> H_pyloriJ99_Bslice
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     Errors = 5
A: taaatttaggtataaaacaccctcaattcaagggtttttgagtgagctttttg
B: taaatttaggcataaaacgcccttaaatcaagggtttttgagcgagctttttg
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A: tagggttttgcgtgggcgtga
B: tagggttttgtgtgggcgtga
   ==========^==========
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A: ttaaatgcggctcgatgagggcgtcaatttcattgattt
B: ttaaatgcggttcgatgagagcgtcaatctcattgattt
   ==========^        ^        ^==========
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A: cgaaagcgagttggttgtttt
B: cgaaagcgagctggttgtttt
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A: ctaacatgctagaagcgattt
B: ctaacatgctggaagcgattt
   ==========^==========
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A: gccattttaacccttgagagt
B: gccattttaatccttgagagt
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A: acaagctcaacaattcaatga
B: acaagctcaataattcaatga
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A: agcccttattgccggctttac
B: agcccttattaccggctttac
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A: caatattgtccgtggtcagca
B: caatattgtctgtggtcagca
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B: tgctgtattttagcatcgcactag-caatgcccttagtcg
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A: ccgcgctcacataatcaaaatgcg
B: ccgcgctcacgtagtcaaaatgcg
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A: tgatcgctcccaaaacgcaca
B: tgatcgctcctaaaacgcaca
   ==========^==========
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A: atcgtatttttcgctctctaataatttgtctaaaataaaaggcaatt
B: atcgtattttccgctctctaacaatttgtctaaaatcaaaggcaatt
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A: ccccaggcaccagcacgatgtctaaaagatcctcatcgc
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A: ttttaaagcagtccatcgccccttcttgcaatctgtctg
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A: aaaatagcgactctttcattccc
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A: cggttactaattgttctagct
B: cggttactaagtgttctagct
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A: aaatatccgccactttggctgcca
B: aaatatccgctaccttggctgcca
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B: catcggttaaaattttataaccaaattcatctttgatagtttgtaacatttctaagcctt
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A: tttctaaaccaggccctctgtaactctctaaactcgtgcggttcgccttatcaa
B: tttctaaaccaggtcctctgtaactctccaaactcgtgcggttagccttatcaa
                ^              ^              ^==========
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A: gattttctaagctctcaatga
B: gattttctaaactctcaatga
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B: cgcatggcccggcgattaaaacgggtttaggggtttttgtgttagaagttttcatgactt
   ==========^             ^               ^                   
A: ttcctttgttt
B: atcctttgttt
   ^==========
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B: tttttaattcgttatttattactctttcttgaatga
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A: ggttttttaactcttctttaacaggctctaaa
B: ggttttttaattcttctttaataggctctaaa
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B: attaaatgaatgctcccgcaa
   ==========^==========
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A: gcgtattcaatgctcgcaatg
B: gcgtattcaacgctcgcaatg
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A: tagaaagggactctttatagc
B: tagaaagggattctttatagc
   ==========^==========
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A: tttaggggggttcacattgcccatgttgcaaatcacataca
B: tttaggggggatcacattgcccatgttgcggatcacataca
   ==========^                  ^^==========
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A: tcgcccggtttggtgccagtgattaaat
B: tcgcccggttgggtgcctgtgattaaat
   ==========^      ^==========
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A: gtgaatccacacaagaaatga
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   ==========^==========
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A: agctctttaagctcttcatat
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A: tctcttgaaactctaacgctc
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   ==========^==========
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B: aaaaacgcttccactctttaa
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B: atctcatttt--ttaaacttggttttcattttaaaacg
   ==========^^     ^  ^    ^^^==========
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A: atagctaaaattcttgcattt
B: atagctaaaaatcttgcattt
   ==========^==========
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B: gtgtcgcattagatttagaaa
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B: tgcaagaattaaagggcttag
   ==========^==========
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B: tatgggctaaagtggggctta
   ==========^==========
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A: gagacggggctgtttttttagat
B: gagacggggcgacttttttagat
   ==========^^^==========
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A: aagattgatgaaaattttaaga
B: aagattgatgggaattttaaga
   ==========^^==========
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   ==========^==========
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   ==========^^^==========
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   ==========^==========
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A: ttaggtaaggactttttgact
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   ==========^==========
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B: aaggctggataaaaacgataaagaagatcaagaaa
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   ==========^==========
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B: ggattgttaa-tgcgggcgttagaaacgattgctactttaagagaatatcgtaaaagttt
   ==========^    ^ ^              ^ ^          ^              
A: ggaagaaagcgt
B: gaaagaaagcgt
    ^==========
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B: gctttacacagagggcatcaa
   ==========^==========
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B: cccacacgattgtaagcgtttttgtcaaccccacgcaat
   ==========^  ^              ^==========
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     Errors = 6
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B: gggctaacgaggattttagcgcttacccgcgccctttggaaaaggatttggctttgtgtg
   ==========^       ^         ^        ^                 ^    
A: aaaaattaggcgttaat
B: aaaaatcaggcgttaat
         ^==========
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B: gcggtgtttgcgcctaaaatt
   ==========^==========
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B: ctatgaagcaaagcaacgcctaaaactctacgcccctgcatttttatcccactctttaga
   ==========^          ^        ^  ^   ^^         ^^^         
A: gggagccatgcgtaaagggcattttg
B: gggggcggtgcgtaaggggcattttg
      ^  ^^       ^==========
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     Errors = 6
A: ggttgttcagatcgtgttaaaaatgtttcatcttgttaatcccact
B: ggttgttcaggtcgtgttaagattgttccatcttactaatcccact
   ==========^         ^ ^    ^      ^^==========
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A: ttttaatcattgagcatttagtcaaagatttgct
B: ttttaatcatccagcatttagtccaagatttgct
   ==========^^           ^==========
    3947     3779     24    none     20     20
     Errors = 4
A: catgcgagatcgtgcgcgatgacgataatttggctttaag
B: catgcgagattgtgcgcgatagcgataatctggctttaag
   ==========^         ^^       ^==========
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     Errors = 4
A: aggaatgtgtatttgaatgccacacaaagaaaacaagccctagccattccaaaagctt
B: aggaatgtgtgtttgaatgccacagaaagaaaacaagccctagcgatcccaaaagctt
   ==========^             ^                   ^  ^==========
    4047     3879     49    none     12     12
     Errors = 2
A: aaatccagcaggccatagataagggcgaaaaa
B: aaatccagcaagccatagataggggcgaaaaa
   ==========^          ^==========
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     Errors = 4
A: tgaaattttagaaaccttggaagtggatt
B: tgaaattttaaaaaatttagaagtggatt
   ==========^   ^^  ^==========
    4178     4010     46    none     27     27
     Errors = 6
A: gagcctttaacaatcatagagccaactaacacgctcattttggtggc
B: gagcctttaaaaaccatagagccggctaacacgctggttttggtggc
   ==========^  ^         ^^          ^^==========
    4243     4075     93    none     19     19
     Errors = 3
A: tagataatttatgggtgtagtttggaatttttgtggcga
B: tagataatttgtgggtgtagtttgaaatctttgtggcga
   ==========^             ^   ^==========
    4380     4209     87    none     44     41
     Errors = 8
A: tttaacgattgactattatttgaaaataaagcgtagaaaatgatttaaaaagcacttggt
B: tttaacgattaactattatatgaaaa-a--gcgtaggaaatgatttaaaaagttcttggt
   ==========^        ^      ^ ^^      ^               ^^======
A: ggcg
B: ggcg
   ====
    4501     4340     78    none     34     44
     Errors = 14
A: gctccctatccaaaatcc-atagcctaaaaatgcatgctt-----ta-gtc----atggt
B: gctccctatc-aaaaccccatagcctaaaaacgcatgcttgaagctaagtcaaaaatggt
   ==========^    ^  ^            ^        ^^^^^  ^   ^^^^=====
A: ggtcg
B: ggtcg
   =====
    4583     4422     22    none      4      4
     Errors = 2
A: taagcgaccaaaatattgagataa
B: taagcgaccacaacattgagataa
   ==========^  ^==========
    4611     4446     85    none      6      2
     Errors = 5
A: tccaactaaacccgtataaaagagtg
B: tccaactaaa----tttaaaagagtg
   ==========^^^^ ^==========
    4703     4540    109    none      7      9
     Errors = 4
A: aaggagccacgatgctc--atggtgaccc
B: aaggagccactacgctcaaatggtgaccc
   ==========^ ^    ^^==========
    5056     4895     24    none    244    246
     Errors = 3
A: ttttttttaacgcttgtcaagaataattgagaaatattgcggttttttaaaaaatg
B: ttttttttaatgcttgtcaagaataactgaaaaatattgcggttttttaaaaaatg
   ==========^               ^   ^               ==========
Region:        167 .. 4847               1 .. 4684           229 / 4684        4.89%
Region:       5009 .. 5079            4849 .. 4918             4 / 71          5.63%
#
    5203     5395     28    none      -      -
    5251     5446     26    none     20     23
     Errors = 11
A: gtttcacaaaaag----acagatattagtaagcaaacacataat
B: gtttcacaaagggttttaacgct-ttagtaagcgaacacataat
   ==========^^ ^^^^ ^^ ^ ^         ^==========
    5284     5479     50    none      7      7
     Errors = 4
A: acacgctata-aagcctgcggtattgga
B: acacgctatacaatc-ttcggtattgga
   ==========^  ^ ^ ^==========
    5431     5626     35    none     97     97
     Errors = 12
A: tgttgatcgtagggatcttcacgcctagttccacgccatgctgagctacatgatcgctcg
B: tgttgatcgtggggatcttcacgcctaattccacgccatgctgagccgcatgatcgctcg
   ==========^                ^                  ^^            
A: ctttctttttgtttttagcgagattcattctcaagcccaagttgaataagaattgga
B: cttttttcttattcttagcgaggttcattctcaagcctaaattgaacaagaattgga
       ^  ^  ^  ^        ^              ^  ^     ^==========
    5515     5710     47    none     49     49
     Errors = 8
A: ttttagcgctgtaaaaattattgaatgtcgctaaattcacgtattgagaattaagccacg
B: ttttagcgctatagaaattattgaaggtcgctaaattcacatactgggaattcagccatg
   ==========^  ^           ^              ^  ^  ^     ^     ^=
A: aagtgccag
B: aagtgccag
   =========
    5584     5779     26    none     22     22
     Errors = 4
A: aagaaatcttattgtttttggtggctttatcgttgataaagt
B: aagaaatcttgctgtttttggtggttttatcattgataaagt
   ==========^^            ^      ^==========
    5611     5806     26    none      1      1
     Errors = 1
A: ggacatctgttcctaccccat
B: ggacatctgtccctaccccat
   ==========^==========
    5656     5851     20    none     19     19
     Errors = 4
A: acacatcagaggcggagttgaaaaagctggatttgatat
B: acacatcagaagccgaattgaaaaagctagatttgatat
   ==========^  ^  ^           ^==========
    5716     5911     20    none     40     40
     Errors = 6
A: aagcatggttgtaatcaaaaaaaccataataccttaacccccatcttcttttttcaccaa
B: aagcatggttatagtcaaaaaagccgtaataccttaacccccaccttctcttttcaccaa
   ==========^  ^        ^  ^                 ^     ^==========
    5773     5968     23    none     37     37
     Errors = 7
A: aaaattgtttataccctatttgcacgccgatcccattcatcgcaccgttgttggttt
B: aaaattgtttgtagcccacttgcacaccgatcccattcatggcaccattgttggttt
   ==========^  ^  ^ ^      ^              ^     ^==========
    5797     5992    152    none      1      1
     Errors = 1
A: agctgattaagccaacgcgtc
B: agctgattaatccaacgcgtc
   ==========^==========
    5950     6145     49    none      1      1
     Errors = 1
A: atggggaattgggcgtgtttg
B: atggggaattaggcgtgtttg
   ==========^==========
    6002     6197     25    none      3      3
     Errors = 3
A: ttgtttaaatccttaaggctgcc
B: ttgtttaaattactaaggctgcc
   ==========^^^==========
    6028     6223     32    none      1      1
     Errors = 1
A: aatcaagtatcgtgcgcgcca
B: aatcaagtatggtgcgcgcca
   ==========^==========
    6064     6259     29    none      4      4
     Errors = 2
A: gcttgatttgatcggcttgagtgc
B: gcttgatttgctcagcttgagtgc
   ==========^  ^==========
    6103     6298     20    none     10     10
     Errors = 4
A: caaggctgttatttagggcggttatcgtct
B: caaggctgttgtttaaagccgttatcgtct
   ==========^    ^^  ^==========
    6124     6319     23    none      1      1
     Errors = 1
A: cttccacataggcgcaaccgg
B: cttccacatacgcgcaaccgg
   ==========^==========
    6160     6355     27    none     13     13
     Errors = 4
A: cccaagtgttagaagtaacccctgcatcaggta
B: cccaagtgttgttagtaacccccgcatcaggta
   ==========^^^         ^==========
    6221     6416     40    none     34     34
     Errors = 4
A: acccccattgcggcaagctgccaagtagtttgtgataaattgttttgggatagt
B: acccccattgtggcaagctgccaagtaatttgtgataaattggcttgggatagt
   ==========^                ^              ^^==========
    6268     6463     79    none      7      7
     Errors = 2
A: gatcggctagttcaagcatcttggctt
B: gatcggctagctcaagtatcttggctt
   ==========^     ^==========
    6375     6567     33    none     28     25
     Errors = 6
A: ttgaaatctttcggcgcgttttgattgctttgcgggttgttaaggctt
B: ttgaaatcttgcggcgcgttttgattgttttgc---tggttaaggctt
   ==========^                ^     ^^^ ^==========
    6409     6601     32    none      1      1
     Errors = 1
A: cgatttcttgcgcgtttttga
B: cgatttcttgggcgtttttga
   ==========^==========
    6442     6634     31    none      1      1
     Errors = 1
A: cggcgctaaactccgtggcaa
B: cggcgctaaattccgtggcaa
   ==========^==========
    6523     6715    122    none     50     50
     Errors = 16
A: acattccctgtcgtatttaaattccacggtgcacccccgtttgagttat-gagcggtatt
B: acattccctgccgtatctaaaccccacggcgcgcccccgttt-tgtccttgattgtgatt
   ==========^     ^    ^^      ^  ^         ^^  ^^ ^  ^^ ^^   
A: tacccatgggc
B: gacccatgggc
   ^==========
    6656     6848     20    none     11     11
     Errors = 2
A: cattagtttgtgttgttatttttatagttac
B: cattagtttgcgttgttattgttatagttac
   ==========^         ^==========
    6678     6870     60    none      2      2
     Errors = 2
A: ttgttttcctttactatccaaa
B: ttgttttcctgcactatccaaa
   ==========^^==========
    6760     6952     59    none     22     22
     Errors = 3
A: tttgataagcttgattaagcgttttaaaattgtcaatggata
B: tttgataagcctgattaagctttttaaaattctcaatggata
   ==========^         ^          ^==========
    6871     7063     29    none     52     52
     Errors = 9
A: aattaatggatcttgaatcatgtcctggttggccatcaaaaattacgctttgatccccac
B: aattaatggaacttgaattatgtcctggttggccctcaaaggttacgctttgttgtccac
   ==========^       ^               ^     ^^          ^ ^^    
A: tcttaccaggac
B: tgttaccaggac
    ^==========
    6919     7111     62    none     19     19
     Errors = 3
A: cattataggctatcacattccacagccccaccgccgcat
B: cattataggcgatgacattccacagccctaccgccgcat
   ==========^  ^              ^==========
    6982     7174     34    none      1      1
     Errors = 1
A: tttcgccaatcagcccttgcg
B: tttcgccaattagcccttgcg
   ==========^==========
    7018     7210     38    none      2      2
     Errors = 2
A: ttatcgatcgtggcattgattt
B: ttatcgatcgcagcattgattt
   ==========^^==========
    7057     7249    177    none      1      1
     Errors = 1
A: tcgttaccgcttgattgaggt
B: tcgttaccgcctgattgaggt
   ==========^==========
    7244     7426     78     -13     10      0
     Errors = 10
A: agagagagagagagagagagtaaaagggtt
B: agagagagag----------taaaagggtt
   ==========^^^^^^^^^^==========
    7339     7521     60    none     17     17
     Errors = 2
A: agaatgtattaaaagcattgtagcataaaatcgtttt
B: agaatgtattcaaagcattgtagcatgaaatcgtttt
   ==========^               ^==========
    7419     7596     22    none     20     15
     Errors = 6
A: ttttttgcgcgtttgtttgggtggtattggaaagggtttt
B: ttttttgcgcttttgtttgggtggt-----aaagggtttt
   ==========^              ^^^^^==========
    7442     7619     20    none      1      1
     Errors = 1
A: gattttgtttcaatggaacgc
B: gattttgttttaatggaacgc
   ==========^==========
    7499     7682     23    none     37     43
     Errors = 11
A: taatgataaaagctt-a----a-cagagattttttgct-gcgcgtttttaaaagcgagcg
B: taatgataaaggcttgattttaacagagattttt-gtttgcgcgtttttaaaaacgagcg
   ==========^    ^ ^^^^ ^           ^ ^ ^              ^======
A: gttt
B: gttt
   ====
    7552     7714     43    none     30      9
     Errors = 21
A: caaataaaaagcaccccccaaaaaaagagattttagaaaggggggatttt
B: caaataaaaa-c-cccc--aaaa-----------------gggggatttt
   ==========^ ^    ^^    ^^^^^^^^^^^^^^^^^==========
    7625     7780    167    none     30     23
     Errors = 9
A: actaaaaagcaagggggcttacatcatgccacccatgcctcccataccgc
B: actaaaaagc-------cttacatcatgccgcccatgccacccataccgc
   ==========^^^^^^^             ^        ^==========
    7793     7948     52    none      1      1
     Errors = 1
A: ctttaaacatatccacatact
B: ctttaaacatgtccacatact
   ==========^==========
    7883     8038     74    none     38     38
     Errors = 5
A: tcgtgtttttctacttcattcacgaccacaccgccatcataaccggcattgatagcga
B: tcgtgtttttgcacttcattcacgaccacgccaccatcataaccggcgttgatagcga
   ==========^^                 ^  ^              ^==========
    7958     8113     32    none      1      1
     Errors = 1
A: catcatcgtgcaaattcaaat
B: catcatcgtgtaaattcaaat
   ==========^==========
    7991     8146     26    none      1      1
     Errors = 1
A: ccgcgcgaatgagagccgcac
B: ccgcgcgaataagagccgcac
   ==========^==========
    8030     8185     23    none     13     13
     Errors = 2
A: caatcacaataccttcttcaacagccgctttag
B: caatcacaatgccttcttcaaccgccgctttag
   ==========^           ^==========
    8060     8215    161    none      7      7
     Errors = 2
A: cgctcaacgcatcatcaacccggtctt
B: cgctcaacgcgtcatccacccggtctt
   ==========^     ^==========
    8230     8385     57    none      9      9
     Errors = 3
A: ctctgtctttgacatcatggctatggcct
B: ctctgtctttaacgtcatcgctatggcct
   ==========^  ^    ^==========
    8288     8443     56    none      1      1
     Errors = 1
A: caatccttccggctttgccta
B: caatccttccagctttgccta
   ==========^==========
    8348     8503     47    none      4      4
     Errors = 2
A: attcttcgctaataacttgaccgc
B: attcttcgctgatgacttgaccgc
   ==========^  ^==========
    8396     8551     65    none      1      1
     Errors = 1
A: tttcttttcttctgtccccaa
B: tttcttttctcctgtccccaa
   ==========^==========
    8462     8617    167    none      1      1
     Errors = 1
A: tattcaccactagagtcgtta
B: tattcaccaccagagtcgtta
   ==========^==========
    8630     8785     44    none      1      1
     Errors = 1
A: tctcagcgtttgttacaaaat
B: tctcagcgttggttacaaaat
   ==========^==========
    8689     8844     48    none     15     15
     Errors = 4
A: attgcatgccttctacaacatctagttcatcttca
B: attgcatgccctctacgacatccaattcatcttca
   ==========^     ^     ^ ^==========
    8738     8893    104    none      1      1
     Errors = 1
A: cgccgtctttacccacttttt
B: cgccgtctttgcccacttttt
   ==========^==========
    8843     8998     23    none      1      1
     Errors = 1
A: ccacttttttgctcgcttttt
B: ccacttttttactcgcttttt
   ==========^==========
    8870     9025     25    none      4      4
     Errors = 2
A: gctcattaataatggcttcagcgg
B: gctcattaatgatcgcttcagcgg
   ==========^  ^==========
    8896     9051     33    none      1      1
     Errors = 1
A: tccatgcctcgtttcacttca
B: tccatgcctcttttcacttca
   ==========^==========
    8933     9088     38    none      4      4
     Errors = 2
A: cagccgtgatgttcctcaaacctt
B: cagccgtgatatttctcaaacctt
   ==========^  ^==========
    8972     9127     23    none      1      1
     Errors = 1
A: ccagcacggtcgctgtggtcg
B: ccagcacggttgctgtggtcg
   ==========^==========
    8996     9151     53    none      1      1
     Errors = 1
A: catcgccggcagcatcagcgg
B: catcgccggctgcatcagcgg
   ==========^==========
    9050     9205     86    none      1      1
     Errors = 1
A: ccatgttagctaccgggcaac
B: ccatgttagccaccgggcaac
   ==========^==========
    9167     9322     34    none     31     31
     Errors = 3
A: ggatcaacacgttcctgcctcttggccccatggttactttaacagcgtcat
B: ggatcaacacattcctgcctcttggtcccatggttactttgacagcgtcat
   ==========^              ^              ^==========
    9215     9370    128    none     14     14
     Errors = 2
A: ccttcaaataaaaggtttctcgcgctatctgaaa
B: ccttcaaatagaaggtttctcgcactatctgaaa
   ==========^            ^==========
    9344     9499     20    none      1      1
     Errors = 1
A: ctgtatgacaacaagagcctg
B: ctgtatgacagcaagagcctg
   ==========^==========
    9365     9520     22    none      1      1
     Errors = 1
A: agcccacaatgcctagaatgt
B: agcccacaatacctagaatgt
   ==========^==========
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     Errors = 1
A: tctagttctagcaccatgtat
B: tctagttctaacaccatgtat
   ==========^==========
    9530     9685     83    none      1      1
     Errors = 1
A: aaggcttttccttagcgttat
B: aaggcttttctttagcgttat
   ==========^==========
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     Errors = 3
A: ctcctaatggctgaaacttcatattagttctccta
B: ctcctaatggttgaaacttcatttcagttctccta
   ==========^           ^ ^==========
    9682     9837     46    none      1      1
     Errors = 1
A: attgttattaagcgacataac
B: attgttattacgcgacataac
   ==========^==========
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     Errors = 6
A: agccataaaaacaaagctaataatataactataaggatt
B: agccataaaaccaaacataagattataattataaggatt
   ==========^    ^^   ^ ^     ^==========
    9838     9993     24    none     41     41
     Errors = 6
A: tttaaaaatacaaggattagagaaagggg-cgttattaacaaaccttattttaagatttt
B: tttaaaaatataaggattagaaaaagggggcgttatcaacaaacctt-tttgaagatttt
   ==========^          ^       ^      ^          ^   ^========
A: at
B: at
   ==
    9894    10050     49    none     32     33
     Errors = 15
A: tgagtataattcatt-caagcgagttaaaacaagaaagc-aagatgaagaaagc
B: tgagtataatcccttttgagaaagtcaaa-ctaaaaagcccatttgaagaaagc
   ==========^ ^  ^^^  ^^   ^   ^ ^ ^     ^^ ^^==========
    9956    10112     27    none     13     13
     Errors = 2
A: atcgccttttgcaaacgatagacattgtagaag
B: atcgccttttacaaacgatagatattgtagaag
   ==========^           ^==========
   10007    10163     57    none     24     24
     Errors = 4
A: ctcttatgtgaatttgaggaaatcaggttctagctacatggctt
B: ctcttatgtggatttgaggaaatcaggttcgaattacatggctt
   ==========^                   ^ ^^==========
   10080    10236     58    none     16     16
     Errors = 2
A: cgtcaatcaaattaaagggttttaccattgctttgg
B: cgtcaatcaagttaaagggttttactattgctttgg
   ==========^              ^==========
   10139    10295     49    none      1      1
     Errors = 1
A: cgtttgaaaagctttcgtttg
B: cgtttgaaaaactttcgtttg
   ==========^==========
   10189    10345    136    none      1      1
     Errors = 1
A: ttcaatatagttttagagtat
B: ttcaatatagctttagagtat
   ==========^==========
   10369    10525     42    none     44     44
     Errors = 5
A: agggcttagcctagagagtatcaaagcgtttaaattaggcttatgcacgaatagaattga
B: agggcttagcatggagagcatcaaagcgtttaagttaggcttatgcacgaataaaattga
   ==========^ ^     ^              ^                   ^======
A: ttac
