

set -ex



sqt2pin -o testsqt.txt $PREFIX/testdata/target.sqt $PREFIX/testdata/target.sqt
tandem2pin -o testtandem.txt $PREFIX/testdata/target.t.xml $PREFIX/testdata/target.t.xml
msgf2pin -o testmzid.txt $PREFIX/testdata/target.mzid $PREFIX/testdata/target.mzid
percolator -X test.xml $PREFIX/testdata/percolatorTab
exit 0
