@SQ	SN:chr1	LN:500
@PG	ID:bwa	PN:bwa	VN:0.7.12-r1039	CL:bwa mem short-ref.fasta short-reads.fasta
read1	0	chr1	5	60	145M	*	0	0	AGGGCGCACTGCATAGGGTGCCCCGCCGAGTGATGTTGGGTGCTGTTCGTCTTCTTAGCCAGGAATGAAATGGGATATAAATGATGAATCTGCGAGCTAACACCCTTCGATGACCCCTTTCGCTATGCTGCCTCTACGAAGGTTA	*	NM:i:1	MD:Z:95T49	AS:i:140	XS:i:0
read2	1024	chr1	80	60	220M	*	0	0	TATAAATGATGAATCTGCGAGCTAACACCCTTCGATGACCCCTTTCGCTATGCTGCCTCTACGAAGGTTATTCCCCGTAAAGTCCTCAGCTCTATCAGCCTTCGCCCCTCTAACGGACTTCGAATGGCTCAACATTAGCATCGCCCCTCTGTCAGAGTTTCTACCGGTGCCGAAAATTAACTTATACGGCAGAGGGCTCGCAATGAAACTAGTTACCAAA	*	NM:i:3	MD:Z:20T99T47C51	AS:i:205	XS:i:0