B: ttac
   ====
   10424    10580     23    none     13     13
     Errors = 4
A: ataaggacaagctcattgaattaggcgtgctag
B: ataaggacaaattgattgaattgggcgtgctag
   ==========^^ ^        ^==========
   10454    10610     53    none      7      7
     Errors = 4
A: agagcgataacgatcagaaaacctatt
B: agagcgataaagaggataaaacctatt
   ==========^  ^^ ^==========
   10508    10664     70    none      1      1
     Errors = 1
A: atagccctagcgctcaagtgg
B: atagccctagtgctcaagtgg
   ==========^==========
   10579    10735     21    none      1      1
     Errors = 1
A: tcgccccaaagtaagcttttt
B: tcgccccaaaataagcttttt
   ==========^==========
   10601    10757     35    none      1      1
     Errors = 1
A: ataaatccagtttgctctatg
B: ataaatccagcttgctctatg
   ==========^==========
   10667    10823    110    none     31     31
     Errors = 3
A: aagaacacatctataaacaaaagcaagtcattgtaacagaggggtatttgg
B: aagaacacatttataaacaaaagcaggtcattgtaacagaagggtatttgg
   ==========^              ^              ^==========
   10778    10934     38    none      1      1
     Errors = 1
A: aaggcgatcccgaaatccttt
B: aaggcgatccagaaatccttt
   ==========^==========
   10826    10982     20    none     10     10
     Errors = 4
A: aggcagggcgaaacgcagcctataaagcga
B: aggcagggcggaatgcggcttataaagcga
   ==========^  ^  ^  ^==========
   10868    11024     26    none     22     22
     Errors = 4
A: gcttgatgttggctaaagagcaaaggaggggaggggtgattt
B: gcttgatgttagctaaagagcaaaggaaagggggggtgattt
   ==========^                ^^  ^==========
   10898    11054     21    none      4      4
     Errors = 2
A: aaaacaacctggatccagcggata
B: aaaacaacctagacccagcggata
   ==========^  ^==========
   11000    11156     35    none     81     81
     Errors = 11
A: gatcgctaatggccagattgaaaccttaaaaaattggctatcgcaccccatggcttttat
B: gatcgctaatcatcagattgaaactttaaaaaattggctatcgcgccccatagctttcat
   ==========^^^           ^                   ^      ^     ^  
A: tgagtttgttttaaggcgcatggcggattcctatcttttag
B: tgaatttgttttaaggcacatggcgggttcttatcttttag
      ^             ^        ^   ^==========
   11036    11192     23    none      1      1
     Errors = 1
A: aagataaggctcttaaagaaa
B: aagataaggcccttaaagaaa
   ==========^==========
   11060    11216     25    none      1      1
     Errors = 1
A: tagggtttttaaaaaactttt
B: tagggtttttgaaaaactttt
   ==========^==========
   11087    11243     23    none      2      2
     Errors = 2
A: cttttacaaagcgaatacaagc
B: cttttacaaaatgaatacaagc
   ==========^^==========
   11111    11267     40    none      1      1
     Errors = 1
A: taatcgctacccttttgcaag
B: taatcgctacgcttttgcaag
   ==========^==========
   11156    11312     32    none      5      5
     Errors = 2
A: attagagagcgagtctcttttcagc
B: attagagagccagtttcttttcagc
   ==========^   ^==========
   11227    11383     27    none     39     39
     Errors = 6
A: aaacagaaaaacccaatcgccctcaaaggtttgcgcatgtttctagcgcgcccagtttg
B: aaacagaaaagcctaatcgccctcaaaagttcgcgcatgtttctagcatgcccagtttg
   ==========^  ^             ^   ^               ^^==========
   11306    11462     50    none     52     52
     Errors = 5
A: tagaaaaattagtgatccgctatcttttagaagacagaagcttgttggatttagcggtgg
B: tagaaaaattggtgatccgctaccttttagaagacagaagcctattggatttagcggtgg
   ==========^           ^                  ^ ^                
A: gctatatccata
B: gttatatccata
    ^==========
   11372    11528    129    none     16     16
     Errors = 2
A: ttgacgctttgtgtcaagaaaaattagacgacccta
B: ttgacgctttatgtcaagaaaaattggacgacccta
   ==========^              ^==========
   11508    11664     21    none      7      7
     Errors = 3
A: ccctaaaagctcgctcccttttagcga
B: ccctaaaagcccgctttcttttagcga
   ==========^    ^^==========
   11539    11695     54    none     10     10
     Errors = 2
A: aaaatgatctgtttaaaaaaggctcgccag
B: aaaatgatctttttaaaaagggctcgccag
   ==========^        ^==========
   11617    11773     68    none     24     24
     Errors = 4
A: ccatatgaaaaagattaaagctttagccttattcagtggggggt
B: ccatatgaaacaaataaaagctttagccttatttagtggggggt
   ==========^ ^  ^                 ^==========
   11707    11863     56    none     22     22
     Errors = 3
A: taaccgctttgcactttaatatagggtttggggggaataaag
B: taaccgctttacacttcaatatagggtttggagggaataaag
   ==========^     ^              ^==========
   11764    11920     29    none      1      1
     Errors = 1
A: ttggggctaagctcttggtgt
B: ttggggctaaactcttggtgt
   ==========^==========
   11794    11950     41    none      1      1
     Errors = 1
A: gagagcagttttttaacgatg
B: gagagcagttctttaacgatg
   ==========^==========
   11836    11992     20    none      1      1
     Errors = 1
A: gctatgggaaatatttcaacc
B: gctatgggaagtatttcaacc
   ==========^==========
   11857    12013     48    none      1      1
     Errors = 1
A: cttgcattgactgccatgcca
B: cttgcattgattgccatgcca
   ==========^==========
   11908    12064    107    none      3      3
     Errors = 2
A: gcttgaattgaacgcggattttg
B: gcttgaattggatgcggattttg
   ==========^ ^==========
   12029    12185     20    none     14     14
     Errors = 4
A: gcgaagaggcgcgttttgatcccgttttagaccg
B: gcgaagaggctcgttttgatcttattttagaccg
   ==========^          ^^^==========
   12091    12247     49    none     42     42
     Errors = 10
A: aacgcaagcaggtggtaaaaaaccgcaatttttagatgagttgttattgcgacccatgag
B: aacgcaagcaagcggtgaaaaaccgcaatttttagacgaattgctcttaaggcccatgag
   ==========^ ^   ^                   ^  ^   ^ ^  ^^ ^========
A: cg
B: cg
   ==
   12151    12307     32    none     11     11
     Errors = 3
A: aaaaagggttttgttgatagagaaaagcttt
B: aaaaagggttgggttgatagggaaaagcttt
   ==========^^        ^==========
   12187    12343     56    none      4      4
     Errors = 3
A: gtagggggcgaagc-aggcaattgc
B: gtagggggcg-tgctaggcaattgc
   ==========^^  ^==========
   12274    12430     47    none     31     31
     Errors = 4
A: agccaggtggagggtgtttgcttacagacattcaagtgagcaataagatta
B: agccaggtggggggtgcttgcttacggacattcaagtgagtaataagatta
   ==========^     ^        ^              ^==========
   12323    12479     32    none      2      2
     Errors = 2
A: tgtttgaagacagcgtgattgt
B: tgtttgaagatggcgtgattgt
   ==========^^==========
   12373    12529     38    none     18     18
     Errors = 2
A: ttattttgtcttaccccataacgctcgcttggtggtgg
B: ttattttgtcctaccccataacgctcgtttggtggtgg
   ==========^                ^==========
   12419    12575     28    none      8      8
     Errors = 3
A: accataaattggatattcaacacccctt
B: accataaattagacattgaacacccctt
   ==========^  ^   ^==========
   12463    12619     26    none     16     16
     Errors = 4
A: agattgaattactaaactgtaaaggccctttgagtt
B: agattgaattgctaggctgtaaaggtcctttgagtt
   ==========^   ^^         ^==========
   12517    12673     60    none     28     28
     Errors = 4
A: ataaaaacgctagcaaagaagataaagaattagccggccgtatcgctt
B: ataaaaacgccagccaagaagataaagaattggccggtcgtatcgctt
   ==========^   ^                ^     ^==========
   12592    12748     32    none     15     15
     Errors = 2
A: tcaaataggggatgaaaagcgcgagctttaccctt
B: tcaaatagggaatgaaaagcgcgaactttaccctt
   ==========^             ^==========
   12625    12781     20    none      1      1
     Errors = 1
A: acgctagggaatatttgttcg
B: acgctagggagtatttgttcg
   ==========^==========
   12657    12814    188    none     12     13
     Errors = 3
A: cttgaaaggg-agtttttgagggttttaggggt
B: cttgaaaggggagtttttgagaattttaggggt
   ==========^          ^^==========
   12878    13035     21    none     33     33
     Errors = 5
A: ccctaaggggctattccctttttatatcccctatgaaaattgttatttggggc
B: ccctaaggggttgttccctttttatatcccgtatgagaattgctatttggggc
   ==========^ ^                 ^     ^     ^==========
   12900    13057     30    none      1      1
     Errors = 1
A: ttgttgcattgataaccataa
B: ttgttgcattaataaccataa
   ==========^==========
   12931    13088     54    none      1      1
     Errors = 1
A: cctagtgatctagatttaagg
B: cctagtgatccagatttaagg
   ==========^==========
   13013    13170     50    none     28     28
     Errors = 5
A: atgttaaatacgatgaaaaacatttggttgcaaagctcgtgcctaatt
B: atgttaaatatgatgaaaaacatttggtaaccaagcttgtgcctaatt
   ==========^                 ^^ ^     ^==========
   13073    13230     26    none     10     10
     Errors = 3
A: gcaatttagacgccgcaaaactctcccaaa
B: gcaatttagaagccacaaagctctcccaaa
   ==========^   ^    ^==========
   13100    13257     29    none      1      1
     Errors = 1
A: atttttcaccggcttctaaag
B: atttttcaccagcttctaaag
   ==========^==========
   13130    13287     38    none      1      1
     Errors = 1
A: agaaattgcccattgacaggt
B: agaaattgcctattgacaggt
   ==========^==========
   13169    13326     24    none      1      1
     Errors = 1
A: gtaacaatttctctatcgcgt
B: gtaacaatttttctatcgcgt
   ==========^==========
   13211    13368     62    none     18     18
     Errors = 3
A: tttgaaatacaataatgtttggcacatttatggggaaa
B: tttgaaatacgacaatgtttggcacatctatggggaaa
   ==========^ ^              ^==========
   13284    13441     22    none     11     11
     Errors = 3
A: tagattggattaaagaccaattaaaccacca
B: tagattggatcaaaaaccaactaaaccacca
   ==========^   ^     ^==========
   13307    13464     44    none      1      1
     Errors = 1
A: aagatggcgactctttagagg
B: aagatggcgattctttagagg
   ==========^==========
   13373    13530     41    none     22     22
     Errors = 4
A: ataatttccccactaaaatgatttttgcaataggggctaccc
B: ataatttccctaccaaaatgatttttgcgattggggctaccc
   ==========^  ^              ^  ^==========
   13415    13572     23    none      1      1
     Errors = 1
A: agcattttttgcaaaaaggcg
B: agcattttttacaaaaaggcg
   ==========^==========
   13439    13596     23    none      1      1
     Errors = 1
A: aggtggtgatcgttgcttaca
B: aggtggtgattgttgcttaca
   ==========^==========
   13463    13620     45    none      1      1
     Errors = 1
A: atttacaatacagttttgaaa
B: atttacaatatagttttgaaa
   ==========^==========
   13509    13666     43    none      1      1
     Errors = 1
A: cgccctacaagccaaagaaca
B: cgccctacaaaccaaagaaca
   ==========^==========
   13590    13747     70    none     38     38
     Errors = 7
A: aaatcgtagaatagtaaggcttttacactctttggctttgctttttta-cccttttaaa
B: aaatcgtagagtagtaaggctttt-ttctcttcagctttgcttttttaccccttttaaa
   ==========^             ^^^     ^^              ^==========
   13670    13827     21    none     10     10
     Errors = 4
A: ttgagataataaagac-ttataaagttaatt
B: ttgagataattaa-accttagaaagttaatt
   ==========^  ^  ^   ^==========
   13700    13857     91    none      9      9
     Errors = 2
A: aaattaaacagaagggttttgatgtccgc
B: aaattaaacaaaagggttatgatgtccgc
   ==========^       ^==========
   13792    13949     80    none      1      1
     Errors = 1
A: tttttaacgccctagaagccc
B: tttttaacgctctagaagccc
   ==========^==========
   13897    14054     50    none     25     25
     Errors = 3
A: atgtgtggaggaatttggaccggtggaaagagatcttattcacga
B: atgtgtggagaaatttagaccggtggaaagagattttattcacga
   ==========^     ^                 ^==========
   13995    14152     65    none     48     48
     Errors = 4
A: tctttaaagctccgagtttagcgaattggtttatgggaattttttaatgattatcctgtc
B: tctttaaagccccgagtttggcgaattggtttatgggagttttttaatgattatcctctc
   ==========^        ^                  ^                  ^==
A: agcgagcg
B: agcgagcg
   ========
   14073    14230     20    none     13     13
     Errors = 2
A: tgaacgctaagtcttatttgatttctgtttttg
B: tgaacgctaaatcttatttgatctctgtttttg
   ==========^           ^==========
   14094    14251     20    none      1      1
     Errors = 1
A: cgccttttatcttgctccctt
B: cgccttttattttgctccctt
   ==========^==========
   14115    14272     35    none      1      1
     Errors = 1
A: ggattgatttgttgagcgctt
B: ggattgatttattgagcgctt
   ==========^==========
   14151    14308     32    none      1      1
     Errors = 1
A: ggtttttagcgctctttagcg
B: ggtttttagcactctttagcg
   ==========^==========
   14202    14359     45    none     19     19
     Errors = 4
A: ttgatgaagacattgcagatattatcgtggctaaaagca
B: ttgatgaagatattgcagatattattatcgctaaaagca
   ==========^              ^^ ^==========
   14248    14405     35    none      1      1
     Errors = 1
A: tagagcgtagaatgttagaaa
B: tagagcgtaggatgttagaaa
   ==========^==========
   14284    14441     86    none      1      1
     Errors = 1
A: tcaaacaaaaggtttcaaact
B: tcaaacaaaaagtttcaaact
   ==========^==========
   14371    14528     44    none      1      1
     Errors = 1
A: atgagcatttcttgctcacta
B: atgagcattttttgctcacta
   ==========^==========
   14416    14573     50    none      1      1
     Errors = 1
A: tccgtttagaaggggttagct
B: tccgtttagagggggttagct
   ==========^==========
   14485    14642     26    none     19     19
     Errors = 3
A: atcttttcaccgagcgccagatggcgttggattctttag
B: atcttttcactgagcgccaaatggcgttagattctttag
   ==========^        ^        ^==========
   14512    14669     27    none      1      1
     Errors = 1
A: tcgtggcgcgccttgtggtta
B: tcgtggcgcgtcttgtggtta
   ==========^==========
   14563    14720     20    none     24     24
     Errors = 5
A: taaaattgatcaccaacaaaacattcaatctgattctcaatact
B: taaaattgattataaacaaagcattcaatctgactctcaatact
   ==========^ ^^      ^            ^==========
   14617    14774     69    none     34     34
     Errors = 4
A: tgcaagcgattttgaatcaatttgaaaacaaagaagtgtatgaaaatcagtatt
B: tgcaagcgatcttgaatcagtttgaaaataaagaagtgtatgagaatcagtatt
   ==========^        ^        ^              ^==========
   14704    14861     80    none     18     18
     Errors = 3
A: gaaaaaatctctcatgcatgctaatagggaaaatttta
B: gaaaaaatctttcatgcacgctaatagagaaaatttta
   ==========^       ^        ^==========
   14809    14966     23    none     25     25
     Errors = 3
A: agctcaaaaattatgcccccaaactcttaagctccaaagaggttt
B: agctcaaaaactatgcccccaaactcttaaactctaaagaggttt
   ==========^                   ^   ^==========
   14870    15027     94    none     38     38
     Errors = 5
A: atttttatgcggaatacattaatgggtttgatctccccttaaaacccttagtaggggg
B: atttttatgcagaatatattaatgggtttgaactccctttaaaacccctagtaggggg
   ==========^     ^              ^     ^         ^==========
   14965    15122     54    none      1      1
     Errors = 1
A: aaaaaacctacaaccgcttga
B: aaaaaacctataaccgcttga
   ==========^==========
   15022    15179     20    none      3      3
     Errors = 2
A: ttctatagcgatcggagcgcttt
B: ttctatagcggtgggagcgcttt
   ==========^ ^==========
   15086    15243     46    none     44     44
     Errors = 7
A: tataccaagaaacgcctttagatattatcttctctatagagcctatgagtgtgcataaaa
B: tataccaagagacgcctttggatattatcttttccatagagcctatgagcgtcaataaaa
   ==========^        ^           ^  ^              ^  ^^======
A: cgct
B: cgct
   ====
   15139    15296     30    none      7      7
     Errors = 2
A: ttagcatgtccaatctcgttaaaaacg
B: ttagcatgtctaatcttgttaaaaacg
   ==========^     ^==========
   15188    15345     26    none     19     19
     Errors = 4
A: ataccaagaactggtcaaaaccaaacgcctatccatgca
B: ataccaagaattagtcaaaaccaaacgattatccatgca
   ==========^ ^              ^^==========
   15266    15423     25    none     52     52
     Errors = 7
A: cgccctaaacattcttatcaaagcccctagtttagagaatttagacgctcaaacaagctt
B: cgccctaaacgttcttatcaaagcccccagtttggaggatttagacgctcaaaccagctt
   ==========^                ^     ^   ^                ^     
A: ggttttagggct
B: aattttagggct
   ^^==========
   15292    15449     32    none      1      1
     Errors = 1
A: ttaaagaaaatttagtgggcg
B: ttaaagaaaacttagtgggcg
   ==========^==========
   15325    15482     35    none      1      1
     Errors = 1
A: ttggcttgaagggggggtatt
B: ttggcttgaaaggggggtatt
   ==========^==========
   15361    15518     36    none      1      1
     Errors = 1
A: aacgcatccacttaaaccacc
B: aacgcatccatttaaaccacc
   ==========^==========
   15409    15566    125    none     12     12
     Errors = 2
A: ctctaaagccttagcgtgtttaatggtgtttg
B: ctctaaagccctagcgtgtttgatggtgtttg
   ==========^          ^==========
   15553    15710     24    none     19     19
     Errors = 4
A: aagtgagccacaagaacgccaaagaaatcgccagagtga
B: aagtgagccataataacgctaaagaaattgccagagtga
   ==========^  ^     ^        ^==========
   15595    15752     25    none     18     18
     Errors = 5
A: gcatactttaatcataggggctactgggagcggtaaaa
B: gcatactttagttataggggcaaccggaagcggtaaaa
   ==========^ ^        ^  ^  ^==========
   15640    15797     32    none     20     20
     Errors = 2
A: ctgattagctttttaatgatgagcgctttgaaataccaaa
B: ctgattagctatttaatgatgagcgctttaaaataccaaa
   ==========^                  ^==========
   15701    15858     40    none     29     29
     Errors = 5
A: tagcttttgataggatgcaggggctgtattctttcacaaaattttttaa
B: tagcttttgacaggatgcaagggttgtattctttcaccgaattttttaa
   ==========^        ^   ^             ^^==========
   15742    15899     36    none      1      1
     Errors = 1
A: aatcttttagcatcaacccct
B: aatcttttagtatcaacccct
   ==========^==========
   15814    15971     32    none     36     36
     Errors = 3
A: tttgcagaatctagaatttttgcaatccttctttttgagcatgtttgatcttgccc
B: tttgcagaatttagaatttttgcaatccttttttttgagcatgttggatcttgccc
   ==========^                   ^              ^==========
   15869    16026     34    none     23     23
     Errors = 3
A: aagaagccttggaagatatgaatgcgatttctagcgcgattaa
B: aagaagccttagaagacatgaatgcgatttctggcgcgattaa
   ==========^     ^               ^==========
   15925    16082     23    none     22     22
     Errors = 4
A: ccttataccctaaagcttttagtttgctagactttaaagaaa
B: ccttataccccaaagattttagtttgctggattttaaagaaa
   ==========^    ^            ^  ^==========
   15967    16124     50    none     19     19
     Errors = 2
A: ttaaaagaacttcatctaaccaattgggtttgagtttag
B: ttaaaagaacctcatctaaccaattgggcttgagtttag
   ==========^                 ^==========
   16018    16175     38    none      1      1
     Errors = 1
A: ctttgaatgatgcgttcaact
B: ctttgaatgacgcgttcaact
   ==========^==========
   16075    16232     29    none     19     19
     Errors = 4
A: tgataaacctggatactatcacccaaaatcctaaagact
B: tgataaacctagatgcgatcacccaaaaccctaaagact
   ==========^   ^ ^           ^==========
   16132    16289     38    none     28     28
     Errors = 4
A: tagcctattatttgttttataaaatcttagaagaatccaggaaaaacg
B: tagcctattacttgttttataagatcttagaagagtctaggaaaaacg
   ==========^           ^           ^  ^==========
   16171    16328     26    none      1      1
     Errors = 1
A: ttttagacgagtttaaatcct
B: ttttagacgaatttaaatcct
   ==========^==========
   16201    16358     35    none      4      4
     Errors = 2
A: aaaacgatttattgaacactaaaa
B: aaaacgatttgttaaacactaaaa
   ==========^  ^==========
   16237    16394     35    none      1      1
     Errors = 1
A: cgcaagccagaaaagctaatg
B: cgcaagccaggaaagctaatg
   ==========^==========
   16303    16460     38    none     31     31
     Errors = 4
A: ccttgcaagatatttaccaa-ttaagcggggttaaaaacgctcatagttttt
B: ccttgcaagacatttaccaactta-gcggggttaaaaacgcccatagttttt
   ==========^         ^   ^                ^==========
   16342    16499     20    none      1      1
     Errors = 1
A: tcattttgtacccgcaaaaaa
B: tcattttgtatccgcaaaaaa
   ==========^==========
   16363    16520     63    none      1      1
     Errors = 1
A: acgctagggagttgaaacaca
B: acgctagggaattgaaacaca
   ==========^==========
   16427    16584     43    none      1      1
     Errors = 1
A: aaacacccctttgtatgccag
B: aaacacccctctgtatgccag
   ==========^==========
   16474    16631     24    none      4      4
     Errors = 2
A: gtaacgggagctctaacatgattg
B: gtaacgggagttccaacatgattg
   ==========^  ^==========
   16508    16665     22    none     10     10
     Errors = 3
A: gagtttggagagtttggggcgttatttgaa
B: gagtttggagggcttggggtgttatttgaa
   ==========^ ^      ^==========
   16548    16705     42    none     18     18
     Errors = 5
A: tctttaattcggattctagccatgtgagtaaagtgaaa
B: tctttaattcagattccagtcatgtcaataaagtgaaa
   ==========^     ^  ^     ^ ^==========
   16653    16795     83    none     63     48
     Errors = 22
A: cagagtggcgcgagaaacttttgaggagctagttttaaaaagttagttttgttttaaaaa
B: cagagtggcgtgagaaacttttgaagagttagttt-aaaaagtcagttt-----caa---
   ==========^             ^   ^      ^       ^     ^^^^^^  ^^^
A: gttaatactattttgaagcactc
B: -t-a-t-c-gt-gtgaagcactc
   ^ ^ ^ ^ ^^ ^^==========
   16786    16928     42    none     50     50
     Errors = 5
A: ttaccctaaaatcctattgcataggtctaaataagagcttagggatcattttagccataa
B: ttaccctaaagtcctattgcataggtccaaataagagcttggggatcattttaaccatag
   ==========^                ^            ^            ^     ^
A: aaagcttatg
B: aaagcttatg
   ==========
   16847    16992    162    none     19     22
     Errors = 7
A: acgctcaaat-agtcaagcaaa-aa-aatatcaattaaaagg
B: acgctcaaattagtcaagcaaacaagcaaaaaaattaaaagg
   ==========^           ^  ^^ ^ ^^==========
   17010    17155     59    none      1      1
     Errors = 1
A: aacaattcactaagaaaaaaa
B: aacaattcacgaagaaaaaaa
   ==========^==========
   17100    17245     29    none     31     31
     Errors = 5
A: ctttatacgccagagattaccagacttctttaggggtattagatcaagccg
B: ctttatacgcaagggattataagacttctttaggggtattggatcaagccg
   ==========^  ^     ^^                   ^==========
   17142    17287     47    none     13     13
     Errors = 2
A: ttgataaaacgcaaagcgcttttacaagagggg
B: ttgataaaacccaaagcgctttcacaagagggg
   ==========^           ^==========
   17190    17335    107    none      1      1
     Errors = 1
A: atgataatgtgcgcgcttatg
B: atgataatgtacgcgcttatg
   ==========^==========
   17313    17458     50    none     16     16
     Errors = 3
A: aattcaaccgtgcgaacgaacgccagcgcagggcta
B: aattcaaccgcgcgaatgaacgccaacgcagggcta
   ==========^     ^        ^==========
   17364    17509     46    none      1      1
     Errors = 1
A: ccattaaagagatcgattcta
B: ccattaaagaaatcgattcta
   ==========^==========
   17412    17557     59    none      2      2
     Errors = 2
A: cgctctagggtggaagtgagcg
B: cgctctagggcagaagtgagcg
   ==========^^==========
   17478    17623     23    none      7      7
     Errors = 2
A: aagcttatcagggcttacttaacccgg
B: aagcttatcaaggcttgcttaacccgg
   ==========^     ^==========
   17502    17647     30    none      1      1
     Errors = 1
A: tttcgtatctctcagggttgt
B: tttcgtatctttcagggttgt
   ==========^==========
   17533    17678     55    none      1      1
     Errors = 1
A: aaatggggatgagaataaggg
B: aaatggggataagaataaggg
   ==========^==========
   17595    17740    116    none      7      7
     Errors = 3
A: aaagcccttttgtagcccaagacttgg
B: aaagccctttcgtggctcaagacttgg
   ==========^  ^  ^==========
   17712    17857     20    none      1      1
     Errors = 1
A: tttttatgatcgattcggttt
B: tttttatgattgattcggttt
   ==========^==========
   17736    17881     47    none      4      4
     Errors = 3
A: ataacgtgagtatagccttgccca
B: ataacgtgagcgtggccttgccca
   ==========^^ ^==========
   17808    17953     56    none     25     25
     Errors = 4
A: aaaatttcactctcaaagatggagaaaaagtaacgccctttgaca
B: aaaatttcaccctcaaggacggagaaaaagtaacaccctttgaca
   ==========^     ^  ^              ^==========
   17865    18010     77    none      1      1
     Errors = 1
A: tcaggaagcagttgccctaca
B: tcaggaagcaattgccctaca
   ==========^==========
   17970    18115     32    none     28     28
     Errors = 3
A: actattatttggggtttgttggagggttagtaacttccttgtattcag
B: actattatttagggtttgttggcgggttagtaacttcgttgtattcag
   ==========^           ^              ^==========
   18008    18153     39    none      6      6
     Errors = 2
A: ttgcagacactagaagcacgagcatt
B: ttgcagacaccagaaacacgagcatt
   ==========^    ^==========
   18048    18193    125    none      1      1
     Errors = 1
A: tcatgcgcattaaaaacaaag
B: tcatgcgcatcaaaaacaaag
   ==========^==========
   18196    18341     31    none     23     23
     Errors = 3
A: aattgctttctgggtttgtagcagccccacaaatcttttgctc
B: aattgctttcagggtttgtaacagccccacaagtcttttgctc
