### - p -

- PairMultifindSeq1() : Multilign_object
- PairSeq1() : Multilign_object
- PartitionFunction() : RNA
- PartitionFunctionBimolecular() : HybridRNA
- predict_ncRNA_probabilities() : Multifind_object
- PredictProbablePairs() : RNA
- PrepInput() : Multilign_object
- PrepMultifindInput() : Multilign_object
- ProbKnot() : RNA
- ProbKnotFromSample() : RNA
- ProgressiveMultilign() : Multilign_object