTTTGTCAGATGTTACTTTGTCCCTTAATAAGCTCCATGCTTAGGAACTATTTCTACTGACCTCCTTGTTGCTTCATTGGAGTAAAGTGGCTTTTTGTAAAGACTCATTGGTCTGAGAACTGCTGTTCAAAGCCAGCCTGGGAAGAAAAAGATTCCTGTGAGACTCTCATCTCTATACAGACAGCAGAATAACCTGA

	Thomomys_umbrinus_atroavarius   	CCCTAGGACTGGAAAAAAAA--TTAAAGTTCAAAACCAAAAACCAAAACC-AAAATCAAACCCTGTCATTTGATTTCTAAGGGTT-TCTAAGAGAACTCAGAYTCAAGGGAAAAAA-TGG-CTGATTTAAAATGGGCCGC-----CTTG-AGGCAC-TAGTACCTAGTGTTTCAAGGTTTCTAA-TGGTTAATTGAAATACAAATGAAAATTAAACGTAAMATGCTAGGGGAAAGGTTATTAAAAAGGTTTTGGGGAAAA-CCATCAGGAATTGGTTCCTGGAAATAGAATTTGGAAGTAAAAATTGTCCTAAATGTTTATTTCAAAGTAGAGAAAGGACTACCAAAATGATTGCTTAATTGCTATTCCAGTTTGTCTGTAGCAATTACAGGCAGGCCCACAGAGGGACAGATGATTCTTATAAGTTTGTCAGATGTTACTTTGTCCCTTAATAAGCTCCATGCTTAGGAACTATTTCTACTGACCTCCTTGTTGCTTCATTGGAGTAAAGTGACTTTTTGTAAAGACTCATTGGACTGAGAACTGCTGTTCAAAGCCAGCCTGGGAAGAAAAAGATTCCTGTGAGACTCTCATCTCTATATAGACAGCAGAATA--CTGA

																			
;


END;