   ==========^         ^           ^==========
   18237    18382     25    none     10     10
     Errors = 2
A: atattttatacgtgcgcagttttaaaaacg
B: atattttatatgtgcgcagctttaaaaacg
   ==========^        ^==========
   18296    18440     31    none     34     33
     Errors = 6
A: gttttgagtcgtttaaaatgatttcaaaacccccaccaaaggaa-ttttagtttt
B: gttttgagtcatttaaaatgattccaaaaccccc-c-aaagaaatttttagtttt
   ==========^            ^          ^ ^    ^  ^==========
   18328    18472     93    none      1      1
     Errors = 1
A: ggcattaaacgcaaacacgat
B: ggcattaaacacaaacacgat
   ==========^==========
   18440    18584     53    none     19     19
     Errors = 2
A: ttacgagtttgcataaaaataacgagttacaattgttgt
B: ttacgagtttacataaaaataacgagttgcaattgttgt
   ==========^                 ^==========
   18494    18638     41    none      1      1
     Errors = 1
A: cggtcaatgtttttaagatcc
B: cggtcaatgtctttaagatcc
   ==========^==========
   18536    18680     35    none      1      1
     Errors = 1
A: gcaatctcaccatcattagcc
B: gcaatctcactatcattagcc
   ==========^==========
   18611    18755     35    none     40     40
     Errors = 6
A: tcgttgaggggct-aatcattataagagaactcaccattcccttgattgatatgaaaaaa
B: tcgttgaggg-cttgatcattataagagagctcaccattcctttgattgacatgaaaaaa
   ==========^  ^^              ^           ^        ^=========
A: t
B: t
   =
   18668    18812     26    none     22     22
     Errors = 3
A: gccaaaacaaaaacaaggatttacgcccttataggatagaaa
B: gccaaaacaagagcaaggatttacgcccttacaggatagaaa
   ==========^ ^                  ^==========
   18704    18848     26    none     10     10
     Errors = 2
A: aaggcgaagatgatattgttatgatttgtg
B: aaggcgaagacgatattgtcatgatttgtg
   ==========^        ^==========
   18731    18875     86    none      1      1
     Errors = 1
A: ctcgctggactataggggtta
B: ctcgctggaccataggggtta
   ==========^==========
   18821    18965     35    none      4      4
     Errors = 2
A: ggggatctgcaggcaataacaaac
B: ggggatctgctgggaataacaaac
   ==========^  ^==========
   18857    19001    125    none      1      1
     Errors = 1
A: gctattttgatgggcgcttgg
B: gctattttgacgggcgcttgg
   ==========^==========
   19007    19151     41    none     25     25
     Errors = 4
A: gcgttttgcttgctgatgactccccaagcgttttgaaaaccatgc
B: gcgttttgctcgctgatgattccccaagcgtcttaaaaaccatgc
   ==========^        ^           ^  ^==========
   19055    19199     21    none      7      7
     Errors = 3
A: gcgtcaagcatatagattttatcaatg
B: gcgtcaagcacattgactttatcaatg
   ==========^  ^  ^==========
   19097    19241     41    none     21     21
     Errors = 3
A: taaaaccttactagagcatttattcaaccccacaaccgatg
B: taaaaccttattagagcatttgttcaacccaacaaccgatg
   ==========^          ^        ^==========
   19151    19295     23    none     13     13
     Errors = 2
A: ttaccgatttggaaatgccagaggcgagcggtt
B: ttaccgatttagaaatgccagaagcgagcggtt
   ==========^           ^==========
   19175    19319     35    none      1      1
     Errors = 1
A: aagtgatcaagcaggttaaaa
B: aagtgatcaaacaggttaaaa
   ==========^==========
   19214    19358     23    none      4      4
     Errors = 2
A: caaaaatccctatcgtggtcaatt
B: caaaaatccccattgtggtcaatt
   ==========^  ^==========
   19241    19385     44    none      4      4
     Errors = 2
A: ctatgagcgggagttctaatgaag
B: ctatgagcggcagctctaatgaag
   ==========^  ^==========
   19316    19460     41    none     31     31
     Errors = 3
A: atgatttcatttccaagtctaaccccaaagacatccagcgagtggttaagc
B: atgatttcatctccaagtctaaccctaaagacatccagcgggtggttaagc
   ==========^              ^              ^==========
   19382    19526     52    none     25     25
     Errors = 4
A: aaaatacagcactatccccaccccttgctacgtgttagagagcga
B: aaaatacagcgctatccccaccccttgctatgcgctagagagcga
   ==========^                   ^ ^ ^==========
   19468    19612    116    none     34     34
     Errors = 5
A: tcgtgcgccaacaaagtggggcaaaggtcttgcttgctttaaaggggtatgcgt
B: tcgtgcgccagcaaagcggggcaaaggttttgctcgctttaaaagggtatgcgt
   ==========^     ^           ^     ^        ^==========
   19588    19732     23    none      4      4
     Errors = 2
A: gagagagccacaaagaaatttgcg
B: gagagagccataaggaaatttgcg
   ==========^  ^==========
   19615    19759     44    none      4      4
     Errors = 2
A: atagcccggctttcaaagaggctg
B: atagcccggcctttaaagaggctg
   ==========^  ^==========
   19723    19867     44    none     64     64
     Errors = 7
A: cgacaagcattatttttaactctttttaccaatacgctacctataaagacaggattttag
B: cgacaagcatcattttcaactcttttcaccaatacgccacctacaaagacaggattttag
   ==========^     ^         ^          ^     ^                
A: ataaaaacaagcaattagaaaact
B: acaaaaacaagcagttagaaaact
    ^           ^==========
   19777    19921     42    none     10     10
     Errors = 3
A: gtttgaggataaaccctctctatagcgaag
B: gtttgaggattaaccccctttatagcgaag
   ==========^     ^  ^==========
   19820    19964     37    none      1      1
     Errors = 1
A: atgctctaaagtgagccggtt
B: atgctctaaaatgagccggtt
   ==========^==========
   19864    20008     62    none      7      7
     Errors = 3
A: gatttgaaaagggggtgaaagagcatg
B: gatttgaaaaaggagtcaaagagcatg
   ==========^  ^  ^==========
   19927    20071     29    none      1      1
     Errors = 1
A: agcaaaacgctgacgctttgt
B: agcaaaacgccgacgctttgt
   ==========^==========
   19975    20119     50    none     19     19
     Errors = 4
A: tagagcatgtagaaaagcatttcaggccctatttagaaa
B: tagagcatgtggaaaggcatttcaagccttatttagaaa
   ==========^    ^        ^   ^==========
   20028    20172     27    none      3      3
     Errors = 2
A: atcatatcactaagagcgattat
B: atcatatcaccaggagcgattat
   ==========^ ^==========
   20104    20248     59    none     49     49
     Errors = 6
A: atttgctcatccaaacgattaaggatttcaaagaacgctatcataatatagaagtgattt
B: atttgctcattcaaacgattaaggattttaaagaacgctaccacaatacagaagtgatct
   ==========^                 ^           ^  ^    ^         ^=
A: tagagcctg
B: tagagcctg
   =========
   20164    20308     30    none      1      1
     Errors = 1
A: gcgtgatagacatcgttcaaa
B: gcgtgatagatatcgttcaaa
   ==========^==========
   20195    20339     35    none      1      1
     Errors = 1
A: aattgcgattctagacgcttc
B: aattgcgattttagacgcttc
   ==========^==========
   20231    20375     22    none      1      1
     Errors = 1
A: gcccgattgcttagaaatgcc
B: gcccgattgcctagaaatgcc
   ==========^==========
   20288    20432     43    none     35     35
     Errors = 9
A: atcgccctagcatttttaaagtctccgtagaaaatgatgaagagcttattgaagt
B: atcgccctagtattcttaaggtttctgtagaaaacgatgaggaaattattgaagt
   ==========^   ^    ^  ^  ^        ^     ^  ^^==========
   20356    20500     89    none     25     25
     Errors = 3
A: cgttttcttattttttaggcggccctacttgtttagcgggggatt
B: cgttttcttactttttaggcggccccacttgtttggcgggggatt
   ==========^              ^        ^==========
   20449    20593     26    none      4      4
     Errors = 2
A: attatacgattgtcaaaaacaact
B: attatacgatcgtgaaaaacaact
   ==========^  ^==========
   20576    20774     20    none    101    155
     Errors = 67
A: atggcgtgccgctcccaagcctggctagattggatcaacaagggtttaaaatccttaaaa
B: atggcgtgccactgccaagcctggctaaaatagattcgcaaggttttaagatcctcaaaa
   ==========^  ^             ^ ^ ^   ^^^     ^     ^     ^    
A: acttttcttatgaagactataaaaacag-aa--a----ct-aa--a--gc-ttttgatta
B: gcttttcttatgaagattataaaaacaggaattaagatctcaattaaagccttttgatta
   ^               ^           ^  ^^ ^^^^  ^  ^^ ^^  ^         
A: agg-----------------------c------------------tttttggggc
B: aggttttttgattaaggttttttaatcaagtttttttaattaaggtttttggggc
      ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ ^^^^^^^^^^^^^^^^^^==========
   20642    20840     38    none     46     46
     Errors = 8
A: ttgtaaaaaggcttacgcacaacattccaacgccaagcccggtcagcaccgcgccaatgg
B: ttgtaaaaagacccacgcacaacattccagtgccaagcccggccaacaccgcgccgatgg
   ==========^ ^^               ^^           ^  ^         ^====
A: tgtgca
B: tgtgca
   ======
   20726    20924     20    none     46     46
     Errors = 5
A: cgagcatggtcaaagggactaggggcaagagccaaaagtattttttaaaagaatagcggc
B: cgagcatggttaaagggattaggggcaagagccacaagtattttttaacagaataacggc
   ==========^       ^               ^             ^      ^====
A: gcatta
B: gcatta
   ======
   20747    20945     47    none      1      1
     Errors = 1
A: aaaacgccaccgccaaaccca
B: aaaacgccactgccaaaccca
   ==========^==========
   20795    20993     29    none      1      1
     Errors = 1
A: tgaaattacctccataagggc
B: tgaaattacccccataagggc
   ==========^==========
   20831    21029     28    none      7      7
     Errors = 2
A: aacgctgatcgttgattgttacatggt
B: aacgctgatcattgatcgttacatggt
   ==========^     ^==========
   20879    21077     47    none     20     20
     Errors = 5
A: cttttggtggtgtgcgtgagaagggttgtagcgatagaag
B: cttttggtggcatgcgtgagaaaagttgtggcgatagaag
   ==========^^          ^^     ^==========
   20930    21128     41    none      4      4
     Errors = 2
A: catctctttggattaagggaatcg
B: catctctttgaatcaagggaatcg
   ==========^  ^==========
   21011    21209     23    none     40     40
     Errors = 9
A: taaagcgcgcataatgctcggtgaaatgaaacattaaaggcacgctaggctgtttaggga
B: taaagcgcgcgtaatgctcggtgaaatgaagcgccaaaggtacgctttggtgtttaggga
   ==========^                   ^ ^^^     ^     ^^ ^==========
   21071    21269     26    none     37     37
     Errors = 8
A: tagggaaaggcgcaaaaatgcctaataaaatcaagcccaaactgagcgctaacaaag
B: tagggaaagggataaaaacacccaataaaatcaaacccaaactgagtgctaacaaag
   ==========^^^     ^^  ^           ^           ^==========
   21098    21296     78    none      1      1
     Errors = 1
A: aaaagcttttgggcaggcttt
B: aaaagcttttaggcaggcttt
   ==========^==========
   21177    21375     21    none      1      1
     Errors = 1
A: gtttaagcagatctaaagaag
B: gtttaagcaggtctaaagaag
   ==========^==========
   21221    21419     27    none     23     23
     Errors = 6
A: gcgataaacaacgcttgggtttttaaaatccaaaaacacccct
B: gcgataaacagcgctaggggttttaaaatcttcaaacacccct
   ==========^    ^   ^          ^^^==========
   21252    21450     41    none      4      4
     Errors = 4
A: tatggaaaatcacattttgattaa
B: tatggaaaatggtgttttgattaa
   ==========^^^^==========
   21321    21519     20    none     28     28
     Errors = 8
A: tggaatgcttttctttgaaaggctcattagcataaacgataaagggga
B: tggaatgcttctctttaaaaagatcgttggcataaagaataaagggga
   ==========^     ^   ^ ^  ^  ^       ^^==========
   21348    21546     32    none      7      7
     Errors = 2
A: tctcgtattgttctttgggggcgatgc
B: tctcgtattgctctttaggggcgatgc
   ==========^     ^==========
   21399    21597     23    none     19     19
     Errors = 5
A: catgcaaatagaacgcttcttcgcccaaactttcgccat
B: catgcaaataatacgccccttcgcccaagctttcgccat
   ==========^^    ^^          ^==========
   21423    21621     44    none      1      1
     Errors = 1
A: cgcttaaatagatcattaagg
B: cgcttaaataaatcattaagg
   ==========^==========
   21489    21687     68    none     22     22
     Errors = 4
A: tgctaatgatcttatctagcagatagtcgttgtaaaaaatgg
B: tgctaatgattttgtctaacagatagtcgttataaaaaatgg
   ==========^  ^    ^            ^==========
   21564    21762     38    none      7      7
     Errors = 2
A: cagcgcttgagcaataaggcttaaaca
B: cagcgcttgaacaatagggcttaaaca
   ==========^     ^==========
   21624    21822     22    none     22     22
     Errors = 3
A: ctttgttgtcgtagtttgggccatgcgagcctgcaaggtgta
B: ctttgttgtcatagttggggccatgcgagccggcaaggtgta
   ==========^     ^              ^==========
   21723    21921     44    none     77     77
     Errors = 10
A: atgagcaagacattttcattagagtgttcttttaaaaggtcaggcaaattataaagtaaa
B: atgagcaagatgttttcattagagcgttcttttaaaaggttgggcaaattatagagcaag
   ==========^^            ^               ^^           ^  ^  ^
A: gattcatcataaggagcgatcgcttcacaattggggc
B: gattcatcataaggggcgatcgcttcgcaattggggc
                 ^           ^==========
   21795    21993     25    none     28     28
     Errors = 3
A: taagatagcttgtaaccttaacattcttttcgccgtcgttcgcgctat
B: taagatagctggtaaccttaacgttcttttcgccgtcattcgcgctat
   ==========^           ^              ^==========
   21862    22066     70    none     42     48
     Errors = 11
A: aagactttgataccggctttagtcaagtaagttggcaaattttcataagcg------ttg
B: aagactttgacacccgctttagtcaagtaagtgggcaagttttcataagcgcccaagctg
   ==========^   ^                 ^     ^            ^^^^^^^==
A: tttttaaa
B: tttttaaa
   ========
   21971    22175     20    none     39     39
     Errors = 9
A: aagtggcgttgaaaagagtgagttcattatcggctaaacgcttgcttagtcttggggtg
B: aagtggcgttaaaaagggtgagttcatgattttctaagcgtttgcttaatcttggggtg
   ==========^     ^          ^  ^^^    ^  ^       ^==========
   21992    22196     21    none      1      1
     Errors = 1
A: gtgggtttttgatagccataa
B: gtgggtttttcatagccataa
   ==========^==========
   22023    22227     35    none     10     10
     Errors = 5
A: gggcgtaatt-atgtttcctagcgctttcgc
B: gggcgtaattgctctttc-tggcgctttcgc
   ==========^^ ^    ^ ^==========
   22131    22335     25    none     73     73
     Errors = 7
A: caaacgaatgggaatgattgggtgaaaaaagagggagcggcttgatggtgggggcgaaaa
B: caaacgaatgagaatggttgggcgaaaagagagggagcggcttgatagtgggggcgaaaa
   ==========^     ^     ^     ^                 ^             
A: atttgagagcgctcactctaaaagcgttcacgc
B: atttaagagcgctcactctaaaggcgttcacgc
       ^                 ^==========
   22158    22362     52    none      2      2
     Errors = 2
A: gcgaagggcaaaattaagcccc
B: gcgaagggcaggattaagcccc
   ==========^^==========
   22218    22422     29    none      8      8
     Errors = 5
A: caatttttagtgttagctaaagcgctag
B: caatttttagcgttcataaaagcgctag
   ==========^   ^^^^==========
   22269    22473     86    none     22     22
     Errors = 4
A: taaacactaacgccaagatcgctaaaaagggcgcttttttag
B: taaacactaaagccaagatcgctaagaatggtgcttttttag
   ==========^              ^  ^  ^==========
   22356    22560     47    none      1      1
     Errors = 1
A: cgaataatttgacgctcaaaa
B: cgaataatttaacgctcaaaa
   ==========^==========
   22404    22608     35    none      1      1
     Errors = 1
A: ttaagacattacccatcatgc
B: ttaagacattgcccatcatgc
   ==========^==========
   22473    22677     30    none     34     34
     Errors = 6
A: ccttataagcgctaatgaaatagaaagcaacggaattgagcaggctaaaaacta
B: ccttataagcactaatgaaatagaaagcgacagaattgagccaactaaaaacta
   ==========^                 ^  ^         ^^^==========
   22504    22708     55    none      1      1
     Errors = 1
A: acgcatcaaagaagcagagat
B: acgcatcaaataagcagagat
   ==========^==========
   22584    22788     27    none     25     25
     Errors = 6
A: aaaaaagcaccacaaccatcatggcgataaaactgacctggttgc
B: aaaaaagcacgataataatcatggctataaaactaacctggttgc
   ==========^ ^  ^^        ^        ^==========
   22612    22816     73    none      1      1
     Errors = 1
A: ataaacataaacgaacaaagg
B: ataaacataagcgaacaaagg
   ==========^==========
   22715    22919     31    none     30     30
     Errors = 3
A: aacttaggggttttaaaaacctcagatggaataatgatgccaaacacgcc
B: aacttaggggctttaaaaacttcagatggaataatgatgtcaaacacgcc
   ==========^         ^                  ^==========
   22747    22951     37    none      1      1
     Errors = 1
A: atcaatcttaggattatatcg
B: atcaatcttatgattatatcg
   ==========^==========
   22840    23044     21    none     56     56
     Errors = 9
A: tggtttatttaaag--tggaaagtgctttttttagggtggttgcatttaagagctttaaa
B: tggtttattttaagggtggaaagcg-tttttt-agggtggttgcgtttaagagttttaaa
   ==========^   ^^       ^ ^      ^           ^        ^      
A: gcgcgttggttgtaggat
B: gcgcgtttgttgtaggat
          ^==========
   22862    23066     24    none      1      1
     Errors = 1
A: tcatcacgcctcatagttagg
B: tcatcacgccccatagttagg
   ==========^==========
   23052    23258     27    none    166    168
     Errors = 54
A: ggggcaaatc----caaataaggagcatgccatgaagtgtaaaagtggcaaacgctcttg
B: ggggcaaatctgttcttaaaagg-gtttatcatgaaaagaaagcatgataaaaactcttg
   ==========^^^^ ^^ ^    ^ ^^ ^^      ^^ ^  ^^^  ^^   ^^      
A: gaaactattataccttgaaatttctttttcttggtttaaggtagtgtttttgat-gaaac
B: gttagtattatacattaaaatctcttttaaggggtttaaagtggtcttttctatagaaaa
    ^^ ^        ^  ^    ^      ^^^^       ^  ^  ^    ^^  ^    ^
A: gctaattt-ctaag--agcgttcccctaagcctaaaaaacttaggggtttccttatgtga
B: g-taattttattagccaaagttcccctaagcctaaaaagcttaggggtttcctt--gtg-
    ^      ^^ ^  ^^ ^^                   ^               ^^   ^
A: agcgggtttgtcct
B: -ggtggtttgtcct
   ^ ^^==========
   23142    23302     25    none     63     17
     Errors = 49
A: ggggcgttttttggttagtggagcgcgcgaacgctaaagatgtttggggtttcttgcttg
B: ggggcgtttt-------------c-----a----t-----tg---gg--tt-at------
   ==========^^^^^^^^^^^^^ ^^^^^ ^^^^ ^^^^^  ^^^  ^^  ^^ ^^^^^^
A: ggtggtttaaaatgatcgcttga
B: -------aaaaaggatcgcttga
   ^^^^^^^^    ^==========
   23179    23338     53    none     12     11
     Errors = 3
A: gctaattttttatttagattgcaaaaaacgcc
B: gctaattttt-atttagatagtaaaaaacgcc
   ==========^        ^ ^==========
   23233    23392     22    none      1      1
     Errors = 1
A: aaaaaactttgtttggtggaa
B: aaaaaactttatttggtggaa
   ==========^==========
   23334    23548     71    none     79    134
     Errors = 58
A: aattaaaaaa----ag----ctaaaag----a--aaa-gt-------c-agt------t-
B: aattaaaaaagtttagaaaaataaaagctttatgaaaagttaaaaagcgagtgggaagtc
   ==========^^^^  ^^^^^      ^^^^ ^^   ^  ^^^^^^^ ^   ^^^^^^ ^
A: a---aaaa--gattaaaccccctaaaaag-g-g-----a-----g---t---ttaaaaag
B: agcgaaaaaagattaaacccccaaaaaagagagggttcaaaaaagaaatcccttaaaaag
    ^^^    ^^            ^      ^ ^ ^^^^^ ^^^^^ ^^^ ^^^        
A: g-agttt-aagcttttagtaagcaaacacatagt
B: ggagttttaagcttttagtaagcgaacacatagt
    ^     ^               ^==========
   23406    23620     20    none      1      1
     Errors = 1
A: aatagtaatttgtgttgatcg
B: aatagtaattcgtgttgatcg
   ==========^==========
   23502    23716     23    none     76     76
     Errors = 24
A: tggggatcttcacgcctaattccatgccatgttgcgc-gctatgatcag-cgc-ctattc
B: tggggatctttgtgcctagttcaatgccatgttgggccgc-gttatcggtcgctctatgc
   ==========^^^     ^   ^           ^  ^  ^^ ^   ^ ^   ^    ^ 
A: ttttatttctggcgagattggtccttaagcccagattga
B: tttt-t-cctagcgaggttcattctcaaacccagattga
       ^ ^^  ^     ^  ^^ ^  ^  ^==========
   23565    23779     46    none     40     40
     Errors = 8
A: agaattggaagttagaggtgttgattttagctttataataattgttcacattcgctaaat
B: agaattggaaattcgccgtgttgattttggccttataataattattcacgttcgctaaat
   ==========^  ^ ^^           ^  ^           ^     ^==========
   23615    23829     27    none      4      4
     Errors = 4
A: gtcccggctagttggataccgcca
B: gtcccggctaaggcgataccgcca
   ==========^^^^==========
   23643    23857     62    none      1      1
     Errors = 1
A: caaaagaaattttattgtgtt
B: caaaagaaatcttattgtgtt
   ==========^==========
   23742    23956     35    none     37     37
     Errors = 6
A: ccacgccataagtccaaacatcagaatcggagttgaaaaattgggacttgttatagg
B: ccacgccataggtccagacatcagaagaggcgttgaaaaattgggatttgttatagg
   ==========^     ^         ^^  ^               ^==========
   23784    23998     53    none      7      7
     Errors = 3
A: caaagccgtagtatctcgcgccccatc
B: caaagccgtaataccttgcgccccatc
   ==========^  ^  ^==========
   23844    24058     37    none      7      7
     Errors = 2
A: cttgaaagccaatcccattcatcgcgc
B: cttgaaagcctatcccgttcatcgcgc
   ==========^     ^==========
   23892    24106     53    none     11     11
     Errors = 5
A: gcggcgatta-gcccggcgcgtctgaaagggt
B: gcggcgattaagccag-cacgcctgaaagggt
   ==========^   ^ ^ ^  ^==========
   23988    24202     56    none     43     43
     Errors = 5
A: gagaatggatgttggagtcaatgtagtaattatcctgtatgccttgcgggctgttagggt
B: gagaatggatattggagtcaatatagtagttatcctgtatgccttgtgggctattagggt
   ==========^           ^     ^                 ^     ^=======
A: tag
B: tag
   ===
   24051    24265     32    none      7      7
     Errors = 4
A: caggcaagctagagagcgccgctgtga
B: caggcaagcttgaaatggccgctgtga
   ==========^  ^ ^^==========
   24105    24319     20    none     22     22
     Errors = 5
A: gttcgcctagctttttg-tactggccgctgaaattcgctaaag
B: gttcgcctag-tttttgatactgactgctgaagttcgctaaag
   ==========^      ^     ^ ^      ^==========
   24150    24364     28    none     25     25
     Errors = 4
A: tgtaggcgagatttcgcgcattatggattcgctccgcttggtcgc
B: tgtaggcgaggttgcgcgcgttatggattcgctcggcttggtcgc
   ==========^  ^     ^              ^==========
   24319    24530     22    none    141    138
     Errors = 19
A: gcgatgctgttttttagattcgttacggtttctcccacatacgcgcagccggctccccaa
B: gcgatgctgtcttttagattcgttacggtctctcccacatacgcgcaaccggctccccaa
   ==========^                  ^                 ^            
A: gtgttagaagtaaccgtgccagatggcgtgccacggagattgccgtcgctacccttttca
B: gtgttatcagttaccgtgccggatggcgtgccacggagatggccgt-tttgcactt--ca
         ^^   ^        ^                   ^     ^^^ ^ ^   ^^  
A: tggcatactcctaaagagtctttcacgaacgctgcagggat
B: tggcacacccctaaagagtcttttacgaactctgcagggat
        ^  ^              ^      ^==========
   24357    24568     27    none     16     16
     Errors = 2
A: tttcaaagtccttcaccactgcttgagcgcggttta
B: tttcaaagtctttcaccactgcttgggcgcggttta
   ==========^              ^==========
   24387    24598     52    none      3      3
     Errors = 2
A: cgcttgcgctctagcgttagcga
B: cgcttgcgctttggcgttagcga
   ==========^ ^==========
   24489    24700     21    none     50     50
     Errors = 8
A: gggttgaatg-ctttcccagtgtctaggttgtgctggttttgcgcgttggcggtaacgat
B: gggttgaatgtctt-cccggtgtctaggttgcgctggttttgcgcgtttgcagcaacgat
   ==========^   ^   ^            ^                ^  ^ ^      
A: tttggattgct
B: cttggattgct
   ^==========
   24511    24722     55    none      1      1
     Errors = 1
A: tacggctatttcagcgttttt
B: tacggctattgcagcgttttt
   ==========^==========
   24861    25003     28    none    295    226
   No extension
Region:       5203 .. 24565           5395 .. 24776         1254 / 19382       6.47%
   24900    25042     26    none     11     11
     Errors = 4
A: ggaatatcttgcccgcttgct-ccaaaagcct
B: ggaatatcttttccgct-gctcccaaaagcct
   ==========^^     ^   ^==========
   25094    25245     51    none    168    177
     Errors = 46
A: tgatttgataggctttattgatttttgcgtaattttcagtggatataccgctccactttc
B: tgatttgataagctttattgattttcgcgtaattttcagtggataaaatgctgtatggtc
   ==========^              ^                   ^ ^^   ^^ ^^^  
A: ctggttcataa-aatgaat-c-gcaagcaatggtagt-cc-ccccatt--t--gacggca
B: ctggttcataaccagtagtgccacaagtaatggtagtgcctccccattgatttgaaggcg
              ^^ ^^ ^ ^ ^^    ^         ^  ^       ^^ ^^  ^   ^
A: catt-ttcaaaggtttggacgcccccatttttatttttgtcagagccagggccacaaacg
B: tgttgtggaaag-tttgaacgcccccatttttgcttgtgtctttaccgggaccacaaggg
   ^^  ^ ^^    ^    ^              ^^  ^    ^^^^  ^  ^      ^^ 
A: ctgatcgaatagctcatg
B: ctgatcgcatagctcatg
          ^==========
   25146    25297     47    none      1      1
     Errors = 1
A: ctaaaagcaccgcttgatacg
B: ctaaaagcacggcttgatacg
   ==========^==========
   25197    25348     29    none      4      4
     Errors = 2
A: aattcttcgcactagcgttcaaat
B: aattcttcgcgctcgcgttcaaat
   ==========^  ^==========
   25227    25378     23    none      1      1
     Errors = 1
A: cgttattgatagcgttggggt
B: cgttattgatggcgttggggt
   ==========^==========
   25308    25459     23    none     58     58
     Errors = 9
A: cggactgcctaataagagtgtttagggcactataactcgttaaaagattgttcagtcttt
B: cggactgcctgatgagagcgtttaggacgctataattcgttaaaaggttgttcaatcttt
   ==========^  ^    ^       ^ ^      ^          ^       ^     
A: catagctatctgaaagat
B: catagctgtctgaaagat
          ^==========
   25332    25483     41    none      1      1
     Errors = 1
A: gaatgcctttagtgtttttca
B: gaatgcctttggtgtttttca
   ==========^==========
   25377    25528     95    none      4      4
     Errors = 2
A: tttgatagcccgcactcacaaaaa
B: tttgatagccggcgctcacaaaaa
   ==========^  ^==========
   25481    25632     46    none      9      9
