fimo
fimo --parse-genomic-coord --verbosity 1 --oc xstreme_example_output_files/fimo_out_6 --bgfile xstreme_example_output_files/background --motif 4-CACTTCCTGKT xstreme_example_output_files/streme_out/streme.xml nrmix.nseqs.100.100bp.seed.1.fa
xstreme_example_output_files/streme_out/streme.xml
nrmix.nseqs.100.100bp.seed.1.fa
0.0001
AACTTCCTGGC
0.0777
GACTTCCTCCT
0.226
CACTTCCGCCT
0.232
CACTTCCTCCC
0.204
GACTTCCGGTG
0.123
CACTTCCTCTC
0.0797
CACATCCTGGG
0.203
CACTTCCTGTC
0.0282
GACTTCCTGTC
0.0572
AACTTACTGAT
0.206
AACTTCCTGTT
0.0299
GACTTCCTCTC
0.141
GACTTCCTGCT
0.111
GACTTCCGGGT
0.102
CACTTCCGCAC
0.212
CACTTCCTGGG
0.0445
CACTTCCGCCT
0.232
CACATCCTGTT
0.0997
CACTTCCTCTT
0.046
CACTTCCTGTG
0.0299
GACTTCCGGCT
0.197
GACATCCTGTG
0.238
CACTTCCTGGA
0.0387
AACTTCCTGGT
0.0445
AACTTCCTCTT
0.0797
CACTTCCTGTT
0.0282
GACTTCCTGTT
0.0334
CACTTCCTGTG
0.0299
CACTTCCTGGG
0.0445
CACTTCCTACT
0.125
CACTTCCGGTT
0.0362
GACTTCCTCCT
0.226
CACTTCCTGCC
0.0874
CACTTCCGCTC
0.146
CACTTCCTGGT
0.0282
GACTTCCTCAT
0.143
GACTTCCTGAA
0.0874
TACTTCCTGTT
0.0314
TACTTCCTGAC
0.0874
GACTTCCTATT
0.0797
CACTTCCTCTT
0.046
CACTTCCGGGT
0.0533
CACTTCCTGTC
0.0282
CACTTCCTGTC
0.0282
CACTTCCTGGT
0.0282
CACTTCCTGGT
0.0282
AACTTCCTGGG
0.0777
TACTTCCGGTA
0.106
CACTTCCTCCT
0.143
GACTTCCTCCT
0.226
TACTTCCGGGA
0.141
CACTTCCGGGG
0.0874
CACTTCCGCGG
0.203
CACTTCCGCAC
0.212
CACTTCCTAGT
0.0543
CACTTCCTGTC
0.0282
CACTTCCTAGA
0.0826
AACTTCCGGAG
0.159
CACTTCCTAGC
0.0874
GACTTCCGGAA
0.161
CACTTCCTCAA
0.122
AACTTCCTCTT
0.0797
CACTTCCTACC
0.178
AACTTCCGGGT
0.0874
CACTTACTGAC
0.203
CACTTCCTGTA
0.0282
CACTTCCGCTG
0.154
CACTTCCTGAA
0.0445
AACTTCCTCGG
0.174
CACTTCCGCTA
0.141
AACTTCCGCTT
0.154
GACTTCCTGGG
0.0826
TACTTCCTGGA
0.0777
CACTTCCTGGG
0.0445
AACTTCCTGAT
0.0503
TACTTCCTAAC
0.178
TACTTCCTGGA
0.0777
CACATCCTGTT
0.0997
CACATCCTAAT
0.252
CACTTCCTCAC
0.127
CACTTCCGGGT
0.0533
CACTTACTATT
0.178
CACTTCCTGAA
0.0445
TACTTCCTGAT
0.0592
CACTTCCCCTT
0.252
CACTTCCGGGT
0.0533
CACTTCCTCTA
0.0777
CACTTACTGAT
0.141
CACTTCCCGTT
0.135
CACTTCCTCAT
0.0797
AACTTCCTGTC
0.0503
CACTTCCCCTT
0.252
CACTTCCGGGA
0.0797
TACTTCCGGCT
0.195
CACTTCCTGGT
0.0282
CACTTCCGCTC
0.146
CACTTCCGCGC
0.195
AACTTCCTGTT
0.0299
CACTTACTGGC
0.178
CACTTCCTGTC
0.0282
CACTTCCGCTA
0.141
CACTTCCTATA
0.063
GACTTCCTCAT
0.143
CACTTCCTAAA
0.0987
GACTTCCGGGG
0.155
CACTTCCTGCC
0.0874
CACTTCCTCTT
0.046
CACTTCCTCCC
0.204
AACTTCCGGCT
0.178
AACATCCTGTT
0.155
AACTTCCTGAC
0.0797
CACTTCCTCTA
0.0777
AACTTCCTGAT
0.0503
AACTTCCTGAT
0.0503
TACATCCTGAT
0.232
CACTTCCGGTC
0.0641
CACTTCCTGTG
0.0299
CACTTCCTGCC
0.0874
AACTTCCTCTC
0.129
AACTTCCTGAT
0.0503
AACTTCCTGAC
0.0797
GACTTCCTGCC
0.16
CACTTCCTGTG
0.0299
CACTTCCTCTT
0.046
GACTTCCTGTG
0.063
CACATCCTGCT
0.232
GACTTCCGGTT
0.0777
GACTTCCGGAT
0.122
CACTTCCTGTG
0.0299
CACTTCCTGTT
0.0282
AACTTCCTCTT
0.0797
AACATCCTGGA
0.252
CACTTCCTGAA
0.0445
CACTTCCTCCG
0.208
CACTTCCGGAC
0.0989
CACTTCCGGGT
0.0533
TACTTCCTGGC
0.0797
CACTTCCGCTC
0.146
CACTTCCTCTG
0.0797
TACTTCCTCCT
0.226
CACTTCCGGAG
0.104
CACTTCCTAGT
0.0543
TACTTCCGGGA
0.141
CACTTCCCCTT
0.252
yes