#!/bin/bash

mkdir -p $PREFIX/bin

cd $SRC_DIR/src/

make

cd $SRC_DIR/bin/
cp addTaxonNames $PREFIX/bin
cp convertNR $PREFIX/bin
cp gbk2faa.pl $PREFIX/bin
cp kaiju $PREFIX/bin
cp kaiju2krona $PREFIX/bin
cp kaijup $PREFIX/bin
cp kaijuReport $PREFIX/bin
cp kaijux $PREFIX/bin
cp makeDB.sh $PREFIX/bin
cp mergeOutputs $PREFIX/bin
cp mkbwt $PREFIX/bin
cp mkfmi $PREFIX/bin