     Errors = 5
A: tttctccttttattacttgaaataagatt
B: tttctcctttactttattaaaataagatt
   ==========^^  ^^  ^==========
   25533    25684     36    none      6      6
     Errors = 3
A: tgtgtctttaggtgaaaccataccgc
B: tgtgtctttaagtaagaccataccgc
   ==========^  ^ ^==========
   25585    25736     37    none     16     16
     Errors = 2
A: agtataaattcatgggattttgatattaattaggcg
B: agtataaattaatgggattttgatactaattaggcg
   ==========^              ^==========
   25636    25785     55    none     14     12
     Errors = 5
A: aaaaaaaaaaaggtttttgtgttatttctaaaca
B: aaaaaaaaaa-gatttt-gtggtgtttctaaaca
   ==========^ ^    ^   ^ ^==========
   25933    26129     28    none    242    289
   No extension
Region:      24861 .. 25690          25003 .. 25839           81 / 837         9.68%
   26078    26315     30    none    117    158
     Errors = 73
A: tttgcatgcggttagtaaaaaa--tt--accg-----ctcgct-tggtg---c-------
B: tttgcatgcgattattaaaaaagcttggtgcgagattctcactcttgtgaagcacccaaa
   ==========^   ^       ^^  ^^^^  ^^^^^   ^  ^ ^   ^^^ ^^^^^^^
A: -g--a--gacgctt---att-ct--t------t-t-aaa--caa---ggctttgattcgt
B: cgctaaagacgattgggatttctgctaaggagtcttaaatttaaaaaggctttga-gcgt
   ^ ^^ ^^    ^  ^^^   ^  ^^ ^^^^^^ ^ ^   ^^^  ^^^        ^^   
A: ttcttaaagct-taaccaacgcttctattcaacgctctg-ttaagacaaagccttaatcc
B: tccttaaaactatcatcaacgctt-tatt-aaaacaaagccta-gcctaa-cattaatcc
    ^      ^  ^ ^ ^        ^    ^  ^^ ^^^ ^^  ^ ^ ^  ^ ^=======
A: cct
B: cct
   ===
   26109    26346     38    none      1      1
     Errors = 1
A: gtcttgggcgtgtgatcctgg
B: gtcttgggcgcgtgatcctgg
   ==========^==========
   26148    26385     22    none      1      1
     Errors = 1
A: gctctaaaagctgagcgcacc
B: gctctaaaagttgagcgcacc
   ==========^==========
   26171    26408     81    none      1      1
     Errors = 1
A: cctacggttcggccaatgaca
B: cctacggttctgccaatgaca
   ==========^==========
   26253    26490     59    none      1      1
     Errors = 1
A: aatccacattagggtagagat
B: aatccacattggggtagagat
   ==========^==========
   26331    26568     23    none     19     19
     Errors = 4
A: ccactttcgcggcgatttcgctcaacctctcgtccattt
B: ccactttcgcagcgatttcgctcaagcgttcgtccattt
   ==========^              ^ ^^==========
   26388    26625     71    none     34     34
     Errors = 5
A: cgcctttttggtgcagttcgtctttcaagccttttaagattttagcgcgcggat
B: cgcctttttgatgcagttcatctttcagaccttttaagatttttgcgcgcggat
   ==========^        ^       ^^              ^==========
   26463    26700     20    none      4      4
     Errors = 2
A: ttttgtctttcactcgcgcgatgt
B: ttttgtcttttacgcgcgcgatgt
   ==========^  ^==========
   26484    26721     83    none      1      1
     Errors = 1
A: atttatccacatttttcacat
B: atttatccacgtttttcacat
   ==========^==========
   26568    26805     74    none      1      1
     Errors = 1
A: aagcgctaatgcccgcgctaa
B: aagcgctaatacccgcgctaa
   ==========^==========
   26658    26895     45    none     16     16
     Errors = 5
A: aggcgttttggctgtgatcagcgtgcaaggttagga
B: aggcgttttgcccatgatcggcgtgtaaggttagga
   ==========^ ^^     ^     ^==========
   26704    26941     25    none      1      1
     Errors = 1
A: gggcgtgatttccacttcgcc
B: gggcgtgattcccacttcgcc
   ==========^==========
   26748    26985     38    none     19     19
     Errors = 4
A: tggtgtgttttaagcgactataaggataccctctcagca
B: tggtgtgtttcaatcggctataaggataacctctcagca
   ==========^  ^  ^           ^==========
   26811    27048     71    none     25     25
     Errors = 4
A: cataagagcgtgcgatgtccggataaatgataggcgctcccactt
B: cataagagcgcgcgatgtccggataaataatgggtgctcccactt
   ==========^                 ^  ^  ^==========
   26883    27120     44    none      1      1
     Errors = 1
A: tggccatagtttggtaatctt
B: tggccatagtctggtaatctt
   ==========^==========
   26946    27183     41    none     19     19
     Errors = 4
A: tggaataaagggtggataagatagacactccgctagaga
B: tggaataaagagtagataaaatagacaccccgctagaga
   ==========^  ^     ^        ^==========
   26988    27225     38    none      1      1
     Errors = 1
A: tgctagggaaggctgaaaaca
B: tgctagggaaagctgaaaaca
   ==========^==========
   27044    27281     48    none     18     18
     Errors = 2
A: gcacaaagctcctgtggcgcaattccaattcaaattcc
B: gcacaaagcttctgtggcgcaattccagttcaaattcc
   ==========^                ^==========
   27100    27337     37    none      8      8
     Errors = 5
A: cccctgtgaggagtaatttgcacacatc
B: cccctgtgagtaatagcctgcacacatc
   ==========^ ^  ^^^==========
   27138    27375     46    none      1      1
     Errors = 1
A: cgactaaatcttctatcctat
B: cgactaaatcctctatcctat
   ==========^==========
   27207    27444     29    none     23     23
     Errors = 3
A: ttgccattgacatagctgatcttagattggcatccagcggtag
B: ttgccattgatatagctgatcttagattgacacccagcggtag
   ==========^                  ^  ^==========
   27237    27474     47    none      1      1
     Errors = 1
A: ctggatcgtaagaaaaaaacc
B: ctggatcgtaggaaaaaaacc
   ==========^==========
   27299    27536     25    none     15     15
     Errors = 2
A: ccaccgctttaggcccacgagtgctttcaatcgtt
B: ccaccgcttttggcccacgagtgcattcaatcgtt
   ==========^             ^==========
   27386    27624     50    none     62     63
     Errors = 7
A: ttcatagcgttcattattttcattattgactaaagtgacagacatt-tgacttccttaag
B: ttcatagcgtgcattattttcattattgattaaagtaacagacattgtgatttccttaag
   ==========^                  ^      ^         ^   ^         
A: ttttgatagcattcaactcctaa
B: ttttgatagtatccaactcctaa
            ^  ^==========
   27439    27678    118    none      3      4
     Errors = 2
A: taaaaacattgcg-ttttttcaag
B: taaaaacatttcgtttttttcaag
   ==========^  ^==========
   27558    27797     62    none      1      1
     Errors = 1
A: aggataaacagtggcttacaa
B: aggataaacaatggcttacaa
   ==========^==========
   27656    27895     26    none     36     36
     Errors = 5
A: gattaaagacaacaaattgcatgtgccaaaccaccccattatccccttcattgagg
B: gattaaagacggcaaattgcatgtgccaaattaccccattatccctttcattgagg
   ==========^^                  ^^             ^==========
   27695    27934     71    none     13     13
     Errors = 2
A: gcattggatcagatattaccccggcgatgatta
B: gcattggatcggatattaccccagcgatgatta
   ==========^           ^==========
   27767    28006     32    none      1      1
     Errors = 1
A: catggtatgaggtgtttgtgg
B: catggtatgaagtgtttgtgg
   ==========^==========
   27824    28063     38    none     25     25
     Errors = 5
A: atcaaaaatttaaagattataaagaattaagcccagaagagcaat
B: atcaaaaattcaaagaccataaagagttaagccctgaagagcaat
   ==========^     ^^       ^        ^==========
   27878    28117     20    none     16     16
     Errors = 3
A: ttgaagcgattaaccattataaagtttctattaaag
B: ttgaagcgatcaaccactataaagtctctattaaag
   ==========^     ^        ^==========
   27914    28153     20    none     16     16
     Errors = 2
A: ggcctttgacaacgcctattggtgaagggtttagat
B: ggcctttgaccacgcctattggtgaggggtttagat
   ==========^              ^==========
   27935    28174     38    none      1      1
     Errors = 1
A: ctttgaatgtagcgttacgcc
B: ctttgaatgtggcgttacgcc
   ==========^==========
   27974    28213    164    none      1      1
     Errors = 1
A: tgtgcttgaggccggtaaggt
B: tgtgcttgagaccggtaaggt
   ==========^==========
   28140    28379     29    none      2      2
     Errors = 2
A: aactaaaggttaaaaaaatccg
B: aactaaaggtagaaaaaatccg
   ==========^^==========
   28235    28474     38    none     66     66
     Errors = 7
A: aagcagcggcataggggtaaaacccatcagtaaagaaggcacagagaggctagtgagaaa
B: aagcagcggcgtagggataaaacccatcagcaaagaaggcacagagaggttggtgagaaa
   ==========^     ^             ^                  ^ ^        
A: ggcgattgaatacgcaattgataacg
B: agcgattgaatacgcgattgataacg
   ^              ^==========
   28292    28531    103    none     19     19
     Errors = 3
A: ttgtgcataaaggtaacatcatgaaatacaccgaagggg
B: ttgtgcataagggcaacatcatgaaatataccgaagggg
   ==========^  ^              ^==========
   28396    28635     54    none      1      1
     Errors = 1
A: aaccctaaaaacggtaaagaa
B: aaccctaaaaccggtaaagaa
   ==========^==========
   28466    28705    152    none     16     16
     Errors = 4
A: tgcaacaaat-cttattgcgccctagcgaatacagcg
B: tgcaacaaattct-cttgcgccctagtgaatacagcg
   ==========^  ^^           ^==========
   28619    28858     68    none      1      1
     Errors = 1
A: ctcctaaatatgccgggctgg
B: ctcctaaatacgccgggctgg
   ==========^==========
   28688    28927     32    none      1      1
     Errors = 1
A: ggcatatgggttgggtggaag
B: ggcatatgggctgggtggaag
   ==========^==========
   28757    28996     50    none     37     37
     Errors = 3
A: tcgtttctgcgatggaaaaagcgattaaaagcaagaaagtaacttacgatttcgctc
B: tcgtttctgctatggaaaaagcgattaagagcaagaaagtaacttatgatttcgctc
   ==========^                 ^                 ^==========
   28808    29047     33    none      1      1
     Errors = 1
A: gctctgaatttgctagcgtga
B: gctctgaattcgctagcgtga
   ==========^==========
   28904    29135     32    none     63     55
     Errors = 16
A: gtgaaagagcgttttttaagcttttaaatggtgtttgaatgcgaaaaaaaggctaatact
B: gtgaaagagccttt---aagctct-----ggtgtttgaatgcgattata-ggctaatact
   ==========^   ^^^     ^ ^^^^^               ^^ ^ ^          
A: atcat-aaggaatgaagttgataa
B: atcattaaggaataaagttgataa
        ^       ^==========
   28949    29180     26    none     13     13
     Errors = 2
A: atgtggttttgttcattttaacggcgatctttt
B: atgtggttttattcattttaacagcgatctttt
   ==========^           ^==========
   28976    29207     28    none      1      1
     Errors = 1
A: tcatgcttttggtgagttatt
B: tcatgcttttagtgagttatt
   ==========^==========
   29005    29236    117    none      1      1
     Errors = 1
A: cattatagcgcggctgtcatt
B: cattatagcgtggctgtcatt
   ==========^==========
   29144    29375     24    none     22     22
     Errors = 3
A: acgaccctaaagatcaaaaaagcgtaaccgtttatcgtaacg
B: acgaccctaaggatcaaaaaagcgtgaccgtctatcgtaacg
   ==========^              ^     ^==========
   29169    29400     43    none      1      1
     Errors = 1
A: cacgcgctttagcttcccttt
B: cacgcgctttggcttcccttt
   ==========^==========
   29229    29460     20    none     17     17
     Errors = 2
A: atatttcagccctcgctcaaagtttaatcaatcagca
B: atatttcagctctcgctcaaagtttagtcaatcagca
   ==========^               ^==========
   29261    29492     47    none     12     12
     Errors = 2
A: agtggaagtgaaatactatggttggcggatca
B: agtggaagtgcaatactatggctggcggatca
   ==========^          ^==========
   29343    29574     22    none     35     35
     Errors = 7
A: tttttttaaagcccttaaaagagagcactgacatttcaaagcccatttttagctg
B: tttttttaaaacccttaaaagagagcgatgagatgtcaaaacccgtttttagctg
   ==========^               ^^   ^  ^     ^   ^==========
   29396    29627     24    none     31     31
     Errors = 7
A: ttttatacgctttgctgttaatgggcttttttatcagcgcgcgttctgttt
B: ttttatacgccctgctactagtgggcttttttatcagtgcacgttctgttt
   ==========^^    ^^  ^                ^  ^==========
   29437    29668     44    none     17     17
     Errors = 3
A: tttatttaagagcaaagctcattaaaacttttaggct
B: tttatttaagggcaaagctcattaattcttttaggct
   ==========^              ^^==========
   29482    29713     28    none      1      1
     Errors = 1
A: attggagcgtgtattaaaaag
B: attggagcgtttattaaaaag
   ==========^==========
   29541    29772     20    none     31     31
     Errors = 5
A: agggcaagctgatgctgtgaaaagcggtgttgtttccttttaaattgatag
B: agggcaagctcacgctgtaaaaagcggtgttgtttcctctcaaattgatag
   ==========^ ^     ^                   ^ ^==========
   29597    29828     27    none     36     36
     Errors = 5
A: cgattttatagtctagttggtgggatttcaataaaaaatcattcagcaaacaatca
B: cgattttataatctaattggtaggatttcaataaaaagtcattcaacaaacaatca
   ==========^    ^     ^               ^       ^==========
   29625    29856     35    none      1      1
     Errors = 1
A: agcccaaattgtcatggctaa
B: agcccaaattatcatggctaa
   ==========^==========
   29661    29892     46    none      1      1
     Errors = 1
A: cttttaatttcagggcaaaat
B: cttttaattttagggcaaaat
   ==========^==========
   29712    29943     47    none      5      5
     Errors = 2
A: ggcacgcatagccccccagcccctt
B: ggcacgcataaccctccagcccctt
   ==========^   ^==========
   29784    30015     41    none     25     25
     Errors = 4
A: tgaaattgtggagacgttgggtcaaattgtccgtgtcaatggggg
B: tgaaattgtgaaggcgttgggttaaattgtccgtatcaatggggg
   ==========^  ^        ^           ^==========
   29836    30067     64    none     11     11
     Errors = 2
A: gggcgatgaggggggctgaaactttatgata
B: gggcgatgagaggggctgaagctttatgata
   ==========^         ^==========
   29913    30144     56    none     13     13
     Errors = 5
A: ggcggttatcttgcaagaacaaatgcgcatcgc
B: ggcggttatcctgtaagaataggtgcgcatcgc
   ==========^  ^     ^ ^^==========
   29976    30207     26    none      7      7
     Errors = 3
A: tgggttttaacaagatagttttaacgc
B: tgggttttaataaaatcgttttaacgc
   ==========^  ^  ^==========
   30003    30234     32    none      1      1
     Errors = 1
A: cgttgcaatactgggctaata
B: cgttgcaatattgggctaata
   ==========^==========
   30051    30282     25    none     16     16
     Errors = 3
A: tggtttttccggcattcgtgttagttgcgctgataa
B: tggtttttccagcattggtgttagtcgcgctgataa
   ==========^     ^        ^==========
   30093    30345     24    none     17     38
     Errors = 23
A: atggtttaacttttaaa--g-t-g--gt-a-----a----g-----cgccatcaaaga
B: atggtttaacctttaaattgatagtcgttacctctaaactgataagccccatcaaaga
   ==========^      ^^ ^ ^ ^^  ^ ^^^^^ ^^^^ ^^^^^ ^==========
   30290    30542     24    none    173    173
     Errors = 32
A: agaagtcaatacatttttgatttgtggcaacttcacatt-tttaagtgcttctcttggga
B: agaagtcaattcatttttgatttgtggtaacttcacattctttaa-cgcttctcttggga
   ==========^                ^           ^     ^^             
A: cttcaatgactaatctc-tcaaacacttggtcgcttaaagggttatcaatatcaaaaatg
B: cttcaaccactaa-ctcgtttaatgattggtcgctcatagggttatcaatatcaaagatg
         ^^     ^   ^ ^^  ^^^         ^ ^                  ^   
A: aaacttaagatattgtggagtgagttataggtgattttgtcaatcaacgcata-attcag
B: aaattcaaggtattgtggagcgagttatacgataccttgtcaattaacgcatagagt-ag
      ^ ^   ^          ^        ^ ^^ ^^        ^        ^ ^ ^  
A: tctcacgccctctgct
B: tctaatgccctctgct
      ^ ^==========
   30390    30636     37    none     76     70
     Errors = 17
A: ctatggcggtaactatgcttttagatagtctagggctgatgttgccaagttgtgtcgcta
B: ctatggcggttacgatactcttggatagtctaggactgatgttaccaagctgtgtcgcta
   ==========^  ^  ^  ^  ^           ^        ^     ^          
A: aatctgtcggcgaaatgaagcaataacccgcatcgg
B: aatctg-ag---a--taaagcaataccccgcatcgg
         ^^ ^^^ ^^ ^        ^==========
Region:      25933 .. 30460          26129 .. 30706          330 / 4578        7.21%
#
   31536    31689     44    none      -      -
   31734    31878     23    none    154    145
     Errors = 53
A: gtagtccgctcgcaatctt-tttataaatgctgat-aagattagaactctcaattgtaga
B: gtagtccgcttttgattttattgacaa-tgct-attgagattagagctttcaatcgtgga
   ==========^^^^  ^  ^  ^ ^  ^    ^  ^^        ^  ^     ^  ^  
A: -gcctttaatagtcttgtggctcatatcatatttaagtcgtgagatttcatc-gccaaca
B: agc-tttaatagtctcttg-ttggt-t--t-tt-aagtcgtgagagttc-tctgccataa
   ^  ^           ^^  ^^ ^^ ^ ^^ ^  ^           ^   ^  ^    ^^ 
A: gcatctaaaaacttgcttaagggcatcgccttaccaagcaccctaacgctaggtttat
B: gcgtctaaagtttcgcttaaag--at-aagttatctttcactctcactctaggtttat
     ^      ^^^ ^      ^ ^^  ^^^^   ^ ^^^   ^  ^  ^==========
   31824    31971     25    none     67     70
     Errors = 13
A: gtctagctaacttcctgtccgctaacgctttatcaatagatgctgtcaaagaagtgtttc
B: gtctagctaatttcttgtccgctaacgccttatcaatagctgatgtcaaggaagtgttcc
   ==========^   ^             ^          ^  ^      ^        ^ 
A: ttttcggctcatca--a-caaattctaaaa
B: tttgtggctcatcatcaaccaattctaaaa
      ^^         ^^ ^ ^==========
   31868    32018     31    none     19     22
     Errors = 6
A: taattcaatagcatt-ttgtgtcctttt--tctaagcgagat
B: taattcaataacattatcgtgtccttttgctttaagcgagat
   ==========^    ^ ^          ^^ ^==========
   31900    32050     34    none      1      1
     Errors = 1
A: atctttgagctttcagcgggt
B: atctttgagccttcagcgggt
   ==========^==========
   31935    32085     67    none      1      1
     Errors = 1
A: tggtataataccaaaacttca
B: tggtataatatcaaaacttca
   ==========^==========
   32003    32153     47    none      1      1
     Errors = 1
A: aagaatgctataacgctatta
B: aagaatgctacaacgctatta
   ==========^==========
   32063    32213     59    none     13     13
     Errors = 4
A: ttaaagaggtccgtttcac-cttgttgcatgtga
B: ttaaagaggttcgtttcactct-attgcatgtga
   ==========^        ^  ^^==========
   32123    32273     23    none      1      1
     Errors = 1
A: attatggccagacagaagcct
B: attatggccaaacagaagcct
   ==========^==========
   32147    32297     56    none      1      1
     Errors = 1
A: aagaagaaaaagctaaggctt
B: aagaagaaaaggctaaggctt
   ==========^==========
   32225    32375     29    none     22     22
     Errors = 4
A: atatagagtgcgagagcgttctaaaaagcggcgatttgattg
B: atatagagtgtgagagcgttttaaagagcggtgatttgattg
   ==========^         ^    ^     ^==========
   32255    32405     23    none      1      1
     Errors = 1
A: tggatatggcgaaggattatg
B: tggatatggctaaggattatg
   ==========^==========
   32300    32450     33    none     22     22
     Errors = 3
A: tgttattgattggggcgagcgaatctaatttgttgtatcgtt
B: tgttattgatcggggcgagcgagtctaatttattgtatcgtt
   ==========^           ^        ^==========
   32342    32492     26    none      9      9
     Errors = 3
A: ccaaaatagc-ttggttgaacaatccagta
B: ccaaaatagccttg-ttgagcaatccagta
   ==========^   ^    ^==========
   32754    32872     24    none    386    354
   No extension
Region:      31536 .. 32367          31689 .. 32517           92 / 832        11.06%
   32974    33092     29    none    196    196
     Errors = 52
A: agcatgtgctactagtcattttagaacatgagagcggggaaaag-attattggcacttta
B: agcatgtgctgttagccattttagagcatgggattgg-aataaggatttttaatacttta
   ==========^^   ^         ^    ^  ^^  ^^ ^   ^   ^  ^^^      
A: gaaaga-gatgactatgataaattaaaacaaatccttaaagactatttgttgcaatatgt
B: gaa-gaagatggctaccataaaatggagcaaatccttaaagactacttgcaacaatacat
      ^  ^    ^   ^^     ^ ^^ ^                 ^   ^^^     ^^ 
A: gcctttaaagagcgatccagccaaaatgcctgctaggagttttgtgctattaagaatgct
B: tcctttaaaaaacgatccaaccaaaataccagacaggagtcccgtattagcaagagtgtt
   ^        ^ ^       ^       ^  ^ ^^      ^^^  ^^  ^^    ^  ^ 
A: taaaagaatgtatgcgagttgttttgagagcgtgggcg
B: taaaaaaatgtatgcgagttacttggatagcgtgggcg
        ^              ^^  ^  ^==========
   33019    33137     21    none     16     16
     Errors = 8
A: tgcttattttaatgctagatcaccccgattgttacg
B: tgcttattttcattttagaatacgatgattgttacg
   ==========^  ^^    ^^  ^^^==========
   33125    33246     21    none     85     88
     Errors = 21
A: ttcaaaactcatggatagttttggcatcgctcgtttgtatt-ctaatcctgctttattgg
B: ttcaaaactcctggatagttttggcatcactcgttcgtatttcaagtcc-gctttattgg
   ==========^                 ^      ^     ^ ^ ^   ^          
A: atttggataacc--a-tggtattcctaatgacattaatgataatgaaga
B: attttgataaccctaatgatattaatgataacgacattaataatgaaga
       ^       ^^ ^  ^    ^^ ^  ^  ^^^ ^ ^==========
   33196    33317     47    none     50     50
     Errors = 6
A: gcgcccaaaaacactcccttaaaaaaatacgctaaaaatttgagcgctttagcccaagac
B: gcgcccaaaagcactcccctaaaaaaatacactaaaaacttgagcgctttagcccaaaat
   ==========^       ^           ^       ^                  ^ ^
A: aacgctttag
B: aacgctttag
   ==========
   33265    33386     47    none     22     22
     Errors = 3
A: ttttaagagtgatagaaattttagggcgcagaaaaaagaata
B: ttttaagagtcatcgaaattttagggcgcaggaaaaagaata
   ==========^  ^                 ^==========
   33313    33434     68    none      1      1
     Errors = 1
A: tagggaaaacctccatcgctg
B: tagggaaaacttccatcgctg
   ==========^==========
   33412    33533     32    none     31     31
     Errors = 5
A: aagaatatgaagtctattctttggatttagccttaatggtggctggggcaa
B: aagaatatgaggtttattctttggatttggctttaatggtagctggggcaa
   ==========^  ^              ^  ^        ^==========
   33475    33596     50    none     31     31
     Errors = 4
A: attttgaaaaacgcttgaaaaaaacgctcaaagaaatccaacaaaacggcc
B: attttgaaaagcgcctgaaaaaaacgctcaaagagatccagcaaaacggcc
   ==========^   ^                   ^     ^==========
   33527    33648     79    none      2      2
     Errors = 2
A: cccttttaggcacagggagcag
B: cccttttaggtgcagggagcag
   ==========^^==========
   33610    33731     50    none      4      4
     Errors = 2
A: tgaaatgtttaggagcgaccactt
B: tgaaatgtttgggggcgaccactt
   ==========^  ^==========
   33706    33827     20    none     46     46
     Errors = 11
A: acaaggcttttaataggcgtttttcagtcataaaagttgaagagccttctaaagaggcgt
B: acaaggctttcaacaggcgcttttctatagtgaatgttgaagagccttctaaggaagcgt
   ==========^  ^     ^     ^^ ^^ ^  ^                 ^  ^====
A: gttact
B: gttact
   ======
   33736    33857     33    none     10     10
     Errors = 4
A: tgattttaaaaaagatcgctcccctttatg
B: tgattttaaagaatattgcccccctttatg
   ==========^  ^  ^  ^==========
   33775    33896     26    none      6      6
     Errors = 2
A: ggtgcgttatgatgagagcgtgttta
B: ggtgcgttataatgaaagcgtgttta
   ==========^    ^==========
   33809    33930     31    none      8      8
     Errors = 3
A: gcgtggatttaacgagtgattacatgca
B: gcgtggatttgacgagctattacatgca
   ==========^     ^^==========
   33841    33962     29    none      1      1
     Errors = 1
A: tgccggataaagcgattgaat
B: tgccggataaggcgattgaat
   ==========^==========
   33940    34061     26    none     70     70
     Errors = 8
A: aggtgggatcgaggaaaaaaatcagccctaaaaagggcaaaaaaatcggcgttgatgatg
B: aggtgggatcaaggaaaaagatcaaccctaaaaaaggcaaaaaaatcagcgttgatgacg
   ==========^        ^    ^         ^            ^          ^ 
A: tgaaagaaacgctcgctctaaagcttaaaa
B: tgcaagaaacgctcgctctcaagcttaaaa
     ^                ^==========
   33976    34097     35    none     10     10
     Errors = 3
A: aaatgcgtttgagcagcgacaaaaaagccc
B: aaatgcgtttaaacagcgataaaaaagccc
   ==========^ ^      ^==========
   34012    34133     21    none      1      1
     Errors = 1
A: aaaaatcgcttaaaaataaga
B: aaaaatcgctaaaaaataaga
   ==========^==========
   34066    34187     74    none     33     33
     Errors = 5
A: ttttgcccaagcagaagcgatcagtcttgtcagcaatgcgattaaaatccagc
B: ttttgcccaaaccgaagcgatcaaccttgtcagcaatgcgatcaaaatccagc
   ==========^ ^          ^^                 ^==========
   34141    34262     98    none      1      1
     Errors = 1
A: ctagtggggtggggaaaacag
B: ctagtggggtagggaaaacag
   ==========^==========
   34249    34370     26    none     10     10
     Errors = 2
A: gcgtggcaaaactcatcgggagtcctagcg
B: gcgtggcaaagctcatcggaagtcctagcg
   ==========^        ^==========
   34276    34397     32    none      1      1
     Errors = 1
A: tggggtttgaacaaggggggt
B: tggggtttgagcaaggggggt
   ==========^==========
   34309    34430     38    none      1      1
     Errors = 1
A: cgattaaaaaacacccgcatt
B: cgattaaaaagcacccgcatt
   ==========^==========
   34360    34481     20    none     13     13
     Errors = 4
A: agatagaaaaagcccattctaacgtgtatgatt
B: agatagaaaaggcccaccctaatgtgtatgatt
   ==========^     ^^    ^==========
   34381    34502     38    none      1      1
     Errors = 1
A: tgttgttgcaagtgatggata
B: tgttgttgcaggtgatggata
   ==========^==========
   34421    34542     22    none      2      2
     Errors = 2
A: atttaggcaatcaggcgagttt
B: atttaggcaacaaggcgagttt
   ==========^^==========
   34445    34566     37    none      2      2
     Errors = 2
A: agcatgtgattttgattatgac
B: agcatgtgatactgattatgac
   ==========^^==========
   34564    34685     62    none     82     82
     Errors = 8
A: aggataaggatacgctagggttttttagcgctaaaaacaccaagtatgataaagccgtta
B: aggataaggacacgctagggttttttagcactaaaaacgccaagtatgatagagccgtta
   ==========^                  ^        ^            ^        
A: aagagcttttgacccctgaattacgctccaggattgatgcga
B: aagagcttttaacccctgaattgcgatccagaattgatgcga
             ^           ^  ^     ^==========
   34627    34748     26    none      1      1
     Errors = 1
A: ttgtttctgtagaattagaca
B: ttgtttctgtggaattagaca
   ==========^==========
   34671    34792     29    none     18     18
     Errors = 5
A: aagccctagcgctagagcaagacataaccttaaaattc
B: aagccctagcactagagcaaggcgtgatcttaaaattc
   ==========^          ^ ^ ^ ^==========
   34714    34835     62    none     14     14
     Errors = 2
A: gttgtgaaattcatcgcgcaaaaaagctaccaaa
B: gttgtgaaatgcatcgcgcaaaagagctaccaaa
   ==========^            ^==========
   34778    34899     22    none      2      2
     Errors = 2
A: aaatcaaaactaaattaagcga
B: aaatcaaaacccaattaagcga
   ==========^^==========
   34801    34922     35    none      1      1
     Errors = 1
A: tactgctcttgcaatcgttta
B: tactgctcttacaatcgttta
   ==========^==========
   34879    35000     63    none     43     43
     Errors = 5
A: tcgcttgcttgctagaaaaaaaccaattggttttaaaagaaatcaagcgcgcgcaaaagg
B: tcgcttgcttattggaaaaaaaccaattggttctaaaagaaatcaagcgcgcacaaaagg
   ==========^^ ^                  ^                   ^=======
A: tga
B: tga
   ===
   34943    35064     59    none      1      1
     Errors = 1
A: cgactatcacggacgctaatc
B: cgactatcacagacgctaatc
   ==========^==========
   35003    35124     23    none      1      1
     Errors = 1
A: ccaagctcgccaagctcagag
B: ccaagctcgctaagctcagag
   ==========^==========
   35027    35148     20    none      1      1
     Errors = 1
A: gcatgaaagtagaaatcgtgg
B: gcatgaaagtggaaatcgtgg
   ==========^==========
   35048    35169     45    none      1      1
     Errors = 1
A: atgtcaataatggcgaacgct
B: atgtcaataacggcgaacgct
   ==========^==========
   35102    35223     41    none      9      9
     Errors = 2
A: aaaaaggggcgaaatttgcgtcaatggtg
B: aaaaaggggcaaaatttgtgtcaatggtg
   ==========^       ^==========
   35144    35265     44    none      1      1
     Errors = 1
A: taggcgatgtagtgatcattt
B: taggcgatgtggtgatcattt
   ==========^==========
   35207    35328     70    none     19     19
     Errors = 5
A: atgaaatcaacgcacacaagccgagcatcgtgctagtgg
B: atgaaatcaatacgcacaagccaagcattgtgctagtgg
   ==========^^ ^        ^     ^==========
   35288    35418    214    none     11     20
     Errors = 10
A: tgggcgggtt--g----tta---gacggcatgaaaaaaga
B: tgggcgggttaagcgggttattagacggcgtgaaaaaaga
   ==========^^ ^^^^   ^^^      ^==========
   35503    35633     20    none      1      1
     Errors = 1
A: aaaaccgaaaaaatttagcct
B: aaaaccgaaagaatttagcct
   ==========^==========
   35539    35669     88    none     16     16
     Errors = 3
A: ttaacatgctggggaattttgctaaattgtgatgtt
B: ttaacatgctagggaattttgccaagttgtgatgtt
   ==========^           ^  ^==========
   35631    35761     29    none      4      4
     Errors = 2
A: agcattgtcaagcgttttttaaaa
B: agcattgtcaggctttttttaaaa
   ==========^  ^==========
   35688    35818     20    none     28     28
     Errors = 3
A: ttcaaaaaggaggcgtggctttaaaagaattgcctaaaggcgtgtatt
B: ttcaaaaagggggcgtggctttaaaggaattgcctaagggcgtgtatt
   ==========^              ^           ^==========
   35730    35860     20    none     22     22
     Errors = 3
A: tgtattattccaaaacctatcccaaacacgccaaagtcatca
B: tgtattattctaaaacctaccccaaacacgctaaagtcatca
   ==========^        ^           ^==========
   35781    35911     20    none     31     31
     Errors = 4
A: aatccgatccctttgtagggttgtatttgttgcaaagcgcaccaagcgagt
B: aatccgatccttttatagggctgtatttgttgcaaagcgcgccaagcgagt
   ==========^   ^     ^                   ^==========
   35802    35932     32    none      1      1
     Errors = 1
A: atgtttataccttaagggatt
B: atgtttatacattaagggatt
   ==========^==========
   35931    36061     29    none     97     97
     Errors = 16
A: cccttataaggccaatggctagcataggggataaagaagccctagaaacgcgattattgg
B: cccttataagacccatggccagtataggggctaatcaagccacagaagcgcgattattgg
   ==========^  ^     ^  ^       ^   ^^     ^^    ^            
A: tggggcaaagaggctatgagcgctacgctcaaatttcgcaaaagactcaaaaaaatg
B: tagggcaaaaaggctatgaccgctacgctcaaatttcacaaaaaacccaaaaaaatg
    ^       ^         ^                 ^     ^  ^==========
   35971    36101     22    none     11     11
     Errors = 2
A: gcaatatttgctatcaaatgttagggctagg
B: gcaatatttgttatcaaatgctagggctagg
   ==========^         ^==========
   35994    36124     20    none      1      1
     Errors = 1
A: taggggggaatggctttatag
B: taggggggaacggctttatag
   ==========^==========
   36015    36145     20    none      1      1
     Errors = 1
A: aaacgaaatttatcaagcgct
B: aaacgaaattcatcaagcgct
   ==========^==========
   36036    36166     43    none      1      1
     Errors = 1
A: ttttaaaccagcaagagcctt
B: ttttaaaccaacaagagcctt
   ==========^==========
   36114    36244     50    none     35     35
     Errors = 4
A: ttagaagaacatcataagcgtttagtggtagtgcaatttgatccatttttcccta
B: ttagaagaacgtcataagcgtttggtggtagcgcaatttgatccctttttcccta
   ==========^            ^       ^            ^==========
   36183    36313     33    none     19     19
     Errors = 5
A: tagcgatcaaccatcaaaagatccactcattagcggagt
B: tagcgatcaatgattacaagatccactcgttagcggagt
   ==========^^  ^ ^           ^==========
   36262    36392     28    none     46     46
     Errors = 7
A: gagcaatcttaaataccaaagccttgcaaaagtggaaatcaaacgaaaccataaagtcaa
B: gagcaatctttcataccaaagcctcgccaaagtgaaaatcaaacgaaaccatcaaatcaa
   ==========^^            ^  ^      ^                 ^  ^====
A: agaagt
B: agaagt
   ======
   36309    36439     41    none     19     19
     Errors = 3
A: aagtcaataagcgttatggggggtttttactcaaagaca
B: aagtcaataaacgctatggggggtttttgctcaaagaca
   ==========^  ^              ^==========
   36363    36493     75    none     13     13
     Errors = 2
A: tcgctttagatgagcgttttattatcactaaaa
B: tcgctttagacgagcgttttatcatcactaaaa
   ==========^           ^==========
   36465    36595     21    none     27     27
     Errors = 6
A: atgggtgaattataaaagcgtggcgtccaacccaaaggctttaagag
B: atgggtgaatcataaaagcgtttcgttcaacccgaaagctttaagag
   ==========^          ^^   ^      ^  ^==========
   36487    36617     24    none      1      1
     Errors = 1
A: agcgttaagcgcgcctaaaat
B: agcgttaagcacgcctaaaat
   ==========^==========
   36517    36647     33    none      6      6
     Errors = 2
A: ttattagtcttgcgtaaaggctttga
B: ttattagtctggcgtcaaggctttga
   ==========^    ^==========
   36580    36710     29    none     30     30
     Errors = 4
A: gtccgttgaagtattgatgaaaaatgacgcttatgaaattattctttctt
B: gtccgttgaaacattgatgaaacatgacgcttatgaaatcattctttctt
   ==========^^          ^                ^==========
   36610    36740     29    none      1      1
     Errors = 1
A: cgcctctcacggcgattttag
B: cgcctctcacagcgattttag
   ==========^==========
   36649    36779     28    none     10     10
     Errors = 2
A: ctgaattttttctctacactttgcatgcgc
B: ctgaatttttcctctacaccttgcatgcgc
   ==========^        ^==========
   36678    36808     30    none      1      1
     Errors = 1
A: tttaatagcgtggtcgctttg
B: tttaatagcgcggtcgctttg
   ==========^==========
   36709    36839     23    none      1      1
     Errors = 1
A: tctttgcttataggagtttga
B: tctttgcttacaggagtttga
   ==========^==========
   36832    36962     33    none    100    100
     Errors = 17
A: aacagaatttcttcagcgctagcgcgctaacagaagcgttattgtttgtggggttttttg
B: aacagaattttttcagtgctagcgcgcttttagaagcgttatggtttgtggggttttttg
   ==========^     ^           ^^^           ^                 
A: cacttttcaactacgctttaaaaaatcccatgcatttttatgaatttttccaaaacgcta
B: cgctgtttaactacgctttgaaaaatccttcgcgcttttatgaattgtttcaaaacgcta
    ^  ^  ^           ^        ^^^  ^^           ^  ^==========
   36877    37007     24    none     12     12
     Errors = 3
A: taacatgatcgcgcaaagcctctctcaaagct
B: taacatgatcactcaaagcctttctcaaagct
   ==========^ ^        ^==========
   36907    37037     20    none      6      6
     Errors = 2
A: taacttttctgaccatgcgctttctt
B: taacttttctaaccacgcgctttctt
   ==========^    ^==========
   36928    37058     26    none      1      1
     Errors = 1
A: tagattttatctttaatcatg
B: tagattttatttttaatcatg
   ==========^==========
   36961    37091     26    none      7      7
     Errors = 2
A: atgcccttagtttcatcagcgatttga
B: atgcccttagcttcattagcgatttga
   ==========^     ^==========
   37017    37147     24    none     30     30
     Errors = 3
A: atgaaatgtctgtgtggctttttttaagcgttttgcaagggctttttttg
B: atgaaatgtccgtgtggctttttttaagcattttgcaagcgctttttttg
   ==========^                  ^         ^==========
   37042    37172     20    none      1      1
     Errors = 1
A: tgctgtttgcaatcatcattt
B: tgctgtttgcgatcatcattt
   ==========^==========
   37068    37198     23    none      6      6
     Errors = 2
A: tagtgtatttagaagtgcatgtgtgg
B: tagtgtatttggaagcgcatgtgtgg
   ==========^    ^==========
   37093    37223     23    none      2      2
     Errors = 2
A: tctttaggggtgctgtttttag
B: tctttaggggcactgtttttag
   ==========^^==========
   37117    37247     32    none      1      1
     Errors = 1
A: ttgggttttttaaaacctgga
B: ttgggtttttcaaaacctgga
   ==========^==========
   37156    37286     38    none      7      7
     Errors = 2
A: ttatatgcctaaaaaagtgcttcgctc
B: ttatatgccttaaaaaatgcttcgctc
   ==========^     ^==========
   37198    37328     29    none      4      4
     Errors = 2
A: ttttgttgttggtagggtttttga
B: ttttgttgttagtggggtttttga
   ==========^  ^==========
   37243    37373     38    none     16     16
     Errors = 5
A: ttactaaggctttaatagacgctcatatgcaagaaa
B: ttactaaggcgttaatggacgctagcatgcaagaaa
   ==========^     ^      ^^^==========
   37282    37412     32    none      1      1
     Errors = 1
A: tattggtggtagcgttatttt
B: tattggtggtggcgttatttt
   ==========^==========
   37315    37445     77    none      1      1
     Errors = 1
A: ttatcatcggcgtgccttttt
B: ttatcatcggtgtgccttttt
   ==========^==========
   37498    37628     20    none    106    106
     Errors = 30
A: ccaatttgagtgccaacctcagccaaaacgccct-taattccttacaatacat-c-acga
B: ccaatttgagcgctaacctcactcaaagcgctttccaat-ctttaca--gcatgccacga
   ==========^  ^       ^^    ^   ^^ ^^   ^ ^     ^^^   ^ ^    
A: ccccacccgcttcttctagcgtttcttcttctatgagtgaaagcgtctctaaagaaaaag
B: cctcgcccgctccttctcatatttcctcttctgcaagtcaaagcgtttctaaagaaaagg
     ^ ^      ^     ^^^^    ^      ^^^   ^       ^           ^=
A: aaacgcatt
B: aaacgcatt
   =========
   37519    37649     72    none      1      1
     Errors = 1
A: cccccacatttaaggtagaaa
B: cccccacattcaaggtagaaa
   ==========^==========
   37592    37722     40    none      1      1
     Errors = 1
A: ggatacaataaatacaaaaaa
B: ggatacaatagatacaaaaaa
   ==========^==========
   37633    37763     29    none      1      1
     Errors = 1
A: atttaatgagaattttttttg
B: atttaatgaggattttttttg
   ==========^==========
   37663    37793     44    none      1      1
     Errors = 1
A: gacttgtgttttttggttgca
B: gacttgtgttgtttggttgca
   ==========^==========
   37715    37844     37    none      8      7
     Errors = 3
A: aaagcccttgcacattgttatgaaaaca
B: aaagcccttgtaccttg-tatgaaaaca
   ==========^  ^   ^==========
   37794    37923     21    none     42     42
     Errors = 7
A: aagaaaagcctttcaatagcgagcagttgatctattt-agaagagcttttaaaccaccaa
B: aagaaaagccgttcaatagcgagcagatg-gcttttttagaagagcttttaagccaccaa
   ==========^               ^  ^^  ^   ^              ^=======
A: gaa
B: gaa
   ===
   37818    37947     48    none      3      3
     Errors = 2
A: agcatttagaaaacaagctttct
B: agcatttagagagcaagctttct
   ==========^ ^==========
   37876    38005     23    none     10     10
     Errors = 5
A: aaagcgtgttcagactggagaggaaccgct
B: aaagcgtgtttcggctagaaaggaaccgct
   ==========^^ ^  ^  ^==========
   37960    38089     44    none     61     61
     Errors = 11
A: aaatcgcttataaactcttaggcttgatgagttttatcgctcttgttttagcgatcgtgt
B: aaatcgcttacaggcttttaggtttgatgagctttatcgcgcttgtcttagcgatcgttt
   ==========^ ^^  ^     ^        ^        ^     ^           ^ 
A: taatcagtgttctgcccttac
B: taatcagtatcctgcccttac
           ^ ^==========
   38005    38134    104    none      1      1
     Errors = 1
A: attttttaaatcaggacaagc
B: attttttaaaccaggacaagc
   ==========^==========
   38164    38293     36    none     55     55
     Errors = 5
A: accgagagagtattaaccgcattgacgataaatcgcgctatgaattggtgcgcttgcaaa
B: accgagagagcattaatcgcattgacgataaatcccgctatgaactggtgcgcttgcaaa
   ==========^     ^                 ^         ^               
A: gcagttctaaagtgt
B: gcagctctaaagtgt
       ^==========
   38233    38362     65    none     33     33
     Errors = 3
A: tttgattaaaacccaaaacagcatttatgtgcaaagccatttggaaagagaag
B: tttgattaaagcccaaaacagcatctatgtgcaaagccatttagaaagagaag
   ==========^             ^                 ^==========
   38299    38428     23    none      1      1
     Errors = 1
A: ttgcgagcgtctccattgcgg
B: ttgcgagcgtgtccattgcgg
   ==========^==========
   38335    38464     32    none     13     13
     Errors = 3
A: aacttttgaacgaaaacaagttggtgtatgaaa
B: aacttttgaatgaaaacaagctcgtgtatgaaa
   ==========^         ^ ^==========
   38368    38497     56    none      1      1
     Errors = 1
A: tcgtattgagttatttgtttg
B: tcgtattgagctatttgtttg
   ==========^==========
   38469    38604     29    none     45     51
     Errors = 11
A: accctaccggatttaaaatcacccgttacagcatcactgaaatc------actaataggg
B: accctaccggctttaaaatcactcgctacagcatcactgaaatcgcgccgactaatagga
   ==========^           ^  ^                  ^^^^^^         ^
A: gtgattgatgc
B: atgattgatgc
   ^==========
   38523    38658     47    none     25     25
     Errors = 4
A: tatacgctcttgtgggctttttgttggcttttagcgctttaaaag
B: tatacgctctcatgggctttttgttggtttttagtgctttaaaag
   ==========^^               ^      ^==========
   38589    38724     50    none     19     19
     Errors = 3
A: aaacagccccggcgcatttaaaccaccctatgcaggatt
B: aaacagccccagcgaatttaaaccaccccatgcaggatt
   ==========^   ^             ^==========
   38640    38775     55    none      1      1
     Errors = 1
A: aaaaccgctcaaaaatgtcca
B: aaaaccgctccaaaatgtcca
   ==========^==========
   38696    38830     22      -2      1      0
     Errors = 1
A: tataaaatcccgcttgcgtta
B: tataaaatcc-gcttgcgtta
   ==========^==========
   38719    38853     38    none      1      1
     Errors = 1
A: cgatggcgaccttattgtttt
B: cgatggcgactttattgtttt
   ==========^==========
   38758    38892     41    none      1      1
     Errors = 1
A: attttgttttaggggataagg
B: attttgttttgggggataagg
   ==========^==========
   38833    38967     31    none     34     34
     Errors = 6
A: tagaaagcaacgatcgtattttgcttatcaaacccctacaaattggcgtggatt
B: tagaaagcaatgatcgcattttactcatcaaacccttacaaatcggcgtggatt
   ==========^     ^     ^  ^         ^       ^==========
   38866    39000     65    none      2      2
     Errors = 2
A: gtgattgataatgagggtaaga
B: gtgattgatagcgagggtaaga
   ==========^^==========
   38932    39066     23    none      1      1
     Errors = 1
A: accctaatttgcaggttttta
B: accctaatttacaggttttta
   ==========^==========
   38999    39142     24    none     44     53
     Errors = 15
A: aagataaaaattattattctaacgcttttttgaagccccaaaaagaaaat-a------t-
B: aagataaaaactattacactaacgcttttatcaagccccaaaaagaaaatcaagaaaata
   ==========^     ^^           ^ ^                  ^ ^^^^^^ ^
A: -ggctgaaaatgc
B: tgtctgaaaatgc
   ^ ^==========
   39041    39184     22    none     18     18
     Errors = 7
A: aaagatgcccccacaaacaacaaacccttaaaagaaga
B: aaagatgcccaaaaaaataataagcccctaaaagaaga
   ==========^^ ^   ^  ^  ^   ^==========
   39064    39207     25    none      1      1
     Errors = 1
A: aagaagaaaccaaagaaaaag
B: aagaagaaactaaagaaaaag
   ==========^==========
   39136    39279     51    none     47     47
     Errors = 7
A: gagactataactattggcgataacactaatgccatgaaaatcgttaaaaaagacattcaa
B: gagactataattattggcgataacaccaacgcgatgaaaattattaaaaaagacatccaa
   ==========^               ^  ^  ^        ^^             ^===
A: aaaggct
B: aaaggct
   =======
   39235    39378     47    none     48     48
     Errors = 7
A: gtattgttta-gggatttgttctaaaaagtccaaactctctttgatgcctaaagaaattt
B: gtattgtttatgggctt-gttctaaaaaatccaaactctccttaatgcctaaagaaatct
   ==========^   ^  ^          ^           ^  ^              ^=
A: ttaacgaca
B: ttaacgaca
   =========
   39283    39426     47    none      1      1
     Errors = 1
A: aaagattagcgctctctaaat
B: aaagattagcactctctaaat
   ==========^==========
   39331    39474     50    none      1      1
     Errors = 1
A: gctatgataacccggtgaata
B: gctatgataatccggtgaata
   ==========^==========
   39471    39614     30    none     90     90
     Errors = 14
A: aagacgtttcggctaaatggactttaaggctgggcaaggactatttgtgcatccgttttg
B: aagacgtttctactaaatggactttaaggttgggtaaggattatctgtgtatccgttttg
   ==========^^                 ^    ^     ^   ^    ^          
A: tcaaaaaggc-taaagatgaataagtggcttaagggggcgattgtttttgt
B: tcaaaa-ggcgcaaaggtgaataagtggattaaaggggcggttgtttttgt
         ^   ^^    ^           ^    ^      ^==========
   39543    39686     22    none     42     42
     Errors = 5
A: gcaacgattataaccatttctttaatctatcatcaaaagccaaaagcccccttaaataac
B: gcaacgattacaaccttttctttaatctaccaccaaaagccaaaagcccccctaaataac
   ==========^    ^             ^  ^                  ^========
A: ca
B: ca
   ==
   39566    39709     68    none      1      1
     Errors = 1
A: ctagccttttaaatgacgatg
B: ctagccttttgaatgacgatg
   ==========^==========
   39635    39778     83    none      1      1
     Errors = 1
A: caactaacacagaaagctcca
B: caactaacacggaaagctcca
   ==========^==========
   39774    39912     22    none     56     51
     Errors = 16
A: aagaaatgaaccattctaaagaagaaacttttaagaaccctcccatagatttaaagcaaa
B: aagaaatgaattattccaaagaagagacttttactagccctcccatggatccaaa--aa-
   ==========^^    ^        ^       ^^ ^         ^   ^^   ^^  ^
A: cacaaacccccctaaa
B: ca-a-ccccccctaaa
     ^ ^^==========
   39845    39983     34    none     49     49
     Errors = 8
A: agacttttcttcaaagcaatgggatttactagccgctcgcatcacccctttcaaacaagg
B: agacttttctccaaaacaattagatttactggcctctcgcatcacccctttcaagcaaag
   ==========^    ^    ^^        ^   ^                   ^   ^=
A: ccctaaaaa
B: ccctaaaaa
   =========
   39910    40048     38    none     31     31
     Errors = 5
A: tgattttccccatggataaccctaaaggcattgatggttttactaacctta
B: tgattttccctgtggataaccctaatggcattgatagtttcactaacctta
   ==========^^             ^         ^    ^==========
   39949    40087     23    none      1      1
     Errors = 1
A: ctaatgaaaataagcttttac
B: ctaatgaaaacaagcttttac
   ==========^==========
   40006    40144     26    none     34     34
     Errors = 7
A: ccattacagcggataaaatgatacccgcctttctcatcacgcctatttctagcc
B: ccattacagctgacaaaatgatacccgcttttttgattacgcccatttctagcc
   ==========^  ^              ^   ^ ^  ^     ^==========
   40042    40180     20    none     10     10
     Errors = 3
A: ctggtaaagtcatcgcgcaggtggagagcg
B: ctggtaaagtgattgcgcaagtggagagcg
   ==========^  ^     ^==========
   40075    40213     35    none     13     13
     Errors = 4
A: atatttttgctcacatgggcaaggccgtcttaa
B: atatttttgcaagcatgggcaaagccgtcttaa
   ==========^^^         ^==========
   40111    40249     53    none      1      1
     Errors = 1
A: aagtcataggttattacagca
B: aagtcataggctattacagca
   ==========^==========
   40168    40306     20    none      4      4
     Errors = 2
A: ttgtatggagccgcatcatcactc
B: ttgtatggagtcgaatcatcactc
   ==========^  ^==========
   40189    40327     53    none      1      1
     Errors = 1
A: cccatggcatcaatatcatgc
B: cccatggcattaatatcatgc
   ==========^==========
   40243    40381     29    none      1      1
     Errors = 1
A: ataacggcttggtgggggaat
B: ataacggcttagtgggggaat
   ==========^==========
   40273    40411     29    none      1      1
     Errors = 1
A: ggaatttccagcgctatggcg
B: ggaatttccaacgctatggcg
   ==========^==========
   40303    40441     61    none      1      1
     Errors = 1
A: tgctttctactctcactaacg
B: tgctttctacgctcactaacg
   ==========^==========
   40372    40510     24    none      8      8
     Errors = 5
A: aataaagaaggag-ccaccaatttctttg
B: aataaagaag-aggtgactaatttctttg
   ==========^  ^^^  ^==========
   40397    40535     40    none      1      1
     Errors = 1
A: ttatcttttaatgcaattgat
B: ttatcttttattgcaattgat
   ==========^==========
   40438    40576     20    none      1      1
     Errors = 1
A: tcaatcaagtagtcaatcaaa
B: tcaatcaagtggtcaatcaaa
   ==========^==========
   40495    40633     38    none     37     37
     Errors = 5
A: ttttaagagataagagcaaaatcgctcctattgtggtgattagagaagggagtaggg
B: ttttaagagacaagagcaagatcgcccccattgtggtgattagagaggggagtaggg
   ==========^        ^     ^  ^                 ^==========
   40534    40672     57    none      1      1
     Errors = 1
A: ctgacatctttttccctatac
B: ctgacatcttcttccctatac
   ==========^==========
   40597    40735     41    none      6      6
     Errors = 4
A: actcaaaaatccccaattaaaaacgc
B: actcaaaaatgccagtttaaaaacgc
   ==========^  ^^^==========
   40690    40828     59    none     52     52
     Errors = 8
A: aagagagcctgacaagaaaacgcatgaaaattaaaaatatcttactgagtggggggagcg
B: aagagagcctagcaagaaagcccatgaaaattaaaaatgtcttattgagtggggggagtg
   ==========^^       ^ ^                ^     ^             ^ 
A: ggaaacgcctat
B: gcaaacgcctat
    ^==========
   40768    40906     44    none     19     19
     Errors = 2
A: agctttttgaccataaaagcttgtttgaattgagtttta
B: agctttttgatcataaaagcttgtttgagttgagtttta
   ==========^                 ^==========
   40813    40951     29    none      1      1
     Errors = 1
A: aaacgctcattgtgtgcaatg
B: aaacgctcatcgtgtgcaatg
   ==========^==========
   40876    41014     20    none     34     34
     Errors = 5
A: attttttagccctagaagagataaagaatgaaatcaaaaacaaaagcgtgggtt
B: attttttagctctagaagaaataaaaaacgaaatcaaaaacaagagcgtgggtt
   ==========^        ^     ^  ^              ^==========
   40900    41038     26    none      4      4
     Errors = 2
A: ttttattagagagcttgagtaaaa
B: ttttattagaaagtttgagtaaaa
   ==========^  ^==========
   40927    41065     60    none      1      1
     Errors = 1
A: ctaacgccatcgctttgagcg
B: ctaacgccattgctttgagcg
   ==========^==========
   41086    41224     77    none     99     99
     Errors = 12
A: aagcgatcatttgattaaagaccttcaagcgtatgaaaacgcgataaaaaaagcgattga
B: aagcgatcatctgattaaagactttcaagcgtatgaaaatgcgataaaaaaagcgattaa
   ==========^           ^                ^                  ^ 
A: tctagcccaaaaaggttttttagtcacttttggggtgagtattgacaagcccaacacgg
B: tttagctcaaaaaggctttttagtcacttttgggattagcattgaaaaacccaacacgg
    ^    ^        ^                  ^ ^  ^     ^  ^==========
   41164    41302     26    none      1      1
     Errors = 1
A: caagcctagacaaagcgatag
B: caagcctagaaaaagcgatag
   ==========^==========
   41209    41347     56    none     19     19
     Errors = 3
A: aaaaaagcgg-gggtttttatttcaatagcggcatgtttg
B: aaaaaagcggagggtttt-atttcaatagtggcatgtttg
   ==========^       ^          ^==========
   41338    41476    151    none     73     73
     Errors = 7
A: agcatgcccccactattttaaaggggtgtgaaagagcgtttgaatctttagaaaacgcgt
B: agcatgcccctactattttaaaggggtgcgaaagagcgtttgaatccttagaaaacacgc
   ==========^                 ^                 ^         ^  ^
A: atttttttgaaaaaaagatcgctcgtttgagcg
B: atttttttgaacaaaagatcgcgcgtttgagcg
              ^          ^==========
   41544    41682     42    none     55     55
     Errors = 7
A: gcggctaacgagc-ctaaagaaaatgtcagcttgaatcaaacgcctgtttttgccaaaga
B: gcggctaacg-gcactaaagaaaatgtcagcctgaatcaaacgcctatttttgccaaaga
   ==========^  ^                 ^              ^             
A: aagcgaaaataattta
B: gagcacaaataattta
   ^   ^^==========
   41605    41743     24    none     19     19
     Errors = 4
A: ctcttttaggcgttgagaatttagcggttattgacacta
B: ctcttttaggggttgaggatttagcgatcattgacacta
   ==========^      ^        ^ ^==========
   41704    41842     35    none     75     75
     Errors = 9
A: cgctcttttaatcgctcataaagacaaggctaaggatttaaaagctttagtgaacgaggt
B: cgctcttttagtcgctcataaagacaaagctaaggatttaaaagccctagtgagcgagat
   ==========^                ^                 ^^      ^    ^ 
A: agaaacaaacaaccaagaattgttgcaaacgcaca
B: agaaacacacaaccaagaattattacaaacgcaca
          ^             ^  ^==========
   41740    41878     62    none      1      1
     Errors = 1
A: cttgggggagttatgaagtct
B: cttgggggagctatgaagtct
   ==========^==========
   41815    41953     32    none     13     13
     Errors = 2
A: aaccaaacgcaaggctttctttacaaaagcatt
B: aaccaaacgctaggctttctttgcaaaagcatt
   ==========^           ^==========
   41848    41986     26    none      1      1
     Errors = 1
A: aacactgggtagtgattagcg
B: aacactgggtggtgattagcg
   ==========^==========
   41889    42027     46    none     15     15
     Errors = 3
A: cgagcgtggagttggatcaccagttgtttgaattg
B: cgagcgtggaattggatcaccaatcgtttgaattg
   ==========^           ^ ^==========
   41986    42124     20    none     51     51
     Errors = 7
A: taaaaacaccctacaccgcctggctaattacggcaagatccctttaattatcatagaagt
B: taaaaacaccttacaccgcctagctaattatggcaaaatccctttgattatcatagaggt
   ==========^          ^        ^     ^        ^           ^  
A: tcaagtgggcg
B: ccaagtgggcg
   ^==========
   42072    42209     28    none     66     65
     Errors = 10
A: agtatgtcggtgaagacgatattgtgcgcattgatgatgattttaacagacaaaatcaaa
B: agtatgtcggcgaagacgatattgtaagggttgatgacgattttaacagacagaatcaaa
   ==========^              ^^ ^^       ^              ^       
A: acgcctaataaagaaaatttaataaa
B: acgcctaatgaa-aagatttaataaa
            ^  ^  ^==========
   42101    42238    145    none      1      1
     Errors = 1
A: aataaaggaaaaataatgaaa
B: aataaaggaacaataatgaaa
   ==========^==========
   42291    42428     29    none     45     45
     Errors = 5
A: gatcgatcatctgtatgaagatttgcatagcgatcataaaaggcgttttttcttacacta
B: gatcgatcatttgtatgaagatttgcacagcgaacacaaaaggcgttttttcttgcacta
   ==========^                ^     ^  ^                 ^=====
A: tgggg
B: tgggg
   =====
   42351    42488     23    none     31     31
     Errors = 4
A: atagctctaatcttatccatttaatcgctaccactaagcctacagagattt
B: atagctctaacctcatccatttgatcgctaccactaagcccacagagattt
   ==========^  ^        ^                 ^==========
   42387    42524     20    none     13     13
     Errors = 2
A: atttagccgctcaaagccatgtaaaagtctctt
B: atttagccgcgcaaagccatgtgaaagtctctt
   ==========^           ^==========
   42408    42545     47    none      1      1
     Errors = 1
A: ttgaaacccccgaatacaccg
B: ttgaaaccccagaatacaccg
   ==========^==========
   42474    42611     29    none     19     19
     Errors = 3
A: ggattttagaagccatgcggattttaggattagaaaaga
B: ggattttagaggccatgcggattttgggcttagaaaaga
   ==========^              ^  ^==========
   42504    42641     38    none      1      1
     Errors = 1
A: tttatcaagccagcacgagcg
B: tttatcaagctagcacgagcg
   ==========^==========
   42543    42680     71    none      1      1
     Errors = 1
A: tagaaaccccgcaaaatgaaa
B: tagaaaccccacaaaatgaaa
   ==========^==========
   42639    42776     20    none     25     25
     Errors = 3
A: tttacatcaccaaaaattacagagaggcctataacttgtttgcgg
B: tttacatcactaaaaattacagagaggcttataatttgtttgcgg
   ==========^                 ^     ^==========
   42660    42797    113    none      1      1
     Errors = 1
A: ttaatggcattctttttaacc
B: ttaatggcatcctttttaacc
   ==========^==========
   42774    42911     35    none      1      1
     Errors = 1
A: tagggaatttagacgctaaaa
B: tagggaatttggacgctaaaa
   ==========^==========
   42882    43019     41    none     73     73
     Errors = 8
A: ccaaagattacgtgaaaatgatgcatttaatgctccaagcgcccatcccacaagattatg
B: ccaaagattatgtgaaaatgatgcatttgatgctccaagcacccaccccacaagattatg
   ==========^                 ^           ^    ^              
A: tgatcgccacaggaaagaccacaagcgtgcgcg
B: taatcgctacagggaagaccacgagcgtgcgcg
    ^     ^     ^        ^==========
   42931    43068     74    none      8      8
     Errors = 4
A: aatttatcggtatcaatttagaatttca
B: aatttatcggcattgatctagaatttca
   ==========^  ^^  ^==========
   43127    43264     69    none    122    122
     Errors = 15
A: gaacgctttaaaattgaacttaagccatttaaaaaaaggccaaatcgtggtgcgcataga
B: gaacgctttacaattaaacttaagccatttaaaaacgggcaaaatcgtggtgcgtataga
   ==========^    ^                   ^^   ^             ^     
A: cgagcgttatttcaggcctaccgaagtggatttgcttttaggcgatcccactaaggcaga
B: cgagcactatttcaggcctactgaagtggatttgctcttaggcgatcccactggggctga
        ^^              ^              ^               ^^   ^  
A: gaaagagctagactgggttagg
B: gaaagagctgggctgggttagg
            ^ ^==========
   43197    43334     26    none      1      1
     Errors = 1
A: aagaatgccaaaaaaaccttt
B: aagaatgccagaaaaaccttt
   ==========^==========
   43229    43366     25    none      6      6
     Errors = 2
A: aagatgggggttatattttaaggaat
B: aagatgggggctatactttaaggaat
   ==========^    ^==========
   43273    43410     44    none     19     19
     Errors = 4
A: tgaatgagattattttaatcactggtgcctatggcatgg
B: tgaatgagatcattttaatcaccggcgcttatggcatgg
   ==========^           ^  ^  ^==========
   43362    43499     27    none     45     45
     Errors = 5
A: ttaaaaaaaataagcctgatgttactct-actcactcctaaaaagagcgaattgtgtttg
B: ttaaaaaaaacaagcctgatgttac-cttactcacccctaaaaagagcgaattgtatttg
   ==========^              ^  ^      ^                   ^====
A: ttggat
B: ttggat
   ======
   43390    43527     62    none      1      1
     Errors = 1
A: acgttcaagcttatttgaaag
B: acgttcaagcctatttgaaag
   ==========^==========
   43465    43602     32    none     13     13
     Errors = 3
A: ggggcattgtcgctaacatgaatgatctttcaa
B: ggggcattgtggcaaacatgaacgatctttcaa
   ==========^  ^        ^==========
   43533    43670     42    none     36     36
     Errors = 5
A: agaatttactgatgggcttgtacctcttttctagcgctttagattcgggcgtgaaa
B: agaatttactcatgggtttgtatcttttttctagcgctttagatttgggcgtgaaa
   ==========^     ^     ^  ^                   ^==========
   43591    43728     41    none     16     16
     Errors = 3
A: cttgcgcttaccctaaattcgcccccaaccctttaa
B: cttgcgcttatcctaaatacgcccctaaccctttaa
   ==========^       ^      ^==========
   43642    43779     44    none     10     10
     Errors = 2
A: gctctttagagccaacgaacgaaggctacg
B: gctctttagaaccaacgaatgaaggctacg
   ==========^        ^==========
   43735    43872     35    none     49     49
     Errors = 6
A: agtattgcgagtatgtgagcgctgaaaagggcgttttttataaaac-cttagtgccttgc
B: agtattgcgaatacgtgagcgctgaaaaaggcgttttttataaaactct-agtgccttgt
   ==========^  ^              ^                 ^  ^         ^
A: aacctttatg
B: aacctttatg
   ==========
   43771    43908     26    none      1      1
     Errors = 1
A: ttgaagaaaaaatagcgcaca
B: ttgaagaaaagatagcgcaca
   ==========^==========
   43798    43935     36    none      1      1
     Errors = 1
A: cagggcttatcgctaggatgc
B: cagggcttattgctaggatgc
   ==========^==========
   43837    43974     29    none      3      3
     Errors = 2
A: aaatgaaaaagagtttgcgatgt
B: aaatgaaaaaaattttgcgatgt
   ==========^ ^==========
   43867    44004     38    none      1      1
     Errors = 1
A: gcacggccaggagagagtatc
B: gcacggccagaagagagtatc
   ==========^==========
   43963    44100     74    none     58     58
     Errors = 8
A: ccagattcatttctctagcttatgagaatatcgcttcaa-tccctagcgtgatgaatgtt
B: ccagattcatcgctctcgcttatgagaatatcgct-caaatgcctagcgtgatgaatgtc
   ==========^^    ^                  ^   ^ ^                 ^
A: ggctctggcgtggattaca
B: ggctctggagtggattaca
           ^==========
   44040    44177     21    none      3      3
     Errors = 2
A: ttgtgaaagacttatccaaacca
B: ttgtgaaagattcatccaaacca
   ==========^ ^==========
   44062    44199     28    none      1      1
     Errors = 1
A: tgggcatgcagcaaaagctta
B: tgggcatgcaacaaaagctta
   ==========^==========
   44091    44228     85    none      1      1
     Errors = 1
A: tccaaacaaagggctttaaaa
B: tccaaacaaaaggctttaaaa
   ==========^==========
   44197    44334     20    none     21     21
     Errors = 3
A: agaggtttgaaataaaatcaaggctcttatggagctataaa
B: agaggtttgatctaaaatcaaggctcttatagagctataaa
   ==========^^                  ^==========
   44360    44499     24    none    143    145
     Errors = 31
A: aacgctccgctattaagcgttaggctagtggtagttgcgatattgtgatc--gttttagc
B: aacgctccgccattaggcgttaggctagcgatatttacgatattgcgatcacaagttcgc
   ==========^    ^            ^ ^  ^  ^        ^    ^^^^^  ^  
A: ttcaaacaaactttgagccattaaaa-gggatttggt-gtgtggcttcgctct-caattt
B: ttcaaacaaactt-gagccattaaaaaggggtttggttgcatg-ctttactcttcacct-
                ^            ^   ^      ^ ^^  ^   ^^    ^  ^^ ^
A: caagtgctttcaaaaagcaaggtgtgttactattctattttttcataa
B: caagcgctttcaaaaagcaaggcgtgttagcattctaatttttcataa
       ^                 ^      ^^      ^==========
   44494    44627     23    none    110    104
     Errors = 31
A: ctagggggtaaggaatgtaagggggcttttt-tgttaggccaaccaccaacttctttgca
B: ctagggggtagggaatataaggg--ctttttctatgagattaaccacc-gctt----gct
   ==========^     ^      ^^      ^ ^ ^  ^^^       ^^   ^^^^  ^
A: ttaaaaacaaa-ctcgtattttacaa-gagagagttttgattggcatgagatctatcttt
B: ttaaa-tcaaaacttgtattttacaaccag-tagctataatttgcatgagatttatcttt
        ^^    ^  ^           ^^  ^^  ^ ^ ^   ^         ^       
A: tagatgagcgggc
B: tatatgagcgggc
     ^==========
   44532    44665     21    none     15     15
     Errors = 5
A: tccctctattgaactgaatgtcctagatttttatg
B: tccctctattaaattgaatgttttggatttttatg
   ==========^  ^       ^^ ^==========
   44565    44699     23    none     12     13
     Errors = 3
A: tgtctgtttt-agaggtgattgtcagttggttt
B: tgtctgtttttagagatgattgccagttggttt
   ==========^    ^      ^==========
   44649    44781     25    none     61     59
     Errors = 10
A: ctttccaaaaacccaagtccctttatcagtgtctctatgctaacttcttttatatgctga
B: ctttccaaaattccaagtccctttatcagt--ctttatactaacttcctttatatgctga
   ==========^^                  ^^  ^   ^        ^            
A: caccgaaataaataaaattga
B: caacgaagtatataaaattga
     ^    ^  ^==========
   44675    44807     30    none      1      1
     Errors = 1
A: atcgccaaatcttagcgtttt
B: atcgccaaattttagcgtttt
   ==========^==========
   44720    44849     25    none     15     12
     Errors = 6
A: aaataaggaaatccatcattgttagcacaattccc
B: aaataaggaagtc--t-atcgttatcacaattccc
   ==========^  ^^ ^  ^    ^==========
   44757    44889     31    none     12     15
     Errors = 5
A: tgatttttgcactcaata-ta--gcgatactatca
B: tgatttttgcgctcaataatatagtgatactatca
   ==========^       ^  ^^ ^==========
   44856    44997     26    none     68     77
     Errors = 19
A: gatgtctatctaataaaggc--tg----ttc-t--taaaagttacttcaatatttattgg
B: gatgtctatccaataaagaccgtgaccatacctactgaaagttacttcaatgtctattgg
   ==========^       ^ ^^  ^^^^ ^ ^ ^^ ^              ^ ^      
A: gggtttttcactgccactacacccagaaaaaaacaca
B: gggtttttcactaccactacaccccacaaaaaacaca
               ^           ^^^==========
   44954    45100     30    none     72     77
     Errors = 18
A: ccaaaaatgattgctagcattaagcccgctttttt-gtaac-cc-accactaacac--tc
B: ccaaaaatgaccgctcatatcaagcccgctttttttgtaacacccactattaaaaccctc
   ==========^^   ^^^  ^              ^     ^  ^  ^ ^   ^  ^^  
A: tcttattgcaagttttttctcaaatgccttgagtata
B: tcttattgtaagttttctctcaaatagcttgagtata
           ^       ^        ^^==========
   45077    45226     66    none     93     96
     Errors = 30
A: acttagcttaagcggactctaaacca-tttttagggca--ggcttaaaacgatt-aaaaa
B: acttagcttaggtgatctctaaaaaaatttagagggcaaaggc-ggtggggttttaaaaa
   ==========^ ^ ^^       ^^ ^   ^^      ^^   ^^^^^^^ ^  ^     
A: atgacggcgtgttaacaaatcctaggcaataattcgccctctggcacctctaaaatc
B: gtgccttagttttagcaaatcctaggcagcaattcgccctctggcatctctaaaatc
   ^  ^ ^^^  ^   ^             ^^                ^==========
   45177    45326     26    none     34     34
     Errors = 7
A: tttcaaacactttgccaatcacgcaagcgtttttagctttttcgttacttttta
B: tttcaaacaccccgccgatcacgcaagcgtttttcgctttctcattacttttta
   ==========^^^   ^                 ^     ^  ^==========
   45294    45443     35    none     91     91
     Errors = 8
A: ctaaggctttaggggcgtctttttgattgagcgctaaaacaaacaccccctcattggcta
B: ctaaggcttttggggcgtccttttgattgagcgctaacacaaacaccccctcattagcca
   ==========^        ^                 ^                 ^  ^ 
A: gcgcgtagggttctaaccctaaaatctcacaaatccctttcgtttcttctt
B: gcgcgtagggttctagccctaaaatctcgcaaatccctttagtttcttctt
                  ^            ^           ^==========
   45369    45518    103    none     40     40
     Errors = 5
A: cttcttctataacgattttcactctagagctgttcgcccattcgttcagcacgctcgcta
B: cttcttctatgacgattttcactctggagctattcgcccattcgttcaatacgctcgcta
   ==========^              ^     ^                ^^==========
   45515    45664     21    none     43     43
     Errors = 9
A: caatcgctttctagattcgttttaagcttgatttcattacgcatcgcaaataagcttgcc
B: caatcgctttgcaaattggttttaagtttgatttcatgacgcgtcgcaaacaggcttgcc
   ==========^^ ^   ^        ^          ^    ^       ^ ^=======
A: cca
B: cca
   ===
   45537    45686     39    none      1      1
     Errors = 1
A: gattggcgatagtgtcgctta
B: gattggcgatcgtgtcgctta
   ==========^==========
   45578    45727     36    none      2      2
     Errors = 2
A: ttgtaaatggtacgaagaaatc
B: ttgtaaatggcgcgaagaaatc
   ==========^^==========
   45615    45764     59    none      1      1
     Errors = 1
A: taccaatgcaggttgtgttga
B: taccaatgcaagttgtgttga
   ==========^==========
   45684    45833     38    none     10     10
     Errors = 2
A: tgtctagggagaggagtttcaggttggctt
B: tgtctagggaaaggagttttaggttggctt
   ==========^        ^==========
   45741    45890     77    none     19     19
     Errors = 4
A: tggattgtaaaatttgttttaaaagagaaatttctaagc
B: tggattgtaagatttgctttaaaagagggatttctaagc
   ==========^     ^          ^^==========
   45819    45968     32    none      1      1
     Errors = 1
A: catcattcgcactcccgcaaa
B: catcattcgcgctcccgcaaa
   ==========^==========
   45855    46004     38    none      4      4
     Errors = 2
A: ctatatcgcccccattaaaaatta
B: ctatatcgcctccgttaaaaatta
   ==========^  ^==========
   45894    46043     47    none      1      1
     Errors = 1
A: tatccgtgctcacgcaatatt
B: tatccgtgcttacgcaatatt
   ==========^==========
   45942    46091     44    none      1      1
     Errors = 1
A: cttcatcaaatgcaacaatcc
B: cttcatcaaacgcaacaatcc
   ==========^==========
   45987    46136    108    none      1      1
     Errors = 1
A: ctcgctcaatcaaagcgtttg
B: ctcgctcaattaaagcgtttg
   ==========^==========
   46096    46245     47    none      1      1
     Errors = 1
A: gcttgaccgatagggatactg
B: gcttgaccgacagggatactg
   ==========^==========
   46187    46336     35    none     44     44
     Errors = 10
A: aaaaaatactgcctcttta-gccctctcaatcgtttggctaattgttcgcataataattg
B: aaaaaatactccct-ttgaagctttttcaatcgcttggctaattgttcgcacaacaattg
   ==========^   ^  ^ ^  ^^ ^       ^                 ^  ^=====
A: gttgc
B: gttgc
   =====
   46247    46396     22    none     25     25
     Errors = 5
A: tgcacaccaccacatgctctttaaaaggcacgattaaagcggtaa
B: tgcacaccacgacatgccctttaaaaggcgcaatcaaagcggtaa
   ==========^      ^           ^ ^  ^==========
   46270    46419     29    none      1      1
     Errors = 1
A: atttctactaggctgttaaaa
B: atttctactaagctgttaaaa
   ==========^==========
   46304    46453     41    none      5      5
     Errors = 3
A: gcgatgcgttcaggctctaaaacgc
B: gcgatgcgtttgggttctaaaacgc
   ==========^^  ^==========
   46354    46503     53    none      9      9
     Errors = 2
A: gataaaattctttcaaacacaccacgctg
B: gataaaattccttcaaacgcaccacgctg
   ==========^       ^==========
   46408    46557     30    none      1      1
     Errors = 1
A: tcgctttgtaaggctagattt
B: tcgctttgtagggctagattt
   ==========^==========
   46481    46630     35    none     43     43
     Errors = 10
A: gcccgctctctgcttcaaagctaatcgttcctgttaaatccaaactaaacgctactatat
B: gcccgctctcggcttcaaaactaatcgttcccaccacgcccaaactaaacgccactatat
   ==========^        ^           ^^^^ ^^^             ^=======
A: caa
B: caa
   ===
   46519    46668     29    none      3      3
     Errors = 2
A: aattggtggctatgctttgaatt
B: aattggtggcgacgctttgaatt
   ==========^ ^==========
   46610    46759     28    none     62     62
     Errors = 6
A: tgcatttgttggaaaatttctaattcgtcttctttaaaatgcttttgaacgcgctttaaa
B: tgcatttgtttaaaaattcctaattcgtcttctttgaaatgcttttgaacgcgttttaaa
   ==========^^      ^                ^                 ^      
A: agcttgttgagttggtgtttta
B: agcttgttgagctggtgtttta
              ^==========
   46642    46791     51    none      4      4
     Errors = 3
A: tctaaaaccaggcgtctaggctct
B: tctaaaaccaatcttctaggctct
   ==========^^ ^==========
   46702    46851     72    none      9      9
     Errors = 5
A: attcttcaaacctggcggtttcttcaatg
B: attcttcaaatctagccacttcttcaatg
   ==========^  ^  ^^^==========
   46787    46936     35    none     13     13
     Errors = 3
A: ccccactcccatcccagacaatgcctataaagg
B: ccccactcccgtcccaaacaatacctataaagg
   ==========^     ^     ^==========
   46823    46972     82    none      1      1
     Errors = 1
A: gatcttgtaacaatgcgtcta
B: gatcttgtaataatgcgtcta
   ==========^==========
   46907    47056     22    none      2      2
     Errors = 2
A: aaagccatttgagtggtggtgt
B: aaagccattttggtggtggtgt
   ==========^^==========
   46955    47104     97    none     26     26
     Errors = 5
A: ttttgatgcttgtcgcaagctaagatggtgggtttaaaatcatagg
B: ttttgatgctcatcgcaagctaagagcgtgggtttgaaatcatagg
   ==========^^             ^^        ^==========
   47071    47220     21    none     19     19
     Errors = 5
A: agtaaaagaatggaagttccgctatccaataagctaaaa
B: agtaaaagaacagaagtttcgctatctagtaagctaaaa
   ==========^^      ^       ^ ^==========
   47095    47244     24    none      3      3
     Errors = 2
A: gccctttttgttgcgctccaagc
B: gccctttttgctccgctccaagc
   ==========^ ^==========
   47147    47296     23    none     28     28
     Errors = 9
A: aaatcttttttggcgaaccattagagcgtttaggcaaggtgaggtaaa
B: aaatctttttgggcgcattaaaagagcgtttgggtaaagtgaggtaaa
   ==========^    ^ ^^ ^^         ^  ^  ^==========
   47175    47324     31    none      5      5
     Errors = 2
A: gggcaaaccccctagccaaacgcat
B: gggcaaaccctctaaccaaacgcat
   ==========^   ^==========
   47245    47394     30    none     39     39
     Errors = 7
A: cattatccacatgctgcacgatgctgtcatcaatcctatggatgatagcgcggttgtgc
B: cattatccacgcgctgcgcgatgctatcatcaatcctgtggatgatggtgcggttgtgc
   ==========^^     ^       ^           ^        ^ ^==========
   47300    47449     35    none     25     25
     Errors = 11
A: aatcaaaaatgaaactcaag-gcgtcaatctcagcctcatcgctcg
B: aatcaaaaat-aaaatgaagcgaatcgatctctttttcatcgctcg
   ==========^   ^ ^   ^ ^^  ^     ^^^^==========
   47369    47518     32    none     34     34
     Errors = 5
A: tgaaattcgcgctcgtgaacacaatagggaaatccaataaatccagcaataaag
B: tgaaattcgcactcgtgaatacaataggggaatctaataaatctagcaataaag
   ==========^        ^         ^    ^        ^==========
   47405    47554     43    none      4      4
     Errors = 2
A: tatagggcaaaatcacgccataaa
B: tatagggcaagataacgccataaa
   ==========^  ^==========
   47453    47602     32    none      5      5
     Errors = 4
A: ggggctaattttatatcaggttttt
B: ggggctaattgggtgtcaggttttt
   ==========^^^ ^==========
   47504    47653     32    none     19     19
     Errors = 6
A: gaatgggggcgcttgtagaaattaagctctcgcattcta
B: gaatgggggcacttaccgaatttaagctttcgcattcta
   ==========^   ^^^   ^       ^==========
   47581    47730     24    none     45     45
     Errors = 6
A: acgcatgctgtttggctgtgttcaaatctttaaacatgagtgcgaaaggctttagggggc
B: acgcatgctgcttggctgcgtttagatctttaaacatgagcgcgaaaggctttaaggggc
   ==========^       ^   ^ ^               ^             ^=====
A: ggttt
B: ggttt
   =====
   47631    47780     22    none     26     26
     Errors = 5
A: aaagccgtaatctttctatggtttgaaaattccttccatcgcacaa
B: aaagccgtaacctctctatggttttaaaattcctcgcatcgcacaa
   ==========^  ^          ^         ^^==========
   47654    47803     68    none      1      1
     Errors = 1
A: gagcaaagcctcccaaacctt
B: gagcaaagccccccaaacctt
   ==========^==========
   47738    47887     29    none     16     16
     Errors = 2
A: gagcgtcatcgtttttgaatcgcttgtaattgagcg
B: gagcgtcatcatttttgaatcgcttataattgagcg
   ==========^              ^==========
   47851    48000     26    none     84     84
     Errors = 21
A: actttttgcagctgatgccttgaatgtggaagcgcttattggtg-gggtcttgatagata
B: actttttgcaacttatgccttgaatatggaatcgtttgtt-atgagcgtctttataaacg
   ==========^  ^           ^     ^  ^  ^  ^^  ^ ^     ^   ^ ^^
A: gaagcacaaaaatcgcagagtttgaagggttttagggcggagttt
B: gatgcgcaaaatttgcagagcttgaaaggttttaaggcggagttt
     ^  ^     ^ ^      ^     ^       ^==========
   47879    48028     23    none      2      2
     Errors = 2
A: tcatagggcaaagcgtttaaaa
B: tcatagggcatggcgtttaaaa
   ==========^^==========
   47909    48058     47    none      7      7
     Errors = 3
A: tgtatctcgccccacacttcgcgcaag
B: tgtatctcgctccgcatttcgcgcaag
   ==========^  ^  ^==========
   47981    48130     26    none     25     25
     Errors = 7
A: agtttttatccctgatttctctcaagcaatccttgcacacgccta
B: agtttttatctctaatctcgcacaagcaatcctcacacacgccta
   ==========^  ^  ^  ^ ^           ^^==========
   48020    48169     23    none     13     13
     Errors = 3
A: tagggatttggctgagcaaattcaaggggtggt
B: tagggatttgactgagcagatttaaggggtggt
   ==========^       ^   ^==========
   48068    48217     32    none     25     25
     Errors = 3
A: tgctttctaagatcctaaaaccattgaaatgaagtgccttatcat
B: tgctttctaaaatcctaaaatcattgaaatgaagcgccttatcat
   ==========^         ^             ^==========
   48134    48283     37    none     34     34
     Errors = 5
A: tgattttttcaaccaacgctaaaggaggcaaccctttttttagagcgtttaaaa
B: tgattttttccaccaacgctaaagggggtaatcctttttttagggcgtttaaaa
   ==========^              ^  ^  ^           ^==========
   48172    48321     20    none      1      1
     Errors = 1
A: gcgggtaagatgatttctaaa
B: gcgggtaagacgatttctaaa
   ==========^==========
   48241    48390     83    none     49     49
     Errors = 6
A: gccgcttgggtgttacgcacaaagcccacaagctctaatttttgagctagggtataaata
B: gccgcttgggcgttacgcacaaagcctacaagccctaatttttgagccaggatataaaca
   ==========^               ^      ^             ^   ^      ^=
A: aaagggcgc
B: aaagggcgc
   =========
   48349    48498     36    none     25     25
     Errors = 4
A: aatgcaaacttccatgctgtttgattaaggtgttgcaatcaaccc
B: aatgcaaactcccatgctgtttgattaaagtattacaatcaaccc
   ==========^                 ^  ^  ^==========
   48412    48561     20    none     27     27
     Errors = 5
A: cgtgtgttgtttcaaggtttctaaaatgagcgcgtctttagggtcgt
B: cgtgtgttgtcttaaggtttctaaaatgagcgtatcattagggtcgt
   ==========^ ^                   ^^  ^==========
   48441    48590     39    none      9      9
     Errors = 4
A: tgtaagtgggcacgattaaagcgttattg
B: tgtaagtggggacaatcagagcgttattg
   ==========^  ^  ^ ^==========
   48507    48656     33    none     27     27
     Errors = 4
A: aagttgccggcaagcgttgttggttttcatcaaaaatggctttaggg
B: aagttgccggtaagcgttgttggttttcattataaacggctttaggg
   ==========^                   ^ ^   ^==========
   48541    48690     62    none      1      1
     Errors = 1
A: tgagtttatagggcgtgccgt
B: tgagtttataaggcgtgccgt
   ==========^==========
   48604    48753     25    none      1      1
     Errors = 1
A: aggctgtgtagtgctcatcgt
B: aggctgtgtaatgctcatcgt
   ==========^==========
   48630    48779     23    none      1      1
     Errors = 1
A: tcttcgcatgtgctataaaca
B: tcttcgcatgcgctataaaca
   ==========^==========
   48654    48803     33    none      1      1
     Errors = 1
A: gtgtctttatctaaaaaacga
B: gtgtctttatttaaaaaacga
   ==========^==========
   48703    48852     57    none     16     16
     Errors = 2
A: tatggctatcggtatcatcgcctttgagatagccat
B: tatggctatccgtatcatcgccttttagatagccat
   ==========^              ^==========
   48761    48910     45    none      1      1
     Errors = 1
A: tttaagcatgttttctattcc
B: tttaagcatggtttctattcc
   ==========^==========
   48807    48956     23    none      1      1
     Errors = 1
A: tttttttctaacaggcattgg
B: tttttttctagcaggcattgg
   ==========^==========
   48856    49005     50    none     26     26
     Errors = 3
A: ttggttaaaacgctcccagccccatcgctttctatactcccgccct
B: ttggttaaaatgctcccggccccatcgctttctatgctcccgccct
   ==========^      ^                 ^==========
   48922    49071    131    none     16     16
     Errors = 4
A: gttttaaaaaccctaaacttttgagtttgaaattca
B: gttttaaaaaacctaaatgtttgagcttgaaattca
   ==========^      ^^      ^==========
   49063    49212     48    none     10     10
     Errors = 2
A: atgtgtcgttagtgtcaatccttgcgatct
B: atgtgtcgttggtgtcaattcttgcgatct
   ==========^        ^==========
   49137    49286     35    none     26     26
     Errors = 5
A: ataaccgataatatcgttagtgtggacgcacactagcactttagcg
B: ataaccgatagtgtcgttagtatggacgcacaccaacactttagcg
   ==========^ ^        ^           ^ ^==========
   49243    49392     42    none     71     71
     Errors = 10
A: tgaatgatgtttaaaaaactttccctagcctctttgatacaatacgcccagtcgctaaac
B: tgaatgatgtgtaaaaagctctccctggcctcttcaatacaatacgcccagtcgccaaac
   ==========^      ^  ^     ^       ^^                   ^    
A: tcatgggggaaagccattagaatcgcttgga
B: tcatgggggaacgccattaagatcgcttgga
              ^       ^^==========
   49303    49452     38    none     18     18
     Errors = 3
A: tcttttcattcaaaatatccttttaaataactataaca
B: tcttttcattaaaaatatccttttaagcaactataaca
   ==========^               ^^==========
   49364    49514     28    none     23     24
     Errors = 7
A: gtttttaaaa-c-agattcaaacgctttttagcggtttgaaaata
B: gtttttaaaagctagct-caaacgcttttgcgcgatttgaaaata
   ==========^ ^  ^ ^           ^^   ^==========
   49432    49582     28    none     40     40
     Errors = 6
A: ctgattctatgccgataaaattccgttctaaatttttgcacgctaagccggtggtgccgc
B: ctgattctataccgataaaatttcgctttaaatttttgcacgctaaaccagtggtgccgc
   ==========^           ^  ^ ^                  ^  ^==========
   49466    49616     20    none      6      6
     Errors = 3
A: aaaggatctagcacgatgtcattagg
B: aaaggatctaacactgtgtcattagg
   ==========^   ^^==========
   49489    49639     22    none      3      3
     Errors = 2
A: gtttgtgtggatggaaatgattt
B: gtttgtgtgggtagaaatgattt
   ==========^ ^==========
   49513    49663     23    none      2      2
     Errors = 2
A: tccattaaggccaggctttttt
B: tccattaaggttaggctttttt
   ==========^^==========
   49579    49729     23    none     43     43
     Errors = 8
A: tggggtgtttggttttttcaagcccgcttaccacagggctttttaaaatcaaaggccgta
B: tggggtgtttcactctttcaatcccgctcaccacagggctttttaagatcaagggccgta
   ==========^^^ ^      ^      ^                 ^     ^=======
A: aat
B: aat
   ===
   49621    49771     23    none     19     19
     Errors = 2
A: tttcatttttgggtttgttaaacacccacttggctttct
B: tttcatttttaggtttgttaaacacccatttggctttct
   ==========^                 ^==========
   49681    49831     50    none     37     37
     Errors = 5
A: taaccgcccacagagcaaattccgtgtcttggacataacgccggtgaatgtttcttg
B: taaccgcccatagggcaaattctgtgtcttggacatagcgccggtggatgtttcttg
   ==========^  ^        ^              ^        ^==========
   49732    49882     41    none      1      1
     Errors = 1
A: agtctttgaccacaaagccgt
B: agtctttgactacaaagccgt
   ==========^==========
   49774    49924     20    none      1      1
     Errors = 1
A: tatagcttataaacctgtaag
B: tatagcttatgaacctgtaag
   ==========^==========
   49795    49945     22    none      1      1
     Errors = 1
A: agcaaaaaataaccatgcagc
B: agcaaaaaatcaccatgcagc
   ==========^==========
   49824    49974     54    none      7      7
     Errors = 2
A: tttggattgactaagggggcgtagcgt
B: tttggattgattaaggaggcgtagcgt
   ==========^     ^==========
   49891    50041     22    none     13     13
     Errors = 3
A: attccccaaaatctatgccttgccttttagcgc
B: attccccaaagtctatgccctgtcttttagcgc
   ==========^        ^  ^==========
   49915    50065     23    none      2      2
     Errors = 2
A: tttagggtgggaaaattgtttt
B: tttagggtggagaaattgtttt
   ==========^^==========
   49951    50101     34    none     13     13
     Errors = 3
A: ccgaaatgttataaggagggtccgtgatgatcg
B: ccgaaatgttgtaaggaggatctgtgatgatcg
   ==========^        ^  ^==========
   50042    50191     48    none     57     56
     Errors = 11
A: ttttgctggtaaaagtctttgatgatttcaaaagcgtcagcgtgataaatttgtatcatt
B: ttttgctggtggaaatccttgatgatttcaaaggcgttagcgtgatggatttgtatcatt
   ==========^^  ^  ^              ^    ^        ^^            
A: ttcttaagctttttaag
B: t-cttgcgctttttaag
    ^   ^^==========
   50109    50258     34    none     19     19
     Errors = 2
A: gaggaggcacagcgttaccgatttgcttacaaacgctcg
B: gaggaggcacggcgttaccgatttgcttgcaaacgctcg
   ==========^                 ^==========
   50144    50293     33    none      1      1
     Errors = 1
A: aagatataattatcgctaaaa
B: aagatataatcatcgctaaaa
   ==========^==========
   50178    50327     23    none      1      1
     Errors = 1
A: cggcttctctaggcgtgatag
B: cggcttctctgggcgtgatag
   ==========^==========
   50202    50351     23    none      1      1
     Errors = 1
A: ggtgcaattcggggtgggagt
B: ggtgcaattcagggtgggagt
   ==========^==========
Region:      32754 .. 50224          32872 .. 50373         1245 / 17502       7.11%
#
   52032    50438     25    none      -      -
   52062    50468     31    none      5      5
     Errors = 2
A: tctaaatgcaagtcgttttctaaaa
B: tctaaatgcaggtcattttctaaaa
   ==========^   ^==========
   52094    50500     34    none      1      1
     Errors = 1
A: gttcctttgatttttgtaacg
B: gttcctttgacttttgtaacg
   ==========^==========
   52209    50615     71    none     81     81
     Errors = 15
A: ttgccaaattggatgcacgcttaaagtattgagagcgtttaaaacctgtgctttgctttc
B: ttgccaaatttgatgcttgcttaaaatattgagagcgtttaaaactcgcgctttgctttc
   ==========^     ^^       ^                   ^^ ^           
A: ttcatagccatagacagattttgaagccttataagaacaca
B: ttcatatccaggggtaaattttgaaaccttgtaagaacaca
         ^   ^^ ^^ ^        ^    ^==========
   52300    50707     23    none     20     21
     Errors = 4
A: aattaaaagggtcaatagcgtt-aaaaagcaagaaacaagc
B: aattaaaaggatcaatggcgtttaaaaagcgagaaacaagc
   ==========^     ^     ^       ^==========
   52349    50757     28    none     26     27
     Errors = 5
A: aataaccttttatttttt-aaaaggattataagatagcgctcattag
B: aataacctttcattttttttaaaggattataaaataacgctcattag
   ==========^       ^^            ^   ^==========
Region:      52017 .. 52376          50423 .. 50784           28 / 362         7.73%
#
   56114    53289     63    none      -      -
   56234    53413     32    none     57     61
     Errors = 14
A: aaggtttgatcaaagagcataagggg-att-aaggattaaaccaaattcatttgaagcat
B: aaggtttgattaaagagcataagggggatttaaagattggatcaagctcatttgaagcgt
   ==========^               ^   ^  ^    ^^ ^   ^^           ^ 
A: t--aatgtttcaagctctcaa
B: tttaatgctttaagctctcaa
    ^^    ^  ^==========
   56288    53467     21    none     22     22
     Errors = 3
A: tggtttcaaaagcctctttagtgcctgttcgtacgctagaaa
B: tggtttcaaaggcctctttagtgcctgatcgcacgctagaaa
   ==========^                ^   ^==========
   56312    53491    101    none      3      3
     Errors = 2
A: caaactaaacaccacaatagcta
B: caaactaaacgcaacaatagcta
   ==========^ ^==========
   56432    53611     29    none     19     19
     Errors = 2
A: tagccccagaaagcatgccagcaatcgctccaatgcgcg
B: tagccccagagagcatgccagcaatcgcgccaatgcgcg
   ==========^                 ^==========
   56480    53659     47    none     19     19
     Errors = 4
A: accaaaaaagcgagaataaaatcacagatccaaaactcg
B: accaaaaaagtgaaaacaaaatcacagagccaaaactcg
   ==========^  ^  ^           ^==========
   56541    53720     58    none     14     14
     Errors = 3
A: cgatgctgagaatgctggcgtttctatccgttga
B: cgatgctgaggatgctagcgtttttatccgttga
   ==========^     ^      ^==========
   56626    53805    144    none     27     27
     Errors = 4
A: gcctagaaatagccatcactaatttttgtggggcgtctttattgaaa
B: gcctagaaatcgtcatcactaatttttggggggcgtttttattgaaa
   ==========^ ^               ^       ^==========
   56771    53950     35    none      1      1
     Errors = 1
A: attgactcatcacaatgaaaa
B: attgactcattacaatgaaaa
   ==========^==========
   56825    54004     35    none     19     19
     Errors = 3
A: ctaaactcaaatcaaatttatgcacatacgcaacgccta
B: ctaaactcaagtcaaatttatgtacataagcaacgccta
   ==========^           ^     ^==========
   56861    54040    110    none      1      1
     Errors = 1
A: atgccccaatcaaagaaataa
B: atgccccaattaaagaaataa
   ==========^==========
   56972    54151     23    none      1      1
     Errors = 1
A: aatagcctaagccccaagcaa
B: aatagcctaacccccaagcaa
   ==========^==========
   56996    54175     98    none      1      1
     Errors = 1
A: ttgaaataatggcgactacgc
B: ttgaaataatagcgactacgc
   ==========^==========
   57095    54274     59    none      1      1
     Errors = 1
A: ggattatcatcacgatcggca
B: ggattatcataacgatcggca
   ==========^==========
   57173    54352     86    none     19     19
     Errors = 2
A: aatccgtccaacacaccgccttatacccccctaaaaagg
B: aatccgtccagcacaccgccttataccctcctaaaaagg
   ==========^                 ^==========
   57260    54439     83    none      1      1
     Errors = 1
A: caaagagtttggccccactca
B: caaagagtttagccccactca
   ==========^==========
   57344    54523     38    none      1      1
     Errors = 1
A: agatgtgtttgtcatcgctaa
B: agatgtgtttatcatcgctaa
   ==========^==========
   57386    54565     35    none      4      4
     Errors = 2
A: ctgaaatggtgatggaattagcga
B: ctgaaatggtaatagaattagcga
   ==========^  ^==========
   57425    54604     20    none      4      4
     Errors = 2
A: tgcgtaagcgtttggccacaaaaa
B: tgcgtaagcgcttagccacaaaaa
   ==========^  ^==========
   57515    54694     26    none     70     70
     Errors = 8
A: cccagttaatcaatgcgcccaaactcaaccctatggcgatatgtgagttgataagccctc
B: cccagttaatgagtgcgcccaaactcaagcctatggcgatgtgtgaattgataagccccc
   ==========^ ^               ^           ^     ^           ^ 
A: ccacatataaagctccaggcaatcccatta
B: ccacatataaagctcccggtaatcccatta
                   ^  ^==========
   57557    54736     26    none     16     16
     Errors = 4
A: acccgctcatatcgctcgcccccgcgctcaaagcgc
B: acccgctcatgtcgctcgctcctgcactcaaagcgc
   ==========^        ^  ^  ^==========
   57587    54766     85    none      4      4
     Errors = 2
A: cagggcccatggaacgatcgccta
B: cagggcccatagagcgatcgccta
   ==========^  ^==========
   57673    54852     21    none      1      1
     Errors = 1
A: gaataaacgataaacatcgta
B: gaataaacgacaaacatcgta
   ==========^==========
   57695    54874    118    none      1      1
     Errors = 1
A: caataggggtacttaaaacaa
B: caataggggtgcttaaaacaa
   ==========^==========
   57823    55002     50    none     10     10
     Errors = 3
A: tcccataacggtgataagagatgctaaccg
B: tcccataacgatgatacgaaatgctaaccg
   ==========^     ^  ^==========
   57880    55059     29    none      7      7
     Errors = 3
A: aacgcccatttaggcatggtttagccg
B: aacgcccattcaagcagggtttagccg
   ==========^ ^   ^==========
   57916    55095     55    none      7      7
     Errors = 4
A: ccatccctaaagcgctcgcttgttcgt
B: ccatccctaatctgcttgcttgttcgt
   ==========^^^   ^==========
   57979    55158     32    none      8      8
     Errors = 3
A: cgattgaaagtattcaatttctcgctaa
B: cgattgaaagcgttcaacttctcgctaa
   ==========^^     ^==========
   58051    55230     22    none     40     40
     Errors = 4
A: tttcataaacaataggggcgcttgcttggagcgcttttaagcattctaagaaaaaggtta
B: tttcataaacgataggggcgtttgcttggagtgcttttaagcattctaaaaaaaaggtta
   ==========^         ^          ^                 ^==========
   58074    55253     20    none      1      1
     Errors = 1
A: tctttgttcgttcgttcgttt
B: tctttgttcgctcgttcgttt
   ==========^==========
   58095    55274     24    none      1      1
     Errors = 1
A: tctatgctgagcgttaaaggg
B: tctatgctgatcgttaaaggg
   ==========^==========
   58120    55299     66    none      1      1
     Errors = 1
A: gagaaattaaacatgctaaag
B: gagaaattaagcatgctaaag
   ==========^==========
   58187    55366     57    none      1      1
     Errors = 1
A: gcccacgcttttaactttagt
B: gcccacgcttgtaactttagt
   ==========^==========
   58264    55443     38    none     20     20
     Errors = 3
A: tagtctttagtttggctgaattcatgtttgtaatgataag
B: tagtctttagcttggctgaattcatgcttataatgataag
   ==========^               ^  ^==========
   58321    55500     20    none     19     19
     Errors = 3
A: aaatcgcgcgcttcaactcatgcgtatgctcatcatagc
B: aaatcgcgcgtttcaactcatgcgtgtgttcatcatagc
   ==========^              ^  ^==========
   58354    55533     32    none     13     13
     Errors = 5
A: ctttttgagttaagttttctaaggcttcgctta
B: ctttttgagtcaagccctctaaagcttcgctta
   ==========^   ^^^     ^==========
   58404    55583    114    none     18     18
     Errors = 4
A: aggcgttttcgtcttcttcttcttggcagatattcaca
B: aggcgttttcatcttcttcttcttgatggatattcaca
   ==========^              ^^^==========
   58519    55698     65    none      1      1
     Errors = 1
A: ctgtggtgggcttgttgatat
B: ctgtggtgggtttgttgatat
   ==========^==========
   58585    55764     39    none      1      1
     Errors = 1
A: tttcgtccaacgactctaacg
B: tttcgtccaaagactctaacg
   ==========^==========
   58659    55838    101    none     35     35
     Errors = 3
A: ggtagaattggctatttctatcgcttcgtctaaatcttttgcttccatcacggat
B: ggtagaattgactatttctatcgcctcgtctaaatcttttgctttcatcacggat
   ==========^             ^                   ^==========
   58774    55953     26    none     14     14
     Errors = 4
A: gggttatcattgacaaagcttaccgggatttcgt
B: gggttatcatcaacaaagcttgctgggatttcgt
   ==========^^         ^ ^==========
   58801    55980     50    none      1      1
     Errors = 1
A: catagctttttaattcatcta
B: catagcttttcaattcatcta
   ==========^==========
   58852    56031     71    none      1      1
     Errors = 1
A: ccgctagagcgccgattttgt
B: ccgctagagcaccgattttgt
   ==========^==========
   58927    56106     29    none      4      4
     Errors = 2
A: gagtctttttaaagttctcatctt
B: gagtctttttgaaattctcatctt
   ==========^  ^==========
   58957    56136    101    none      1      1
     Errors = 1
A: ctttttctaatactaaaagcg
B: ctttttctaacactaaaagcg
   ==========^==========
   59059    56238     29    none      1      1
     Errors = 1
A: tgctcacaatggtggcgtttt
B: tgctcacaatagtggcgtttt
   ==========^==========
   59089    56268     20    none      1      1
     Errors = 1
A: tttcagcgctcaaggctaaag
B: tttcagcgcttaaggctaaag
   ==========^==========
   59115    56294     21    none      6      6
     Errors = 3
A: tggggttagcttttaacattttataa
B: tggggttagccttgagcattttataa
   ==========^  ^ ^==========
   59185    56364     74    none     49     49
     Errors = 5
A: cggtgtcttcgcccccggttaaaatggcaaactggatgctttcatctcttaaaagatgtt
B: cggtgtcttcaccccctgttaaaatggcaaacttgatgctttcatcttttaaaagatgct
   ==========^     ^                ^             ^          ^=
A: cgctaatat
B: cgctaatat
   =========
   59272    56451     47    none     13     13
     Errors = 2
A: aaaagcactcacaaagcttatagcccgttacgc
B: aaaagcactcgcaaagcttataacccgttacgc
   ==========^           ^==========
   59323    56502     53    none      4      4
     Errors = 3
A: cccgattgcccgtagctagggggg
B: cccgattgccagcggctagggggg
   ==========^ ^^==========
   59434    56613    107    none     58     58
     Errors = 8
A: aattccatggggcaatgaccacgcccacgcctttaggggtgaattgcgtttttgtgtttt
B: aattccatggagcgatgaccacacccacgcctttgggggtgaatttcgtttttttatttt
   ==========^  ^        ^           ^          ^       ^ ^    
A: gctcttgcaacaccctta
B: gctcttgtaacaccctta
          ^==========
   59542    56721     29    none      1      1
     Errors = 1
A: aaatccctatcaaatcgcctc
B: aaatccctattaaatcgcctc
   ==========^==========
   59605    56784     65    none     34     34
     Errors = 4
A: taaaaagctgggcggtttgactcattaaggcatggatttctgtaaagctttttt
B: taaaaagctgagcggtttgactcaataaagcatggatttctgtgaagctttttt
   ==========^             ^   ^              ^==========
   59671    56850     20    none      1      1
     Errors = 1
A: aaatcgcttccttatccgcta
B: aaatcgcttctttatccgcta
   ==========^==========
   59692    56871     46    none      1      1
     Errors = 1
A: aatgcacgctagcgatttttt
B: aatgcacgctggcgatttttt
   ==========^==========
   59739    56918     24    none      1      1
     Errors = 1
A: aaaggggttagattaggatct
B: aaaggggttaaattaggatct
   ==========^==========
   59767    56946     23    none      4      4
     Errors = 2
A: acctcccatccatctctgggtaaa
B: acctcccatctatttctgggtaaa
   ==========^  ^==========
   59806    56985     83    none     16     16
     Errors = 3
A: ctaaaataggagcgttacgcattttctcgcgcactt
B: ctaaaataggggcgttatgcattttatcgcgcactt
   ==========^      ^       ^==========
   59959    57138     26    none     70     70
     Errors = 9
A: ggtttgggtaagtggtatgcccgctttgtttggcgttcctatcttgagtcctatgggtgg
B: ggtttgggtaggtggtatgcccggtttgtttggcgtttctgtcttgggtcctgtgggtgg
   ==========^            ^             ^  ^     ^     ^       
A: cattgtctaaagtggcaattcctttaaggc
B: tattgtctaaagtggcgatccctttaaggc
   ^               ^  ^==========
   59992    57171     41    none      7      7
     Errors = 2
A: aaaagcgttgttcttgatctttccatt
B: aaaagcgttgctcttggtctttccatt
   ==========^     ^==========
   60034    57213     20    none      1      1
     Errors = 1
A: taaagaaagccttcatgaaat
B: taaagaaagctttcatgaaat
   ==========^==========
   60069    57248     21    none     15     15
     Errors = 3
A: tatcgcttgaggtgttttcgtctaacctcctcacc
B: tatcgcttgaagtgttttcatctagcctcctcacc
   ==========^        ^    ^==========
   60100    57279     38    none     10     10
     Errors = 2
A: agtaagcgatcgcattgttaaaatgcgctt
B: agtaagcgattgcattgttgaaatgcgctt
   ==========^        ^==========
   60175    57354     26    none     37     37
     Errors = 3
A: aaagaatgagcttgtgcatctcttttagttcctggctcgcttgcaaactcatgccct
B: aaagaatgagtttgtgcatctcttttaattcctggctcgcttgcaagctcatgccct
   ==========^                ^                  ^==========
   60202    57381     20    none      1      1
     Errors = 1
A: tttcaaagctgaaatgctcta
B: tttcaaagctaaaatgctcta
   ==========^==========
   60256    57435     20    none     34     34
     Errors = 4
A: acacaacaggatcattaatggcatggatacgcgtatagacataagcgatttcaa
B: acacaacagggtcattaagggcatggatgcgcgtatagacataggcgatttcaa
   ==========^       ^         ^              ^==========
   60286    57465     23    none     10     10
     Errors = 2
A: aaatattatgactcgctgcgccaatatgaa
B: aaatattatggctcgctgcaccaatatgaa
   ==========^        ^==========
   60310    57489     22    none      1      1
     Errors = 1
A: atttataattatcgccctcta
B: atttataattgtcgccctcta
   ==========^==========
   60340    57519     27    none      8      8
     Errors = 2
A: acaaaatccaacattttattgtaattag
B: acaaaatccagcattttgttgtaattag
   ==========^      ^==========
   60370    57549     20    none      3      3
     Errors = 2
A: gtcttgcttattggaaaatgtgg
B: gtcttgcttactagaaaatgtgg
   ==========^ ^==========
   60412    57591     44    none     22     22
     Errors = 5
A: gtaacgcccaatctttcacggaagcgatagtttcttcgctct
B: gtaacgcccagtctttcatagaagcgatcgtctcttcgctct
   ==========^       ^^        ^  ^==========
   60463    57642     62    none      7      7
     Errors = 2
A: ggattttaatgggcttcaaccctttta
B: ggattttaataggctttaaccctttta
   ==========^     ^==========
   60601    57780     20    none     76     76
     Errors = 11
A: cataagaatccggaatataggcttgcagcacaataccagcgttcaaatcaaatttagcga
B: cataagaatcagggatataagcttgcaacacaataccggcgttcaaatcaaatttggcga
   ==========^  ^     ^       ^         ^                 ^    
A: tggattccataaacgactccactgttagctctaaat
B: tagactccataaacgattccaccgtaagctctaaat
    ^  ^           ^     ^  ^==========
   60634    57813     23    none     13     13
     Errors = 2
A: ccctaaattcttccatatccaaattgatgaatt
B: ccctaaattcctccatatccaagttgatgaatt
   ==========^           ^==========
   60658    57837     20    none      1      1
     Errors = 1
A: gcatgccttgttttttttctt
B: gcatgccttgctttttttctt
   ==========^==========
   60699    57878     63    none     21     21
     Errors = 5
A: cttctaaagccagggcgtaaagagcgtctaggcgtttgaca
B: cttctaaagctaaagcataaagagcgtctaagcgtttgaca
   ==========^ ^^  ^             ^==========
   60763    57942     69    none      1      1
     Errors = 1
A: aaaaaatcgtcgtgattttaa
B: aaaaaatcgttgtgattttaa
   ==========^==========
   60835    58014     20    none      3      3
     Errors = 3
A: aaaacgcgcattagcttcttctt
B: aaaacgcgcagacgcttcttctt
   ==========^^^==========
   60892    58071     27    none     37     37
     Errors = 4
A: cgcctaaaacctcttcgccaataaaattcacattcaaaatgattttttcattttttc
B: cgcctaaaacttcctcgccaataaaattcacgttcaaaatgattttctcattttttc
   ==========^  ^                 ^              ^==========
   60925    58104     26    none      6      6
     Errors = 2
A: aatccgctcttttaactggctctctt
B: aatccgctctcttaattggctctctt
   ==========^    ^==========
   60952    58131     53    none      1      1
     Errors = 1
A: ccaagaccatcgctttcgtgt
B: ccaagaccattgctttcgtgt
   ==========^==========
   61006    58185     36    none      1      1
     Errors = 1
A: tcatatcagggagcattttcc
B: tcatatcaggcagcattttcc
   ==========^==========
   61056    58235     72    none     14     14
     Errors = 3
A: cattaaaagcactttttcaaacggagaaaaaatc
B: cattaaaagccatttttcaaacgaagaaaaaatc
   ==========^^           ^==========
   61135    58314     23    none      7      7
     Errors = 2
A: tattgtccaagcacctgaaactccgat
B: tattgtccaaacacctaaaactccgat
   ==========^     ^==========
   61177    58356     27    none     19     19
     Errors = 2
A: taagctctatgagcatgactttgttttcagggttgttta
B: taagctctataagcatgactttgttttcggggttgttta
   ==========^                 ^==========
   61225    58404     49    none     21     21
     Errors = 4
A: ttgcattttagagtggaacgctttttcctgatcgctcaaat
B: ttgcattttaaaatggaacgctttttcttgctcgctcaaat
   ==========^ ^              ^  ^==========
   61282    58461     43    none      8      8
     Errors = 3
A: gctaattctagcgaatcgtcaatgattt
B: gctaattctaatgaatcctcaatgattt
   ==========^^     ^==========
   61326    58505     73    none      1      1
     Errors = 1
A: taagaatttgacttgattgta
B: taagaatttggcttgattgta
   ==========^==========
   61407    58586    111    none      8      8
     Errors = 3
A: tttaaattttgttctagcggtaattaat
B: tttaaattttattccagtggtaattaat
   ==========^   ^  ^==========
   61532    58711     56    none     14     14
     Errors = 2
A: tttcgtttaataataaattataacattcgcatcg
B: tttcgtttaaaaataaattataatattcgcatcg
   ==========^            ^==========
   61603    58782     39    none     15     15
     Errors = 3
A: taaacggatttacaaaaaattttac-aaacaaagga
B: taaacggattgacaaaaa-ttttacaaaacaaagga
   ==========^       ^      ^==========
   61661    58840     20    none     19     19
     Errors = 3
A: aaaatggtatgatgattggcacactcggcgcgttgttat
B: aaaatggtattatgatcggcacactcggtgcgttgttat
   ==========^     ^           ^==========
   61682    58861     30    none      1      1
     Errors = 1
A: tgagcggttgctctagctttg
B: tgagcggttgttctagctttg
   ==========^==========
   61769    58948     32    none     57     57
     Errors = 9
A: tttcgcttgtattcctaaagaccattctctaaaagacgcttccacaaaaaaagaagtgca
B: tttcgcttgtctccctaaagaccattcttcaaaagacgcttctaccaaaaaagaagcgca
   ==========^ ^               ^^            ^  ^          ^   
A: atacacgcctaagggct
B: atacattcctaagggct
        ^^==========
   61811    58990     26    none     10     10
     Errors = 2
A: attcttctaatttaaaccactgggattcta
B: attcttctaacttaaaccattgggattcta
   ==========^        ^==========
   61863    59043     40    none     26     27
     Errors = 6
A: aggggtttattagatggggcaaaaaaagggaggg-ataataaagctc
B: aggggtttatgagagggggcgaaaaaaggggggggaaaataaagctc
   ==========^   ^     ^         ^   ^ ^==========
   61927    59108     42    none     24     25
     Errors = 7
A: acaataacaaccttttttaacattgatatgagat--aaaaggagat
B: acaataacaatcttttt-aacactgatataatataaaaaaggagat
   ==========^      ^    ^      ^ ^  ^^==========
   62019    59203     33    none     50     53
     Errors = 24
A: ttgtagaaaacatgaata--cagaaaatacgaatatttcaagaacgactgcttccac--c
B: ttgtagaaaatgcgaataatgagaaaata-gaa-aaaccaaatacttcaaatcccactgc
   ==========^^^     ^^^        ^   ^ ^^^   ^^  ^^ ^^^ ^    ^^ 
A: -ccccccccccccca
B: ttccaccccccccca
   ^^  ^==========
   62149    59342     29    none     97    106
     Errors = 26
A: tttaaaatctgttggagatcttacagatcgctttaaaaaattagaag-tc-caa-ttaga
B: tttaaaatctattacagatcttaaagatcgccttaaaaaattagaagatcttaaattaga
   ==========^  ^^        ^       ^               ^  ^^  ^     
A: agaccttgaaccccttatcaaaatctctcgttacatag-gat-cct--ttt-tt-agaaa
B: agactttgaaccccttagaaaactctctcattttatagttataggtaatttgtttggaaa
       ^            ^^   ^      ^  ^^    ^^  ^^^ ^^   ^  ^^====
A: atcctc
B: atcctc
   ======
Region:      56114 .. 62189          53289 .. 59382          322 / 6094        5.28%
#
   62502    59848     24    none      -      -
   62751    60103     34    none    225    231
   No extension
Region:      62502 .. 62525          59848 .. 59871            0 / 24          0.00%
   62847    60199     33    none     62     62
     Errors = 11
A: ttggaagtcagagggtgcttgaattttggattt-gtagcaacaactcatagcgcaatgga
B: ttggaagtcaaagatcgcttgaatttt-aattttgtagcaacaactcacagcgcaatgga
   ==========^  ^^^           ^^    ^              ^           
A: tttgatcgcatacgttcttagcg
B: cttgatcgcatctgttcttagcg
   ^          ^^==========
   62919    60271     61    none     39     39
     Errors = 5
A: tttagaaagcctttataacaaagcgagccaagaattaagcgataagaagagcgataaag
B: tttagaaagcttttataaccaagcgagccaagaattaggcgataagagaagcgataaag
   ==========^        ^                 ^         ^^==========
   62982    60334     39    none      2      2
     Errors = 2
A: attaaggataagaaatttgagc
B: attaaggatagtaaatttgagc
   ==========^^==========
   63033    60385     34    none     12     12
     Errors = 3
A: ttatgactatacatgcaaaagcctatacccag
B: ttatgactattcatgcaaaaagctatacccag
   ==========^         ^^==========
   63120    60466     25    none     53     47
     Errors = 20
A: caaaagatgcaaagggtggtcttaatcggctatacatacgacaaaaaaacaccaccatat
B: caaaagatgcgaagagtggttttaagaggctata-a-gc-acaatgata-a--aatgtat
   ==========^   ^     ^    ^^       ^ ^^ ^    ^^ ^ ^ ^^ ^^^   
A: tatactatcgtgg
B: cacactatcgtgg
   ^ ^==========
Region:      62751 .. 63144          60103 .. 60490           41 / 394        10.41%
#
   63559    60988     31    none      -      -
   63636    61065     22    none     46     46
     Errors = 8
A: caccaagttatcgcgctcactaaagagc-aggatagccttaaacaagagcgagcgcaatt
B: caccaagttaccgcgctcactaatgagcgag-atagtctcgaacaagagcgagcgcgatt
   ==========^            ^    ^  ^    ^  ^^               ^===
A: gcaagat
B: gcaagat
   =======
   63917    61382     22    none    259    295
   No extension
Region:      63559 .. 63657          60988 .. 61086            8 / 99          8.08%
   64073    61538     31    none    134    134
     Errors = 29
A: aagagaacatagcgctcaaagagagggcttatggcttgaaagagcaaccctc-aaa--ac
B: aagagaacatcgccctcaaagagagggttgatggcttgaacgagcagctctccaaattgc
   ==========^  ^             ^ ^          ^     ^ ^   ^   ^^^ 
A: aacca-aaa--ccataattaaaggagaaatatcatggtaacacccttaaaaagtttaaaa
B: aaccacaaaaaccacaat-aaagga-aa-tatcatggtaa-a--agaaaaaagtttagaa
        ^   ^^   ^   ^      ^  ^           ^ ^^^^^          ^  
A: ctgcctattggccacccgttagtagagattttgtgcgagc
B: ctgcctcttggccaccccttagtagagaaattgtgcgagc
         ^          ^          ^^==========
   64212    61677     25    none    108    108
     Errors = 20
A: aataaagccgtattcaatgaagaagctccgattaatttcaaaaaagaagtgtcagaagaa
B: aataaagccgcattcaatgaaaaaagtgagccgaatttcaaagatgaagtgtcagaagaa
   ==========^          ^  ^^ ^^ ^^^         ^ ^               
A: gagaaaatcaagttcaagcaagcgctaagagtgcttcatgcgattgtcaataatgaggct
B: gacaaaatcaaattcaaacaagcgctgcgggtgtttcatgcgatcgtcaataatgagact
     ^        ^     ^        ^^ ^   ^          ^            ^==
A: tctttaag
B: tctttaag
   ========
   64274    61739     29    none     37     37
     Errors = 6
A: tttctgatgacaatcaaaaattcatggagggtttagcgcaagctgacaagatcacta
B: tttctgatgaaaatcaaaaattcctagaggatttagcgcaagctaaaaagatcacta
   ==========^            ^ ^    ^             ^ ^==========
   64320    61785     26    none     17     17
     Errors = 3
A: tagaaaaaacattagaaatcgtttcttatagcgatgt
B: tagaaaaaaccttagagatcgtttctgatagcgatgt
   ==========^     ^         ^==========
   64380    61845     30    none     34     34
     Errors = 9
A: ggattttgaagcgtttaaagaaat-gatgctcaaagtggataacatagcggtagg
B: ggattttgaaaagcttaaa-aaattgatgctcaatgtggatagtgtagcggtagg
   ==========^^ ^     ^    ^         ^       ^^^==========
   64428    61893     20    none     18     18
     Errors = 2
A: tatagccaaagccaattgcttgatttgaacggagggca
B: tatagccaaaaccaattgcttgatttggacggagggca
   ==========^                ^==========
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     Errors = 5
A: ttgggatttagatgtgcctagcttgtctaaagaaag
B: ttgggatttataggcgcctagcgtgcctaaagaaag
   ==========^ ^ ^       ^  ^==========
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     Errors = 30
A: tgataatttacccaaagaagaaatcggcggagaagagatagaaaagaatttctatgcccg
B: tgataattta------gactctagcggc--a-aagaaat-g----ga-tttttatgcgcg
   ==========^^^^^^  ^^^^ ^    ^^ ^    ^  ^ ^^^^  ^   ^     ^  
A: ttcaagtttgaaagatgtaaacaagcagggtgttgtcgcta
B: ctcaagtttgaaggatttaaacaag--gg-cgttgtcgcta
   ^           ^   ^        ^^  ^^==========
   64646    62093     21    none     31     31
     Errors = 7
A: aaagcacgactgcagcttacatggataacaacggaaaataccgcttgctct
B: aaagcacgaccgcagcctatatggataagaacggggaataacgcttgctct
   ==========^     ^  ^        ^     ^^    ^==========
   64763    62210     30    none     96     96
     Errors = 29
A: tattggcggggatgtagatatagagagtttg-caaaaatatgaaaaccccacgatagtgg
B: tattggcgggctagtagatgacgcaagcctgacaaa-gtttgaaaaccctacgatcgtgg
   ==========^^^      ^^^ ^^  ^^  ^    ^^ ^         ^     ^    
A: agttcagatataaagaaaagtttcttaaagattacaacgctttaagccaccgccctt
B: agttcagacacataaaaaaatttattacagaatacaacgcactagatcaccgccctt
           ^ ^ ^ ^    ^   ^   ^   ^        ^^  ^^^==========
   64794    62241     23    none      1      1
     Errors = 1
A: gaacgatatacaagtggcgca
B: gaacgatatagaagtggcgca
   ==========^==========
   64863    62310     33    none     46     46
     Errors = 11
A: agcccaaaaggaac-tttcaagcgctcaaggtaatcatttttatcggtttttttctcaat
B: agcccaaaag-aacgctgcaatcgttaaagggaatgatttgtatcggtttttttctaaat
   ==========^   ^^ ^   ^  ^ ^    ^   ^    ^               ^===
A: tgaagca
B: tgaagca
   =======
   64915    62362     24    none     19     19
     Errors = 5
A: gatgaaaaacggaattttagggatctcatagaggatttt
B: gatgaaaaacagaattttagggatttagaagaggatttt
   ==========^             ^ ^^^==========
   64944    62391     34    none      5      5
     Errors = 2
A: tagaaagcttcactaattgcacgga
B: tagaaagctttactcattgcacgga
   ==========^   ^==========
   64995    62442     49    none     17     17
     Errors = 4
A: aaatctatgcatactgcatcggccgttgcatcaacaa
B: aaatctatgcttactgcatcagccgcagcatcaacaa
   ==========^         ^    ^^==========
   65045    62492     52    none      1      1
     Errors = 1
A: ttttatcctatcccatcaagt
B: ttttatcctaccccatcaagt
   ==========^==========
   65098    62545     22    none      1      1
     Errors = 1
A: agttttgaaaaaggcttgaaa
B: agttttgaaagaggcttgaaa
   ==========^==========
   65121    62568     33    none      1      1
     Errors = 1
A: atccttacccaggcatgtttt
B: atccttaccccggcatgtttt
   ==========^==========
   65173    62620     52    none     19     19
     Errors = 4
A: acggctaaaatgttcaaagtggaattaaaagcgagcgag
B: acggctaaaactttcaaagtggaattgagagcgagcgag
   ==========^^              ^ ^==========
   65253    62700     28    none     28     28
     Errors = 9
A: ctacgggtttgataaatttgcaaaattagacaagcccatttattacgg
B: ctacgggttttttaaatcagagaagttagacaagccggtttattacgg
   ==========^^     ^^ ^^  ^           ^^==========
   65285    62732     35    none      4      4
     Errors = 2
A: attttgggggcgggacgacggatt
B: attttgggggaggaacgacggatt
   ==========^  ^==========
   65339    62786     22    none     19     19
     Errors = 6
A: gggaaaaaagcgctaatcctaaattcgcttacaaaatga
B: gggaaaaaagagctagccccaaatttgcctacaaaatga
   ==========^    ^^  ^     ^  ^==========
   65375    62822     29    none     14     14
     Errors = 3
A: cattttagcaatggaggggataagtatttaggcg
B: cattttagcagcggaggggataaatatttaggcg
   ==========^^           ^==========
   65564    63011     20    none    160    160
     Errors = 23
A: tattggaattgttggcttgggaaatgtatgcccaaaatttccaagagctgaaagcaaaag
B: tattggaattattggcttgggaaacgtatgccaaaaatttccaaacgctaaaagaaaaag
   ==========^             ^       ^           ^^   ^    ^     
A: atgttgtcattgctaaacccaactatgacaggatcgatacgcaacgctttggatctttta
B: atattgtcatcgctaagcccaactatgacaggattgatacgcaactcttcggatcgttta
     ^       ^     ^                 ^          ^   ^     ^    
A: tgcaaaactccagagaagcacgcttgaatttgcaaacgattgcttctaacttgcgccctt
B: tgcaaaattccagtggagtgcgtttgaatttgcaaacgatcgcttctcaattgcgccctt
          ^     ^ ^  ^^  ^                 ^      ^ ^==========
   65600    63047     24    none     16     16
     Errors = 3
A: ttttagaaaaattagacgctaatatcatagaagcga
B: ttttagaaaatttagacgccaatattatagaagcga
   ==========^        ^     ^==========
   65780    63224     26    none    156    153
     Errors = 31
A: agaaaatgaagaatttgagatagaaggcttt-gaaaaggaatttaaagtcca-gctgttg
B: agaaaatgaaaactttgagata-aagggttttgaaaaggattttaaag-ccatgctgttt
   ==========^ ^         ^    ^   ^        ^       ^   ^      ^
A: gataggaatgggggagattcaccagtagaaga-cttcaaagtggattacaaagaactttt
B: gataggaacggggtaga--aac-agaatgcgatctt-aaagttgattgcaaagagctttt
           ^    ^   ^^^  ^  ^ ^^^  ^   ^     ^    ^      ^     
A: aaacctcttaaaagacaagatagatgacggcgttaaaaacttctttgcaggattttcta
B: aaacctcttaaaaggcaagatagaagatggcgttgccaacttctttgccggattttcta
                 ^         ^  ^      ^^^           ^==========
   65870    63314     23    none     64     64
     Errors = 12
A: tggctgaaaatattgataatcagtgtcgggcgtttcatattttcttagg-agggaatgcg
B: tggctgaaaacattgatgatcagtgtcgggcgtttcacattttcttaggcagg-aatgtg
   ==========^      ^                   ^           ^   ^    ^ 
A: agcaaatcggtgctggtcaaacaag
B: agccgttcggcgttagtcaaacaag
      ^^^    ^ ^ ^==========
   65955    63399     23    none     62     62
     Errors = 10
A: ttgaaaacgctaaagaagagcagctcaaagcttacaagcaaaagacttctaaagatgatt
B: ttgaaaacgccaaagaaaagcagctcaaagattaccatcaaaagacttctaaaaatgatt
   ==========^      ^            ^    ^ ^               ^      
A: tcacattcattctttatgagcc
B: ttaaattcatcatttatgagcc
    ^ ^      ^^==========
   65981    63425     26    none      3      3
     Errors = 3
A: aggcacagaagcctcagacaaac
B: aggcacagaaaaatcagacaaac
   ==========^^^==========
   66131    63575     20    none    124    124
     Errors = 23
A: tagagcttacaggagaagacgtttctaacaagcccgcttatttaaagcccacttgcaaaa
B: tagagcttacgggagaagacgtttctaacacgcccgcttatttgaagcccacttgcaaaa
   ==========^                   ^            ^                
A: ccggtgtggctttcggacttttagaaagcagacccaaagcaggcgggattgaaagaccct
B: ctggggtggcttttgggcttttagaaagcagggacaaggctcaagggattgaaatgccct
    ^  ^        ^  ^              ^^^   ^  ^^^^          ^^    
A: ctata-gattttaatcctgtgttta
B: ctataagct-ccaaccctgtgttta
        ^ ^ ^^^  ^==========
   66219    63663     39    none     68     68
     Errors = 12
A: aatacgatttgggtattgagagagaagggaaattccacactagaatcagtcgggattctt
B: aatacgatttaggcattgagatagaggggaaattccacgctaaaatccatagggattctt
   ==========^  ^       ^   ^            ^   ^    ^^ ^         
A: taaaacccaatgaataccagattttcca
B: taaagcctaatgaatactagattttcca
       ^  ^         ^==========
   66389    63833     29    none    131    131
     Errors = 24
A: ggctttgatgggttagagatacgctacagcgataaatctct-cgccaacaccaacacttt
B: ggctttgatgagttagagatacgatacagcgacaaagc-cttagccaacaccaacactct
   ==========^            ^        ^   ^ ^  ^^               ^ 
A: agacattgaagacacacaactgattttcatagcgttagaagagcatgaagaagtggatgt
B: ggacattaaagatacgcaaatgatttccatagcgctagaagaggttgaagaagtggaagt
   ^      ^    ^  ^   ^      ^       ^        ^^            ^  
A: gaaggtgtgcagtatagattcacaaagcatta
B: gaaggtgtgttgcgtggattcccaaagcatta
            ^^ ^^ ^     ^==========
   66445    63889     26    none     27     27
     Errors = 5
A: tgtttaaagataaccaattaatctatgaaagcgaggcagaaaaatta
B: tgtttaaagacggccaattgatctatgaaagcgaggtagaaaaatta
   ==========^^^      ^                ^==========
   66582    64026     22    none    111    111
     Errors = 15
A: ctaagaacgcgtatgcgtttgttgtgattgaagaaagcgttatggtgtttaaacgcacca
B: ctaagaacgcttatgcgtttgtcgtgattgaaaaaagtattatggtgtttaaatgcgcca
   ==========^           ^         ^    ^^              ^  ^   
A: aagatgaggggttaatgcctatctttgaaggctttgtgcctttaaaagagggctttttga
B: aagacaaggggctaatccctatcactgaaggctttgtgccgttaaaagagggctttttga
       ^^     ^    ^      ^^               ^                   
A: aaagttttaaa
B: gaagttttaaa
   ^==========
   66610    64054     36    none      6      6
     Errors = 2
A: gcgttgcaatttggaatttttagaaa
B: gcgttgcaatctggattttttagaaa
   ==========^    ^==========
   66812    64256     25    none    166    166
     Errors = 31
A: tttgtatgacaaacca-tccgcacacgagatcttttccttgtgcaaggagctgaaaaatt
B: tttgtatgacta-ccaatttccaagcgaggttttttcattgtgtaaggatttgaaaaatt
   ==========^ ^   ^ ^^^  ^^    ^ ^     ^     ^     ^^         
A: ccatctgggacaggaagcttgtggtagcgctagtggaggctttagaggggtttaaggatt
B: ccatttgggacagaaagcttgtggtagtgctagtggaggctttggagggttttaagggtt
       ^        ^             ^               ^     ^       ^  
A: ggaatttgtcgcttaaaatagaagacaagcgttctaacagcttgggtaatggcaccaaaa
B: tgaatttgtctcttaagatagaagataggcattctaatagcttgggtaatggcgttcaaa
   ^         ^     ^        ^ ^  ^      ^               ^^^^===
A: aattgct
B: aattgct
   =======
   66862    64306     44    none     25     25
     Errors = 6
A: acgctgatttagggagcgactataaaacaatcgtgatagacagca
B: acgctgatttggggagcaaccacaaaccaatcgtaatagacagca
   ==========^      ^  ^ ^   ^       ^==========
   66907    64351     62    none      1      1
     Errors = 1
A: aagaaaaatataaaagagaaa
B: aagaaaaatacaaaagagaaa
   ==========^==========
   66970    64414     34    none      1      1
     Errors = 1
A: atgggggtggaagcattagaa
B: atgggggtgggagcattagaa
   ==========^==========
   67007    64451    108    none      3      3
     Errors = 3
A: aagcctgattttgatgaagaaaa
B: aagcctgattccaatgaagaaaa
   ==========^^^==========
   67141    64585     25    none     26     26
     Errors = 7
A: gagttactaagagaggaagtgaacagcttgagtaatcatttccata
B: gagttactaaacgaggaagtgaatagcttgaatggccatttccata
   ==========^^           ^       ^ ^^^==========
   67167    64611     31    none      1      1
     Errors = 1
A: gaatcatggcgagacgctagg
B: gaatcatggcaagacgctagg
   ==========^==========
   67240    64684     90    none     42     42
     Errors = 6
A: tagcgaggtgctggataatttgaaaagcactttcaatgaatttgatgaagctgcgcaaga
B: tagcgaggtgttggataacttgaaaggcactttcaatgaatttaatgaggccgcgcaaga
   ==========^       ^      ^                 ^    ^  ^========
A: gc
B: gc
   ==
   67360    64804     22    none     30     30
     Errors = 5
A: ggaaaacggatacagaagaagtcaaagaggttgttaaaaaatgcagggaa
B: ggaaaacggacacagaagaagtcaaaaaggttgttggaagatgcagggaa
   ==========^               ^        ^^  ^==========
   67385    64829     76    none      3      3
     Errors = 2
A: taaaagatccttacaagaagaaa
B: taaaagatccctgcaagaagaaa
   ==========^ ^==========
   67671    65121     26    none    210    216
   No extension
Region:      63904 .. 67460          61369 .. 64904          417 / 3557       11.72%
   67775    65225     22    none     78     78
     Errors = 19
A: tgaaatctacgccactcaagccaaagcgagcgcggaacttgtagaggga-gcttggaaga
B: tgaaatctactcgaatcaagccaaagcgagcgcgaatcttat-gaatcaagcttgggagg
   ==========^ ^ ^                   ^ ^   ^ ^  ^^^ ^      ^  ^
A: gcgttaaaaagtcgttggacttttataccgataagcacc
B: gcattaaaaagaggttgcatttttatactgataagcacc
     ^        ^^    ^ ^        ^==========
   67957    65407     22    none    160    160
     Errors = 41
A: gaatttatcaaacgcttgaactatgcgagtgaagcgatagacaacgaatacaa-tatcgc
B: gaatttatcaggcgtttgaaacaagcgagcgatgcgatagataacgaatacaactttc-c
   ==========^^  ^     ^^ ^     ^  ^        ^           ^ ^  ^ 
A: gcccccagaaattttgaacg-agagcgattttgaaagccctacgat-tgtttataaccct
B: aactccaggcgtttt-attggaatacgattttgaacggcctgctatctctt-atacccct
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A: aaaaaaagcgtttatgatgaacacttgaaagatttgagggaagattttagcttttcttta
B: aaaaaaagcgtttttaatgagcgcttgaaggatttgagggaaaattttagcgcttcttta
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A: tac
B: tac
   ===
   68026    65488     20    none     47     59
     Errors = 25
A: tgatttgaaaaaca-ga---at--taacgc-ttcttctaagcta-gat--cgcac-ca-c
B: tgatttgaaagacaagatccatcataacgccttgt-ctaa-cgatgatttagaacgcatg
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B: atagcttttagagagcaagaa
    ^ ^  ^ ^ ^==========
   68254    65710     27    none    208    202
     Errors = 53
A: tttgaaaagaatttagaggatttgatgccaggctttagaggtggaactgacactttgtct
B: tttgaaaagagtttagaggattggatg---gg-tgcata-ttctta-tgatgaaaaccct
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B: aacgatgaattagatcgcatggcaatatctaaagagcaggagttggaaaagagtttagag
   ^^            ^ ^        ^^ ^  ^  ^   ^  ^  ^       ^       
A: gatttgatgccgagttctttaggcgtgcattcttatgatgagagcttgaatttagccaaa
B: gatttgatgccaagcgttttaggcgtgccttcttataacgaaagcttgactttagccaaa
              ^  ^^^           ^       ^ ^  ^       ^          
A: aagaattgcgttaaaaattgtaagaaagctttaggagattttacagaa
B: aatcgttgcgttaaaaactttaaggaagctttagaaggttttacagaa
     ^^^            ^ ^    ^         ^  ^==========
   68336    65792     20    none     55     55
     Errors = 10
A: aagaatcccccaacgatttgaacgctataaacgaagcttttaatcatttggaaacagagt
B: aagaatcccctaacgattcaaacgctatcaatgaagcctttgataatttagaaacagagt
   ==========^       ^^        ^  ^     ^   ^  ^    ^          
A: tagaacgcgctacag
B: tagagcgcgctacag
       ^==========
   68519    65975     29    none    163    163
     Errors = 35
A: aaaatttgagccaaaaaatagcgcctattttagagcggtatgaaaatgataagcggcaaa
B: aaaatttgagtcaaaaaatcgatcccgttttagaacggaatgaaaattata--cg-caaa
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A: aa---ttgg-gttatggcgagtttttagaaa-aagaaaaagagggctttatggtagatga
B: aagcgttggagt-atagggagtttttagaaagccgtaaa-gagagctttattgtagatga
     ^^^    ^  ^  ^ ^             ^^^ ^   ^   ^       ^        
A: gcaaaacccttatccggaagaagtccgctttaatgagttgcgtttagcggaatttgagag
B: aaaaaacccctatccggaagaagtcagctttaatgaatggcgttgggcggaatttgatag
   ^^       ^               ^          ^ ^     ^^           ^==
A: cgttttta
B: cgttttta
   ========
   68564    66020     30    none     16     16
     Errors = 4
A: tgcctttagaggatttagataaacctgcatgcgctc
B: tgcctttagaagatttaaataaaaccgcatgcgctc
   ==========^      ^     ^ ^==========
   68615    66071     23    none     21     21
     Errors = 6
A: aaaggctttagaagccacgcttaaaaatagggatttgggct
B: aaaggctttacaagctacgcttaaagacaacgatttgggct
   ==========^    ^         ^ ^ ^^==========
   68639    66095     20    none      1      1
     Errors = 1
A: atgcgacagaattggaacaga
B: atgcgacagagttggaacaga
   ==========^==========
   68671    66127     40    none     12     12
     Errors = 3
A: tcgcaaaaggtttcattcctaaggggtatttg
B: tcgcaaaaggattcatccctagggggtatttg
   ==========^     ^    ^==========
   68718    66174     46    none      7      7
     Errors = 3
A: tttagggaatgtggcgttggtgagaga
B: tttagggaatttagcgctggtgagaga
   ==========^ ^   ^==========
   68798    66254     20    none     34     34
     Errors = 10
A: cgaaaggatacttactatggaaacaattcctgcaaactcagaactgaattggga
B: cgaaaggatattcactatggacagaatttctacagaaacagaattgaattggga
   ==========^ ^        ^ ^    ^  ^  ^ ^^     ^==========
   68861    66317     32    none     43     43
     Errors = 7
A: atttgtagagccgctcaatgaaaaggcgttgagcgggttagaagagcggttgaaaatagg
B: atttgtagagtcgctcaatgaaaatgcgttgagcgatctagaagagcgattggaaatagg
   ==========^             ^          ^^^          ^   ^=======
A: ctt
B: ctt
   ===
   68894    66350     30    none      1      1
     Errors = 1
A: taaggactttgtcaaacgatc
B: taaggactttatcaaacgatc
   ==========^==========
   69016    66472     30    none     92     92
     Errors = 13
A: tttagccaatggcgttcttttgtggtgggcaataagtcttacacgttcaaacatgttttg
B: tttagccaattgcgttatttcatggtgggcaatgagtcttacatgttcaaacatgttttg
   ==========^     ^   ^^           ^         ^                
A: aacttcaatttagagggcttatttattgattttatgcagagtttaaaagaat
B: aatttcaatttagagagcttgttgattgatttcatgcaaagcttaaaagaat
     ^            ^    ^  ^        ^     ^  ^==========
   69049    66505     34    none      3      3
     Errors = 2
A: tgaagaaatcatcttcgctaatg
B: tgaagaaatcgtattcgctaatg
   ==========^ ^==========
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     Errors = 5
A: tattatcttttgaatacggctaccgatgtggtgc
B: tattatctttggaataccaccactgatgtggtgc
   ==========^      ^^ ^  ^==========
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     Errors = 12
A: ttttagacactgatgatggctcaaaacatgcgctgttgcaccttaaaatgtttttgaaaa
B: ttttagacaccgataatggttcaaaaaaagtgctattaaatcttaatatgtttttaaaaa
   ==========^   ^    ^      ^ ^ ^   ^  ^^ ^     ^        ^====
A: aactgg
B: aactgg
   ======
   69315    66774     37    none    119    122
     Errors = 24
A: ttaaaatgtt-tt--ctcatgaagtttatttggagggttgcacccttgaattaagaaaga
B: ttaaaatgttgttttctcataaagtttttttggagggttgcaccaatgagttaagaagga
   ==========^  ^^     ^      ^                ^^   ^       ^  
A: tttgcgatgattttgaaaaaaatgccatgcaagatgatttagggcagaaactcaggagtg
B: tttgcgactctttcgtagaaggggccatgcaagatgatttggggcagaaactcaaaagtg
          ^^^   ^ ^ ^  ^^^                 ^             ^^    
A: atgtgctagaggacatgctaaa
B: aggcgctagagaacatgctaaa
    ^ ^       ^==========
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     Errors = 28
A: aaaatttagaagatgacacccaataccaaa-gaagaataattgacgagcaaattgaagaa
B: aaaatttagagcaggaaactcaatacgaaatga-gaaaaatcaacgagcaacttgaagaa
   ==========^^ ^  ^  ^      ^   ^  ^   ^   ^^        ^        
A: gccaaatctttgatgaggcaaattgatatg-aatttc-c-a-tccatcaagcgagatc
B: gccaagcgtttggagaagcaagttgatatgcaagatcgccactc-acaaagcgagatc
        ^^^    ^^  ^    ^        ^  ^^  ^ ^ ^  ^ ^^==========
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     Errors = 27
A: agagaagctagtaaaagatatgatgagtatcttaaatctaaggataaaaatgattga--t
B: agagaagctaagaggcgctatggtgaatatcttaa------ggataaaaatgattgaaat
   ==========^^ ^^^ ^    ^   ^        ^^^^^^                ^^ 
A: --gtgaatggtttattaaaagaactggatgatgccttag
B: aagcgaatggtt--gcaaaa-a-ctagacgatgccttag
   ^^ ^        ^^^^    ^ ^  ^  ^==========
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     Errors = 1
A: agccgatcatctcaccaatag
B: agccgatcatttcaccaatag
   ==========^==========
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     Errors = 3
A: cagacgcgccaaagttcaatgaagagggcgcttacccacaatttttaa
B: cagacgcgccgaagttcaatgaagagggtgcttaccctcaatttttaa
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     Errors = 9
A: tggtttattggaaattaaaggcaagaatggcgctagcatggaattttgcttgcctaaag
B: tggtttattgcaagttaggggcaaaaatggtgctaacatggaatttttattgcctaaag
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Region:      67671 .. 69853          65121 .. 67309          342 / 2189       15.62%
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